菠蘿蜜EST-SSR標(biāo)記發(fā)掘利用及遺傳圖譜構(gòu)建
發(fā)布時(shí)間:2021-11-20 23:00
鑒于目前可用于菠蘿蜜遺傳研究的分子標(biāo)記數(shù)量少,遺傳圖譜構(gòu)建研究進(jìn)度慢,為了提高菠蘿蜜分子標(biāo)記輔助育種效率,促進(jìn)菠蘿蜜遺傳改良,本研究通過菠蘿蜜EST-SSR標(biāo)記的穩(wěn)定性和多態(tài)性揭示能力分析,嘗試將其用于菠蘿蜜種質(zhì)資源遺傳多樣性和遺傳圖譜構(gòu)建研究。主要研究結(jié)果如下:(1)本研究共設(shè)計(jì)出479對(duì)EST-SSR引物,其中399對(duì)在菠蘿蜜隨機(jī)選取的8份種質(zhì)的葉片DNA上能有效擴(kuò)增,282對(duì)具有多態(tài)性,多態(tài)性擴(kuò)增引物占58.87%。(2)從中選擇60對(duì)能夠清晰擴(kuò)增的多態(tài)性引物,分析了64份菠蘿蜜種質(zhì)資源的遺傳多樣性。這60對(duì)EST-SSR引物共擴(kuò)增出188條帶,不同引物的擴(kuò)增條帶數(shù)在211之間,平均為3.13條;其中有168條為多態(tài)性條帶,多態(tài)性率為89.36%;每對(duì)引物的多態(tài)性信息含量(PIC)范圍為0.40770.9589,平均PIC值為0.7922。證實(shí)了EST-SSR標(biāo)記多態(tài)性揭示能力較強(qiáng)。(3)由UPGMA聚類分析可知,在遺傳相似系數(shù)0.6881處,可將64份菠蘿蜜種質(zhì)資源分成2大類群;在遺傳相似系數(shù)0.7325處,第二大類群雖又可分成4個(gè)亞...
【文章來源】:廣東海洋大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:41 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 菠蘿蜜簡(jiǎn)介
1.2 菠蘿蜜種質(zhì)資源遺傳多樣性研究現(xiàn)狀
1.3 ESR-SSR標(biāo)記開發(fā)與應(yīng)用
1.3.1 EST-SSR標(biāo)記概述
1.3.2 EST-SSR標(biāo)記的開發(fā)
1.3.3 EST-SSR標(biāo)記在遺傳多樣性和遺傳連鎖作圖中的應(yīng)用
1.4 多年生木本植物遺傳連鎖圖譜構(gòu)建現(xiàn)狀與原理
1.4.1 多年生木本植物的遺傳連鎖圖譜構(gòu)建現(xiàn)狀
1.4.2 多年生木本植物的遺傳連鎖圖譜構(gòu)建原理
1.5 研究目的與意義
2 菠蘿蜜種質(zhì)資源遺傳多樣性分析
2.1 材料與方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 基因組總DNA提取
2.1.3 DNA純度與濃度檢測(cè)
2.1.4 EST-SSR引物設(shè)計(jì)
2.1.5 EST-SSR標(biāo)記篩選與SSR序列分析
2.1.6 遺傳多樣性分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 菠蘿蜜EST-SSR引物的篩選
2.2.2 菠蘿蜜種質(zhì)遺傳多樣性分析
2.2.3 菠蘿蜜種質(zhì)的聚類分析
2.3 討論
3 菠蘿蜜遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.1 材料與方法
3.1.1 遺傳連鎖作圖群體構(gòu)建
3.1.2 DNA的提取與檢測(cè)
3.1.3 EST-SSR基因分型
3.1.4 連鎖遺傳圖譜構(gòu)建
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 DNA提取結(jié)果
3.2.2 多態(tài)性引物篩選
3.2.3 基因分型與偏分離檢測(cè)
3.2.4 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
3.3 討論
4 結(jié)論
4.1 EST-SSR標(biāo)記在菠蘿蜜種質(zhì)遺傳多樣性分析中的作用
4.2 EST-SSR標(biāo)記在菠蘿蜜遺傳連鎖圖譜上的分布
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于EST-SSR標(biāo)記的胡椒栽培種質(zhì)遺傳多樣性研究[J]. 伍寶朵,胡麗松,范睿,鄔華松,郝朝運(yùn). 中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè). 2016(01)
