香蕉響應(yīng)鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)組分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-25 19:41
香蕉是我國(guó)具有國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)力優(yōu)勢(shì)農(nóng)產(chǎn)品之一,但它屬于鹽敏感植物。生產(chǎn)上,我國(guó)香蕉種植最適宜區(qū)海南、廣東湛江等地區(qū),隨著土地鹽堿化日益嚴(yán)重,阻礙香蕉產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展。而有關(guān)轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組研究香蕉響應(yīng)鹽脅迫未見(jiàn)報(bào)道,本實(shí)驗(yàn)采用RNA-Seq技術(shù)和iTRAQ技術(shù)研究我國(guó)主栽品種巴西蕉(Musa paradisiaca),在60 mmol/LNaCl人工模擬鹽脅迫0、12、24h根和葉片轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組分析,有望揭示香蕉應(yīng)答鹽害逆境的分子生物學(xué)調(diào)控機(jī)制,為香蕉分子育種打下基礎(chǔ)。研究結(jié)果如下:1、巴西蕉根和葉不同組織在響應(yīng)鹽脅迫過(guò)程中存在著差異。鹽脅迫處理12 h根的差異基因有542個(gè)上調(diào)、924個(gè)下調(diào);葉片的差異基因有2938個(gè)上調(diào)、2727個(gè)下調(diào);鹽脅迫處理24 h根的差異基因有507個(gè)上調(diào)、1582個(gè)下調(diào);葉片差異基因有834個(gè)上調(diào)、893個(gè)下調(diào);鹽脅迫12h/24h根差異基因242個(gè)上調(diào)、1116個(gè)下調(diào);葉差異基因有2014上調(diào)、2753個(gè)下調(diào)。從整體上分析,葉片差異基因數(shù)量比根多且多數(shù)上調(diào),而根正好相反;葉片在12h差異基因數(shù)量比24h多,但根24h的差異基因數(shù)量比12 h多并且多數(shù)下調(diào)。...
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1根(A)和葉(B)樣品間的差異基因統(tǒng)計(jì)??
activity)所占比例取局],禹子載體活性(electron?carrier?activity)、分子車(chē)f導(dǎo)活性??(molcculartransduceractivity)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性(signaltransduceractivity)所占的比??例取低;葉片僅在離子載體活性(electron?carrier?activity)的比例最低(圖2)。??12??
?香蕉響應(yīng)鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)組分析???比例最高,根部在分子傳導(dǎo)活性(molecular?transducer?activity)比例最低,葉片在轉(zhuǎn)??錄因子活性,結(jié)合蛋白(transcription?factor?activity,protein?binding)比例最低(圖?3)。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)鹽脅迫下香蕉幼苗CaM和Ca2+-ATPase基因的相對(duì)表達(dá)量[J]. 王文昌,周雙云,喬飛,吉福桑,李元元,李新國(guó). 分子植物育種. 2017(05)
[2]南方型紫花苜蓿苗期葉片鹽脅迫差異蛋白分析[J]. 裴翠明,張振亞,馬進(jìn). 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(11)
[3]南方型紫花苜蓿葉片響應(yīng)鹽脅迫蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析[J]. 馬進(jìn),鄭鋼,裴翠明,張振亞. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(09)
[4]基于轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組關(guān)聯(lián)研究技術(shù)篩選紫花苜蓿耐鹽相關(guān)候選基因[J]. 張振亞,裴翠明,馬進(jìn). 植物生理學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]基于iTRAQ質(zhì)譜分析技術(shù)篩選南方型紫花苜蓿根部響應(yīng)鹽脅迫差異表達(dá)蛋白[J]. 馬進(jìn),鄭鋼,裴翠明,張振亞. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(04)
[6]基于RNA-Seq技術(shù)的鹽脅迫向日葵轉(zhuǎn)錄組信息分析[J]. 孫瑞芬,張艷芳,郭樹(shù)春,于海峰,李素萍,聶惠,喬慧蕾,安玉麟. 分子植物育種. 2015(12)
[7]南方型紫花苜蓿葉片鹽脅迫應(yīng)答基因鑒定與分析[J]. 馬進(jìn),鄭鋼. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(12)
[8]燕麥鹽脅迫響應(yīng)基因的差異表達(dá)與生理響應(yīng)的關(guān)系[J]. 高彩婷,劉景輝,徐壽軍,張玉芹,于華榮. 西北植物學(xué)報(bào). 2015(07)
[9]花生中脅迫相關(guān)基因AhDHN1的克隆及非生物脅迫下表達(dá)分析[J]. 陳娜,胡冬青,潘麗娟,遲曉元,陳明娜,王通,王冕,楊珍,禹山林. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(12)
[10]鹽脅迫下兩個(gè)甜瓜品種轉(zhuǎn)錄因子的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 陳嘉貝,張芙蓉,黃丹楓,張利達(dá),張屹東. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(02)
博士論文
[1]白榆耐鹽生理生態(tài)機(jī)制研究[D]. 劉炳響.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]紫花苜蓿響應(yīng)鹽脅迫的蛋白質(zhì)組研究[D]. 熊軍波.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[3]小麥耐鹽漸滲系山融3號(hào)根系鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組分析及相關(guān)基因功能研究[D]. 李朔.山東大學(xué) 2009
碩士論文
[1]紫花苜蓿耐鹽生理特性及轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 江超.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]2種不同基因組類(lèi)型香蕉耐鹽生理響應(yīng)及其鹽脅迫下Ca2+的動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)[D]. 周雙云.海南大學(xué) 2014
[3]棉花苗期葉片鹽脅迫差異蛋白質(zhì)分析[D]. 許菲菲.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[4]鹽脅迫下兩個(gè)甜瓜品種的轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 陳嘉貝.上海交通大學(xué) 2014
[5]基于RNA-Seq技術(shù)的國(guó)產(chǎn)沉香轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及數(shù)字基因表達(dá)譜分析[D]. 吳宏清.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]不同鹽堿脅迫條件下玉米根部基因的差異表達(dá)譜分析[D]. 曲昕寧.吉林大學(xué) 2012
[7]鹽脅迫下小麥葉片蛋白質(zhì)組差異研究[D]. 金艷.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3458053
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1根(A)和葉(B)樣品間的差異基因統(tǒng)計(jì)??
