三種梨病毒實時熒光定量RT-PCR和RT-LAMP檢測技術(shù)的研究
發(fā)布時間:2021-10-25 11:24
蘋果莖溝病毒(Apple stem grooving virus)、蘋果莖痘病毒(Apple stem pitting virus, ASPV)和蘋果褪綠葉斑病毒(Apple cholortotic leaf spot virus, ACLSV)是侵染梨樹的三種主要病毒,單一病毒侵染栽培梨時,通常不表現(xiàn)出明顯的癥狀,而兩種或三種病毒復(fù)合侵染時,有的梨樹葉片表現(xiàn)出褪綠斑、脈黃、畸形及卷曲等明顯癥狀。目前,培育和栽培無病毒苗木是防治果樹病毒病的有效措施,因此,果樹病毒病的檢測和診斷具有非常重要的作用。建立靈敏、快速和高通量的病毒檢測可為無病毒種苗的繁育提供技術(shù)。本研究建立了檢測3種梨病毒ASGV、ASPV和ACLSV的實時熒光定量RT-PCR (Reverse transcriptional real time fluorescent quantitative, qRT-PCR)技術(shù)及ASPV和ACLSV的環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP)技術(shù),研究結(jié)果如下:1、本研究...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表(Abbreviations)
第一章 文獻綜述
1.1 三種梨病毒的危害特點
1.2 三種梨病毒的分子特性
1.3 果樹病毒檢測技術(shù)研究進展
1.3.1 核酸分子雜交技術(shù)
1.3.2 雙鏈RNA(dsRNA)技術(shù)
1.3.3 基因芯片技術(shù)
1.3.4 實時熒光定量PCR技術(shù)
1.3.5 LAMP技術(shù)
1.4 研究目的和意義
第二章 三種梨病毒實時熒光定量RT-PCR檢測技術(shù)
2.1 材料
2.1.1 供試材料
2.1.2 試劑及儀器
2.2 研究方法
2.2.1 引物設(shè)計
2.2.2 總RNA的提取
2.2.3 Dnase Ⅰ消化
2.2.4 RT-PCR擴增
2.2.5 基因克隆
2.2.6 引物用量及反應(yīng)溫度的優(yōu)化
2.2.7 陽性質(zhì)粒標準品的構(gòu)建
2.2.8 標準曲線的繪制
2.2.9 qRT-PCR引物特異性檢測
2.2.10 qRT-PCR引物靈敏度驗證
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 三種梨病毒qRT-PCR檢測引物的篩選
2.3.2 引物用量對PCR擴增反應(yīng)的影響
2.3.3 溫度梯度對PCR擴增反應(yīng)的影響
2.3.4 溶解曲線的分析
2.3.5 標準曲線的繪制
2.3.6 重復(fù)性
2.3.7 qRT-PCR檢測ASGV、ASPV和ACLSV效果評價
2.3.8 qRT-PCR檢測梨三種病毒的效果
2.4 結(jié)果與討論
第三章 ACLSV和ASPV兩種病毒的RT-LAMP技術(shù)
3.1 材料與方法
3.1.1 供試材料
3.1.2 主要試劑與儀器
3.2 研究方法
3.2.1 引物設(shè)計
3.2.2 總RNA提取
3.2.3 RT-PCR擴增
3.2.4 RT-LAMP反應(yīng)體系的建立及優(yōu)化
3.2.5 LAMP擴增產(chǎn)物檢測
3.2.6 RT-LAMP特異性檢測
3.2.7 RT-LAMP檢測引物靈敏度驗證
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 ACLSV和LAMP檢測引物的篩選
3.3.2 RT-LAMP檢測ACLSV和ASPV反應(yīng)體系的優(yōu)化
3.3.3 RT-LAMP檢測ACLSV和ASPV效果評價
3.4 結(jié)果與討論
第四章 結(jié)論與展望
參考文獻
附錄A Real-time RT-PCR與單一RT-PCR檢測梨樣品三種病毒
附錄B RT-LAMP與單一RT-PCR檢測梨樣品三種病毒結(jié)果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]梨樹病毒病害及其防控[J]. 洪霓. 中國果業(yè)信息. 2013(10)
[2]植物病毒檢測技術(shù)研究進展分析[J]. 張京宣,曹秀芬,宋濤,紀瑛. 北京農(nóng)業(yè). 2011(30)
[3]蘋果莖痘病毒外殼蛋白的原核表達及抗血清制備[J]. 李麗麗,張志宏,董雅鳳,張尊平,范旭東,裴光前. 植物保護學(xué)報. 2010(04)
[4]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)檢測菊花中番茄不孕病毒[J]. 劉佳,黃叢林,吳忠義,張秀海,王永勤. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(06)
[5]環(huán)介導(dǎo)等溫基因擴增技術(shù)及其在病毒檢測中的應(yīng)用[J]. 周廣青,常惠蕓,邵軍軍. 生物技術(shù)通訊. 2008(02)
[6]10種植物病毒的基因芯片檢測技術(shù)研究[J]. 馬新穎,汪琳,任魯風(fēng),高文娜,鄧叢良,張永江,吳小兵,相寧,周琦. 植物病理學(xué)報. 2007(06)
[7]實時熒光RT-PCR一步法檢測蘋果莖溝病毒[J]. 郭立新,向本春,陳紅運,段維軍,陳洪俊,朱水芳. 植物病理學(xué)報. 2006(01)
