糙皮側(cè)耳（Pleurotus ostreatus）是我國主栽食用菌之一,產(chǎn)量位居第三。糙皮側(cè)耳從菌絲發(fā)育為子實(shí)體是一個復(fù)雜的過程,受到多種因素的調(diào)控;由于主要采用農(nóng)業(yè)式栽培,夏季高溫影響其產(chǎn)量和品質(zhì)。過氧化氫酶（catalase,CAT）是分解H₂O₂最重要的酶,大量研究表明其參與真菌的脅迫響應(yīng)和發(fā)育過程。由于食用菌的CAT研究較少,本研究利用組學(xué)和實(shí)驗(yàn)相結(jié)合的方法對糙皮側(cè)耳的CAT開展了系統(tǒng)研究,主要結(jié)果如下:1.糙皮側(cè)耳CAT序列的遺傳變異、基因結(jié)構(gòu)及進(jìn)化地位:對糙皮側(cè)耳CCMSSC03989進(jìn)行了基因組從頭測序,對CCMSSC00389的基因組組裝進(jìn)行了提升。糙皮側(cè)耳的基因組上注釋到兩個CAT,命名為CAT-1（chr4）和CAT-2（chr10）。CAT-1和CAT-2基因區(qū)SNP的密度遠(yuǎn)大于基因組的平均水平,且CAT-1啟動子區(qū)域存在大量的In/Del變異。CAT-1編碼745個氨基酸,屬于group II亞家族,CAT-2編碼528個氨基酸,屬于group III亞家族。CAT-1和CAT-2基因結(jié)構(gòu)存在較大差異。2.糙皮側(cè)耳CA... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：129 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

植物中ROS清除系統(tǒng)(Sofoetal.,2015)

2004)、ER (Mobley et al., 2004) 等轉(zhuǎn)錄因子是 CAT 轉(zhuǎn)錄的抑制因子。除此之AT 基因擴(kuò)張、CAT 基因突變等）、表觀遺傳學(xué)（DNA 甲基化、乙酰化等）和轉(zhuǎn)錄A 穩(wěn)定性等）也都會對 CAT 產(chǎn)生調(diào)控 (Glorieux et al., 2015)。年來，粗糙脈孢菌 CAT 轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制的研究取得了一定的進(jìn)展：CAT-3 基因上游區(qū)bp 富含 AT 的序列，這一區(qū)域中 H3K9me3 修飾及 HP1 蛋白大量富集，最終形成異AT-3 的表達(dá) (Wang et al., 2016)；組蛋白變體 H2A.Z 可以通過 SWR1 復(fù)合體交換到區(qū)域從而抑制 CAT-3 基因的表達(dá) (Dong et al., 2018)；轉(zhuǎn)錄因子 cpc1 可以結(jié)合在 C動子區(qū)域，隨后招募組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶 GCN5 對該區(qū)域的蛋白進(jìn)行乙�；揎�，激錄 (Qi et al., 2018)。組學(xué)技術(shù)在食用菌研究中的應(yīng)用學(xué)工具可以提供細(xì)胞內(nèi)分子、組織和器官的整體視圖，主要研究某一環(huán)境條件下的因組學(xué)）、mRNA（轉(zhuǎn)錄組學(xué)）、蛋白合成（蛋白質(zhì)組學(xué)）和代謝物（代謝組學(xué)），這被稱為系統(tǒng)生物學(xué)（systems biology）（圖 1-2） (T llez-T llez et al., 2019)。多組學(xué)利于某一生理過程的解析，組學(xué)技術(shù)在食用菌中的應(yīng)用越來越廣泛，下面主要圍繞錄組學(xué)做詳細(xì)介紹。

業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文 第二章 基于組學(xué)技術(shù)的糙皮側(cè)耳過氧化氫酶特表 2-6 CCMSSC03989 基因組草圖統(tǒng)計(jì)Table 2-6 Statistical analysis of the P. ostreatus CCMSSC03989 genome assemblies.tentsFinalScaffoldsNGS+BionanoHybridNGSAssembly Bionano Genomber of scaffolds/maps 94 203 825 246l length of scaffolds/maps (Mb) 34.73 34.76 36.42 33.69fold/map N50 (Kb) 2,851.2 1,109.40 432.52 138 ratio (%) 0.84 0.91 3.37 -ber of contigs 570 570 1,648 -l length of contigs (Mb) 34.45 34.45 35.19 -tig N50 (Kb) 191.92 191.92 126.35 -eat (%) 10.23 10.11 - -content (%) 50.47 50.49 50.90 -ber of protein-coding genes 10,696 10,936 - -rage coding gene length (bp) 1,571 1,743 - -

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]熱脅迫下糙皮側(cè)耳菌絲體海藻糖代謝調(diào)控研究[D]. 雷敏.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018

碩士論文
[1]銅(Cu2+)對糙皮側(cè)耳生長發(fā)育的影響研究[D]. 盧嬌嬌.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]低溫脅迫下草菇抗氧化應(yīng)答反應(yīng)中關(guān)鍵酶的表達(dá)量變化及活性研究[D]. 姜威.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]低溫處理對阿魏菇菌絲體生理生化及營養(yǎng)積累的影響[D]. 張國良.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]環(huán)境脅迫下部分食用菌菌絲酶活性變化的研究[D]. 管道平.福建農(nóng)林大學(xué) 2004



本文編號：3457308