activity)所占比例取局],禹子載體活性(electron?carrier?activity)、分子車(chē)f導(dǎo)活性??(molcculartransduceractivity)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性(signaltransduceractivity)所占的比??例取低;葉片僅在離子載體活性(electron?carrier?activity)的比例最低(圖2)。??12??
?香蕉響應(yīng)鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)組分析???比例最高,根部在分子傳導(dǎo)活性(molecular?transducer?activity)比例最低,葉片在轉(zhuǎn)??錄因子活性,結(jié)合蛋白(transcription?factor?activity,protein?binding)比例最低(圖?3)。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)鹽脅迫下香蕉幼苗CaM和Ca2+-ATPase基因的相對(duì)表達(dá)量[J]. 王文昌,周雙云,喬飛,吉福桑,李元元,李新國(guó). 分子植物育種. 2017(05)
[2]南方型紫花苜蓿苗期葉片鹽脅迫差異蛋白分析[J]. 裴翠明,張振亞,馬進(jìn). 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(11)
[3]南方型紫花苜蓿葉片響應(yīng)鹽脅迫蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析[J]. 馬進(jìn),鄭鋼,裴翠明,張振亞. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(09)
[4]基于轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組關(guān)聯(lián)研究技術(shù)篩選紫花苜蓿耐鹽相關(guān)候選基因[J]. 張振亞,裴翠明,馬進(jìn). 植物生理學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]基于iTRAQ質(zhì)譜分析技術(shù)篩選南方型紫花苜蓿根部響應(yīng)鹽脅迫差異表達(dá)蛋白[J]. 馬進(jìn),鄭鋼,裴翠明,張振亞. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(04)
[6]基于RNA-Seq技術(shù)的鹽脅迫向日葵轉(zhuǎn)錄組信息分析[J]. 孫瑞芬,張艷芳,郭樹(shù)春,于海峰,李素萍,聶惠,喬慧蕾,安玉麟. 分子植物育種. 2015(12)
[7]南方型紫花苜蓿葉片鹽脅迫應(yīng)答基因鑒定與分析[J]. 馬進(jìn),鄭鋼. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(12)
[8]燕麥鹽脅迫響應(yīng)基因的差異表達(dá)與生理響應(yīng)的關(guān)系[J]. 高彩婷,劉景輝,徐壽軍,張玉芹,于華榮. 西北植物學(xué)報(bào). 2015(07)
[9]花生中脅迫相關(guān)基因AhDHN1的克隆及非生物脅迫下表達(dá)分析[J]. 陳娜,胡冬青,潘麗娟,遲曉元,陳明娜,王通,王冕,楊珍,禹山林. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(12)
[10]鹽脅迫下兩個(gè)甜瓜品種轉(zhuǎn)錄因子的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 陳嘉貝,張芙蓉,黃丹楓,張利達(dá),張屹東. 植物生理學(xué)報(bào). 2014(02)
博士論文
[1]白榆耐鹽生理生態(tài)機(jī)制研究[D]. 劉炳響.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]紫花苜蓿響應(yīng)鹽脅迫的蛋白質(zhì)組研究[D]. 熊軍波.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[3]小麥耐鹽漸滲系山融3號(hào)根系鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組分析及相關(guān)基因功能研究[D]. 李朔.山東大學(xué) 2009
碩士論文
[1]紫花苜蓿耐鹽生理特性及轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 江超.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]2種不同基因組類(lèi)型香蕉耐鹽生理響應(yīng)及其鹽脅迫下Ca2+的動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)[D]. 周雙云.海南大學(xué) 2014
[3]棉花苗期葉片鹽脅迫差異蛋白質(zhì)分析[D]. 許菲菲.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[4]鹽脅迫下兩個(gè)甜瓜品種的轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 陳嘉貝.上海交通大學(xué) 2014
[5]基于RNA-Seq技術(shù)的國(guó)產(chǎn)沉香轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及數(shù)字基因表達(dá)譜分析[D]. 吳宏清.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[6]不同鹽堿脅迫條件下玉米根部基因的差異表達(dá)譜分析[D]. 曲昕寧.吉林大學(xué) 2012
[7]鹽脅迫下小麥葉片蛋白質(zhì)組差異研究[D]. 金艷.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3458053
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/yylw/3458053.html
最近更新
教材專(zhuān)著