細(xì)葉百合（Liliumpumilum）主要分布于我國的北方地區(qū)地區(qū),耐寒且耐干旱和鹽堿,花瓣反卷鮮紅色,鱗莖可食,是一種兼具食用、藥用和觀賞價值的植物,也是百合抗性育種的重要親本。本研究從細(xì)葉百合轉(zhuǎn)錄組中篩選出21個NAC基因,并命名為LpNAC1-21（登錄號:MF398192-MF398212）。然后對其進(jìn)行結(jié)構(gòu)域分析、系統(tǒng)進(jìn)化分析、蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測和功能預(yù)測,研究了細(xì)葉百合21個NAC基因在逆境脅迫下各組織器官中的表達(dá)模式。研究結(jié)果如下:1.通過生物信息學(xué)分析結(jié)果表明LpNAC基因都含有NAC轉(zhuǎn)錄因子特有的保守結(jié)構(gòu)域,LpNAC蛋白氨基酸數(shù)在51-890之間,分子量5966.5-100080.4Da之間,LpNAC蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)主要以無規(guī)則卷曲構(gòu)成,αα-螺旋、β-轉(zhuǎn)角則散布于整個蛋白質(zhì)中,跨膜結(jié)構(gòu)域預(yù)測顯示LpNAC19和LpNAC20具有單個跨膜結(jié)構(gòu)域,系統(tǒng)發(fā)育樹分析顯示LpNAC蛋白與擬南芥NAC蛋白一起被分為七個不同的組（命名為NACa至NACg）。通過PlantTFDB進(jìn)一步預(yù)測LpNAC基因在細(xì)葉百合中的功能,結(jié)果顯示細(xì)葉百合NAC基因都具有轉(zhuǎn)錄調(diào)控的功能,還具有響應(yīng)非生... 

【文章來源】：東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－２細(xì)葉百合ＮＡＣ蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測??－

圖２－３?和跨膜結(jié)構(gòu)域分析??Ｆｉｇ．?２－３?Ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ?ｄｏｍａｉｎ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ＬｐＮＡＣ２０??２．２．２．５ＮＡ

ＬｐＮＡＣ２、ＬｐＮＡＣ５、ＬｐＮＡＣ８、ＬｐＮＡＣＩＯ、ＬｐＮＡＣ１２、ＬｐＮＡＣ１５、ＬｐＮＡＣ２〇ＭＬｐＮＡＣ２１??基因和在所有脅迫時間點(diǎn)都下調(diào)表達(dá)。最后一組、ｉｐｖＶｄＯ和??基因在３ｈ表達(dá)水平上調(diào)，其他時間點(diǎn)下調(diào)表達(dá)。在鹽脅迫條件下（圖３－２Ａ），??ＮＡＣ－ａ、ＮＡＣ－ｄ和ＮＡＣ－ｆ組基因的總表達(dá)水平為上調(diào)表達(dá)，ＮＡＣ－ｂ、ＮＡＣ－ｃ和ＮＡＣ－ｇ??組基因總表達(dá)水平為下調(diào)表達(dá)。ＮＡＣ－ｅ組的基因在脅迫１２ｈ后表達(dá)水平上調(diào)。根據(jù)其在??植物根部的表達(dá)模式（圖３－１Ｂ），基因可以大致分為三組。第一組包括??ＬｐＮＡＣｌ、ＬｐＮＡＣ５、ＬｐＮＡＣ６、ＬｐＮＡＣ８、ＬｐＮＡＣ９、ＬｐＮＡＣ１３、ＬｐＮＡＣ１７?和?ＬｐＮＡＣ２０?基??因，其表達(dá)水平在ｌｈ時增加，并在６?ｈ、１２?ｈ或４８?ｈ時達(dá)到最高值。第二組包括??ＺｐＡ／＾４Ｃ２、■／和?在?ｌｈ?時表達(dá)水平上調(diào)，脅迫處理??３ｈ、６ｈ或１２ｈ后表達(dá)水平迅速下降。第三組包括其在６ｈ之前表達(dá)水平為下??調(diào)表達(dá)，并且在鹽處理１２ｈ后迅速上調(diào)表達(dá)。第四組包括Ｚ／ＴＭ４Ｃ７、??ＺｐＡ＾ＣＭ、ＺｐＡ＾４Ｃ７９和ＺｐＡ＾Ｃ２Ｊ，在所有時間點(diǎn)表達(dá)水平均下??調(diào)。在鹽脅迫條件下（圖３－２Ｂ），ＮＡＣ－ｃ和ＮＡＣ－ｄ組基因的總表達(dá)水平為上調(diào)表達(dá)，而??ＮＡＣ－ｂ和ＮＡＣ－ｆ組基因總表達(dá)水平為下調(diào)表達(dá)。鹽處理６ｈ后