[2]菠蘿蜜果實(shí)成熟過程中香氣成分組成及變化規(guī)律研究[J]. 賀書珍,張彥軍,徐飛,朱科學(xué),譚樂和,吳剛,付莉莉. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2015(09)
[3]菠蘿蜜種質(zhì)資源遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 吳剛,胡麗松,黃麗芳,郝朝運(yùn),譚樂和. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2015(08)
[4]不同株系菠蘿蜜染色體倍性及基因組大小分析[J]. 楊轉(zhuǎn)英,吳傳龍,豐鋒,呂慶芳,王俊寧,葉春海. 果樹學(xué)報(bào). 2015(04)
[5]松屬EST-SSR引物開發(fā)及馬尾松-濕地松種間特異性鑒別引物篩選[J]. 賈婕,馮源恒,楊章旗,黃永利. 分子植物育種. 2014(05)
[6]高效液相色譜法測(cè)定菠蘿蜜果實(shí)中的葡萄糖、果糖和蔗糖[J]. 李映志,劉勝輝,朱祝英,楊玉梅. 食品科學(xué). 2014(12)
[7]小麥穗部組織EST-SSR標(biāo)記引物開發(fā)及其在小麥遺傳多樣性分析中的應(yīng)用[J]. 劉澤濤,苑少華,楊迪,王玉昆,張立平,趙昌平,劉麗華,李宏博,龐斌雙. 麥類作物學(xué)報(bào). 2013(06)
[8]菠蘿蜜果實(shí)糖苷酶和多聚半乳糖醛酸酶的活性變化[J]. 董黎梨,汪永保,李映志,李洪波,張佳琦,葉春海. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(06)
[9]頂空固相微萃取和氣相色譜-質(zhì)譜法測(cè)定菠蘿蜜果肉中的香氣成分[J]. 李洪波,劉勝輝,李映志,毛琪,葉春海. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2013(04)
[10]棉花EST-SSR新標(biāo)記特征及其遺傳多樣性分析[J]. 梁維維,張大偉,陳全家,曲延英,高文偉. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(02)
博士論文
[1]小麥高密度遺傳圖譜的構(gòu)建和產(chǎn)量相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 高明剛.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]越橘EST-SSR分子標(biāo)記的開發(fā)及遺傳多樣性分析[D]. 郭瑞雪.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]菠蘿蜜SSR分子標(biāo)記的開發(fā)及其在種質(zhì)資源遺傳多樣性分析中的應(yīng)用[D]. 王艷紅.廣東海洋大學(xué) 2010
本文編號(hào):3508253
【文章來源】:廣東海洋大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:41 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 菠蘿蜜簡(jiǎn)介
1.2 菠蘿蜜種質(zhì)資源遺傳多樣性研究現(xiàn)狀
1.3 ESR-SSR標(biāo)記開發(fā)與應(yīng)用
1.3.1 EST-SSR標(biāo)記概述
1.3.2 EST-SSR標(biāo)記的開發(fā)
1.3.3 EST-SSR標(biāo)記在遺傳多樣性和遺傳連鎖作圖中的應(yīng)用
1.4 多年生木本植物遺傳連鎖圖譜構(gòu)建現(xiàn)狀與原理
1.4.1 多年生木本植物的遺傳連鎖圖譜構(gòu)建現(xiàn)狀
1.4.2 多年生木本植物的遺傳連鎖圖譜構(gòu)建原理
1.5 研究目的與意義
2 菠蘿蜜種質(zhì)資源遺傳多樣性分析
2.1 材料與方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 基因組總DNA提取
2.1.3 DNA純度與濃度檢測(cè)
2.1.4 EST-SSR引物設(shè)計(jì)
2.1.5 EST-SSR標(biāo)記篩選與SSR序列分析
2.1.6 遺傳多樣性分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 菠蘿蜜EST-SSR引物的篩選
2.2.2 菠蘿蜜種質(zhì)遺傳多樣性分析
2.2.3 菠蘿蜜種質(zhì)的聚類分析