[8]植物病毒檢測技術(shù)研究進展[J]. 王健華,王運勤,吉訓(xùn)聰,劉志昕,鄭服叢. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2005(03)
[9]DNA芯片技術(shù)檢測乙型肝炎病毒及丁型肝炎病毒的初步研究[J]. 孫朝暉,鄭文嶺,張寶,石嶸,馬文麗. 中華肝臟病雜志. 2004(09)
[10]梨病毒病研究新進展[J]. 鄧曉云,王國平. 果樹學(xué)報. 2002(05)
本文編號:3457298
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表(Abbreviations)
第一章 文獻綜述
1.1 三種梨病毒的危害特點
1.2 三種梨病毒的分子特性
1.3 果樹病毒檢測技術(shù)研究進展
1.3.1 核酸分子雜交技術(shù)
1.3.2 雙鏈RNA(dsRNA)技術(shù)
1.3.3 基因芯片技術(shù)
1.3.4 實時熒光定量PCR技術(shù)
1.3.5 LAMP技術(shù)
1.4 研究目的和意義
第二章 三種梨病毒實時熒光定量RT-PCR檢測技術(shù)
2.1 材料
2.1.1 供試材料
2.1.2 試劑及儀器
2.2 研究方法
2.2.1 引物設(shè)計
2.2.2 總RNA的提取
2.2.3 Dnase Ⅰ消化
2.2.4 RT-PCR擴增
2.2.5 基因克隆
2.2.6 引物用量及反應(yīng)溫度的優(yōu)化
2.2.7 陽性質(zhì)粒標準品的構(gòu)建
2.2.8 標準曲線的繪制
2.2.9 qRT-PCR引物特異性檢測
2.2.10 qRT-PCR引物靈敏度驗證
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 三種梨病毒qRT-PCR檢測引物的篩選
2.3.2 引物用量對PCR擴增反應(yīng)的影響
2.3.3 溫度梯度對PCR擴增反應(yīng)的影響
2.3.4 溶解曲線的分析
2.3.5 標準曲線的繪制
2.3.6 重復(fù)性
2.3.7 qRT-PCR檢測ASGV、ASPV和ACLSV效果評價
2.3.8 qRT-PCR檢測梨三種病毒的效果
2.4 結(jié)果與討論
第三章 ACLSV和ASPV兩種病毒的RT-LAMP技術(shù)
3.1 材料與方法
3.1.1 供試材料
3.1.2 主要試劑與儀器
3.2 研究方法
3.2.1 引物設(shè)計
3.2.2 總RNA提取
3.2.3 RT-PCR擴增
3.2.4 RT-LAMP反應(yīng)體系的建立及優(yōu)化
3.2.5 LAMP擴增產(chǎn)物檢測
3.2.6 RT-LAMP特異性檢測
3.2.7 RT-LAMP檢測引物靈敏度驗證
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 ACLSV和LAMP檢測引物的篩選
3.3.2 RT-LAMP檢測ACLSV和ASPV反應(yīng)體系的優(yōu)化
3.3.3 RT-LAMP檢測ACLSV和ASPV效果評價
3.4 結(jié)果與討論
第四章 結(jié)論與展望
參考文獻
附錄A Real-time RT-PCR與單一RT-PCR檢測梨樣品三種病毒
附錄B RT-LAMP與單一RT-PCR檢測梨樣品三種病毒結(jié)果
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]梨樹病毒病害及其防控[J]. 洪霓. 中國果業(yè)信息. 2013(10)
[2]植物病毒檢測技術(shù)研究進展分析[J]. 張京宣,曹秀芬,宋濤,紀瑛. 北京農(nóng)業(yè). 2011(30)
[3]蘋果莖痘病毒外殼蛋白的原核表達及抗血清制備[J]. 李麗麗,張志宏,董雅鳳,張尊平,范旭東,裴光前. 植物保護學(xué)報. 2010(04)
[4]環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)檢測菊花中番茄不孕病毒[J]. 劉佳,黃叢林,吳忠義,張秀海,王永勤. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(06)
[5]環(huán)介導(dǎo)等溫基因擴增技術(shù)及其在病毒檢測中的應(yīng)用[J]. 周廣青,常惠蕓,邵軍軍. 生物技術(shù)通訊. 2008(02)
[6]10種植物病毒的基因芯片檢測技術(shù)研究[J]. 馬新穎,汪琳,任魯風(fēng),高文娜,鄧叢良,張永江,吳小兵,相寧,周琦. 植物病理學(xué)報. 2007(06)
[7]實時熒光RT-PCR一步法檢測蘋果莖溝病毒[J]. 郭立新,向本春,陳紅運,段維軍,陳洪俊,朱水芳. 植物病理學(xué)報. 2006(01)
[8]植物病毒檢測技術(shù)研究進展[J]. 王健華,王運勤,吉訓(xùn)聰,劉志昕,鄭服叢. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2005(03)
[9]DNA芯片技術(shù)檢測乙型肝炎病毒及丁型肝炎病毒的初步研究[J]. 孫朝暉,鄭文嶺,張寶,石嶸,馬文麗. 中華肝臟病雜志. 2004(09)
[10]梨病毒病研究新進展[J]. 鄧曉云,王國平. 果樹學(xué)報. 2002(05)
本文編號:3457298
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