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]細(xì)葉百合低溫解除休眠過程中鱗莖內(nèi)糖分及相關(guān)酶的研究[J]. 劉芳,陳業(yè)雯,李丹丹,廉華,吳瑕,楊瑾,李雨琦,謝守峰,陳學(xué)武.  草業(yè)學(xué)報. 2016(05)
[2]Comprehensive analysis of NAC transcription factors in diploid Gossypium: sequence conservation and expression analysis uncover their roles during fiber development[J]. Haihong Shang,Zhongna Wang,Changsong Zou,Zhen Zhang,Weijie Li,Junwen Li,Yuzhen Shi,Wankui Gong,Tingting Chen,Aiying Liu,Juwu Gong,Qun Ge,Youlu Yuan.  Science China（Life Sciences）. 2016(02)
[3]細(xì)葉百合冷藏過程中鱗莖保護(hù)酶活性與休眠解除的關(guān)系[J]. 劉芳,李丹丹,廉華,吳瑕,陳業(yè)雯,李雨琦,謝守峰,陳學(xué)武.  草業(yè)學(xué)報. 2015(12)
[4]細(xì)葉百合低溫解除休眠過程中鱗莖細(xì)胞淀粉粒及花芽分化的變化[J]. 劉芳,田忠平,蔡英杰,張雨,周蘊(yùn)薇.  草業(yè)學(xué)報. 2015(09)
[5]紫花苜蓿NAC類轉(zhuǎn)錄因子基因MsNAC2的克隆及其功能分析[J]. 申玉華,徐振軍,唐立紅,楊曉坡,黃文婕,武小斌,張文波.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(15)
[6]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子功能研究新進(jìn)展[J]. 陳娜,蔣晶,曹必好,雷建軍,陳長明.  分子植物育種. 2015(06)
[7]紫花苜蓿NAC轉(zhuǎn)錄因子MsNAC1基因的克隆、生物信息學(xué)分析及非生物逆境脅迫下的表達(dá)分析[J]. 申玉華,徐振軍,楊曉坡,相吉山,文靜,黃文婕.  植物遺傳資源學(xué)報. 2014(06)
[8]細(xì)葉百合鱗莖花芽分化過程觀察[J]. 王家艷,劉芳,蘇欣,盧政巖,周蘊(yùn)薇.  草業(yè)科學(xué). 2014(05)
[9]野生細(xì)葉百合開花生物學(xué)研究[J]. 馬建琴,郭太君,陳少鵬,趙仁林.  北方園藝. 2013(23)
[10]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的種類、特征及功能[J]. 李偉,韓蕾,錢永強(qiáng),孫振元.  應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報. 2011(04)

博士論文
[1]兩種中國原產(chǎn)百合體細(xì)胞胚發(fā)生及miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)初步解析[D]. 張靜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017

碩士論文
[1]基于體細(xì)胞胚發(fā)生的兩種中國原產(chǎn)百合多倍體創(chuàng)制[D]. 蓋美竹.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017



本文編號：3425095