2.3 討論
3 菠蘿蜜遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.1 材料與方法
3.1.1 遺傳連鎖作圖群體構(gòu)建
3.1.2 DNA的提取與檢測(cè)
3.1.3 EST-SSR基因分型
3.1.4 連鎖遺傳圖譜構(gòu)建
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 DNA提取結(jié)果
3.2.2 多態(tài)性引物篩選
3.2.3 基因分型與偏分離檢測(cè)
3.2.4 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
3.3 討論
4 結(jié)論
4.1 EST-SSR標(biāo)記在菠蘿蜜種質(zhì)遺傳多樣性分析中的作用
4.2 EST-SSR標(biāo)記在菠蘿蜜遺傳連鎖圖譜上的分布
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于EST-SSR標(biāo)記的胡椒栽培種質(zhì)遺傳多樣性研究[J]. 伍寶朵,胡麗松,范睿,鄔華松,郝朝運(yùn). 中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè). 2016(01)
[2]菠蘿蜜果實(shí)成熟過程中香氣成分組成及變化規(guī)律研究[J]. 賀書珍,張彥軍,徐飛,朱科學(xué),譚樂和,吳剛,付莉莉. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2015(09)
[3]菠蘿蜜種質(zhì)資源遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 吳剛,胡麗松,黃麗芳,郝朝運(yùn),譚樂和. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2015(08)
[4]不同株系菠蘿蜜染色體倍性及基因組大小分析[J]. 楊轉(zhuǎn)英,吳傳龍,豐鋒,呂慶芳,王俊寧,葉春海. 果樹學(xué)報(bào). 2015(04)
[5]松屬EST-SSR引物開發(fā)及馬尾松-濕地松種間特異性鑒別引物篩選[J]. 賈婕,馮源恒,楊章旗,黃永利. 分子植物育種. 2014(05)
[6]高效液相色譜法測(cè)定菠蘿蜜果實(shí)中的葡萄糖、果糖和蔗糖[J]. 李映志,劉勝輝,朱祝英,楊玉梅. 食品科學(xué). 2014(12)
[7]小麥穗部組織EST-SSR標(biāo)記引物開發(fā)及其在小麥遺傳多樣性分析中的應(yīng)用[J]. 劉澤濤,苑少華,楊迪,王玉昆,張立平,趙昌平,劉麗華,李宏博,龐斌雙. 麥類作物學(xué)報(bào). 2013(06)
[8]菠蘿蜜果實(shí)糖苷酶和多聚半乳糖醛酸酶的活性變化[J]. 董黎梨,汪永保,李映志,李洪波,張佳琦,葉春海. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(06)
[9]頂空固相微萃取和氣相色譜-質(zhì)譜法測(cè)定菠蘿蜜果肉中的香氣成分[J]. 李洪波,劉勝輝,李映志,毛琪,葉春海. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2013(04)
[10]棉花EST-SSR新標(biāo)記特征及其遺傳多樣性分析[J]. 梁維維,張大偉,陳全家,曲延英,高文偉. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(02)
博士論文
[1]小麥高密度遺傳圖譜的構(gòu)建和產(chǎn)量相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 高明剛.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]越橘EST-SSR分子標(biāo)記的開發(fā)及遺傳多樣性分析[D]. 郭瑞雪.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]菠蘿蜜SSR分子標(biāo)記的開發(fā)及其在種質(zhì)資源遺傳多樣性分析中的應(yīng)用[D]. 王艷紅.廣東海洋大學(xué) 2010
本文編號(hào):3508253
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/yylw/3508253.html
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