西瓜為葫蘆科一年生蔓生藤本植物。水分充足、營養(yǎng)價(jià)值高,是世界上夏季經(jīng)常食用的水果之一。西瓜種臍斑是指種臍部位有無和種子表面不一致的顏色,該性狀可穩(wěn)定遺傳。一方面,該性狀在西瓜資源、品種鑒定和遺傳分類方面有一定的指導(dǎo)意義;另一方面,利用分子標(biāo)記確定與種臍斑緊密連鎖的標(biāo)記,可為今后西瓜分子標(biāo)記輔助育種提供思路與技術(shù)支撐。但就目前國內(nèi)外研究現(xiàn)狀,尚未有關(guān)于種臍斑性狀基因精細(xì)定位的文獻(xiàn)報(bào)道。本研究中,利用栽培西瓜品系B135（有種臍斑）作為父本與栽培西瓜品系B132（無種臍斑）作為母本雜交獲得F₁代B139,B139與B132回交獲得BC₁群體,通過BC₁群體98個(gè)單株的性狀形態(tài)學(xué)觀察,分析其遺傳規(guī)律�；赗AD-seq技術(shù)和QTL-seq技術(shù),完成對種臍斑性狀的初步區(qū)間定位。隨后通過分子標(biāo)記,在BC₁群體94個(gè)單株（去除4個(gè)無法鑒定的單株）與B5-8、18CB83共96個(gè)單株的構(gòu)圖群體內(nèi)篩選驗(yàn)證,逐步縮小QTL初定位的物理區(qū)域,在最終確定的區(qū)域內(nèi)結(jié)合生物信息學(xué)分析,確定候選基因。在候選基因上設(shè)計(jì)開發(fā)分子標(biāo)... 

【文章來源】：鄭州大學(xué)河南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：77 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

RAD-seq實(shí)驗(yàn)流程

RAD-seq 可分為單酶切 RAD 測序和雙酶切 RAD 測序，二者測序片段有所差異，單酶切 RAD 測序獲得的片段無方向性，僅帶酶切位點(diǎn)一側(cè)的 Read 是對齊的，雙酶切RAD獲得的片段有方向性，兩端Read都是對齊的（圖1.2）。RAD-seq技術(shù)的適用性很強(qiáng)，其優(yōu)點(diǎn)明顯、突出，主要有以下幾點(diǎn)：（1）性價(jià)比很高，所需測序量較低；（2）準(zhǔn)確度高，擁有數(shù)字化信號，覆蓋率較高；（3）高通量，可有效縮短實(shí)驗(yàn)開發(fā)周期；（4）可不依賴參考基因組，對沒有參考基因組的物種也可進(jìn)行測序篩選。RAD 測序已大規(guī)模應(yīng)用于構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜、生物性狀 QTL 定位分析、群體遺傳分析與分子標(biāo)記的開發(fā)等方面[56-59]，圖 1.2 單/雙酶切 RAD 測序片段比較[60]Fig.1.2 Comparison of single/double digest RAD sequencing fragmentsRAD-seq 以更為低廉的價(jià)格，快捷且深入地分析基因組、轉(zhuǎn)錄組等領(lǐng)域的各類數(shù)據(jù)

根據(jù)不同的群體和標(biāo)記數(shù)量，需要選擇不同的 QTL 定位軟件進(jìn)行 QTL 定位，圖1.3 為不同軟件適用的群體類型。圖 1.3 不同 QTL 作圖軟件的比較Fig.1.3 Comparison of different QTL mapping software1.4.2 QTL 定位的應(yīng)用隨著各生物遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建與完善，關(guān)于動(dòng)植物性狀 QTL 的研究越來越多，發(fā)展也越來越快。進(jìn)行 QTL 定位較早的作物當(dāng)屬番茄。1995 年 Eshed 等人定位出 18 個(gè)與番茄果重相關(guān)的 QTLs[68]；彭艷等人利用早熟番茄和晚熟番茄為親本材料，雜交得到 F2群體，進(jìn)行 QTL 定位分析，共檢測出 21 個(gè) QTLs 與番茄成熟期有關(guān)，可有效應(yīng)用于育種實(shí)踐中[69]。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于重測序的陸地棉InDel標(biāo)記開發(fā)與評價(jià)[J]. 吳迷,汪念,沈超,黃聰,溫天旺,林忠旭.  作物學(xué)報(bào). 2019(02)
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[10]西瓜枯萎病生理小種1抗性QTL精細(xì)定位與InDel標(biāo)記開發(fā)[J]. 李娜,王吉明,尚建立,李楠楠,徐永陽,馬雙武.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(01)

碩士論文
[1]西瓜種質(zhì)資源表型多樣性研究[D]. 紀(jì)海波.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]西瓜苗期炭疽病抗性鑒定方法及其抗病機(jī)理研究[D]. 羅婷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2008



本文編號：3438819