黑木耳Auricularia heimuer是我國(guó)主要栽培的食用菌之一,具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值和生態(tài)價(jià)值。本研究以黑木耳不同菌株（A14、A137和A12）和不同生育期的樣品（菌絲體、原基和子實(shí)體）為實(shí)驗(yàn)材料,提取RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,在全基因組注釋結(jié)果的基礎(chǔ)上,選擇12個(gè)候選內(nèi)參基因（APRTase、β-TUB、RPL2、EF-1a、EF-2、PGI、PGM、H⁺-ATPase、Tspd、TUB-1a、18S rRNA和28S rRNA）并設(shè)計(jì)跨內(nèi)含子的引物,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）技術(shù)進(jìn)行擴(kuò)增,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和ΔCt算法以及綜合評(píng)價(jià)軟件RefFinder,篩選適宜的內(nèi)參基因。結(jié)果表明18S rRNA、β-TUB、EF1-a和28S rRNA適宜作為不同菌株的內(nèi)參基因,APRTase、18S rRNA和28S rRNA適宜作為不同生育期的內(nèi)參基因。 

【文章來(lái)源】：菌物學(xué)報(bào). 2020,39(08)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【部分圖文】：

Ct值分布箱形圖

geNorm軟件通過(guò)計(jì)算穩(wěn)定參數(shù)M值評(píng)價(jià)候選內(nèi)參基因的表達(dá)穩(wěn)定性，M值小于1.5的基因適合作為內(nèi)參基因使用（吳建陽(yáng)等2017）。在不同菌株處理中，符合上述條件的基因表達(dá)穩(wěn)定性依次為28S rRNA>APRTase>18S rRNA>β-TUB>EF1-a；在不同生育期的處理中，符合上述條件的基因表達(dá)穩(wěn)定性依次為APRTase>28S rRNA>18S rRNA（圖3）。2.3.3 NormFinder分析：

BestKeeper軟件根據(jù)各內(nèi)參基因Ct值的標(biāo)準(zhǔn)差（stardand deviaton,SD）和變異系數(shù)（coefficient of variation,CV）的大小衡量?jī)?nèi)參基因的表達(dá)穩(wěn)定性。標(biāo)準(zhǔn)差和變異系數(shù)越小，基因的表達(dá)穩(wěn)定性越好（鄭麗潔等2017）。在不同菌株處理中，EF-1a的CV±SD最小，表達(dá)穩(wěn)定性最好；在不同生育期處理中，PGM表達(dá)穩(wěn)定性最好（表3）。2.4 內(nèi)參基因組合數(shù)分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3410166