本研究通過Tail-PCR方法分離到菊芋1-FFT基因上游長度為1 611 bp的片段（FFTP）。神經(jīng)網(wǎng)絡啟動子在FFTP序列中預測到8個啟動子核心結構,瞬時表達結果顯示起始密碼子上游400 bp的啟動子核心結構域與1 611 bp的啟動GUS基因表達的活性無明顯差異,表明-296到-246區(qū)域就是1-FFT基因的啟動子區(qū)域。PlantCARE分析表明,FFTP序列中除基本啟動子元件（TATA-box和CAAT-box）外,還含有與MYB轉錄因子結合的元件3個,參與光調控的順式作用元件12個,茉莉酸反應、厭氧過程、脫落酸、抗逆反應的元件各2個,晝夜節(jié)律控制、生長素和赤霉素反應的元件各1個。這些順式作用元件的鑒定為1-FFT參與相應的生物學過程提供理論依據(jù)。 

【文章來源】：分子植物育種. 2020,18(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

1-FFT啟動子Tail-PCR擴增電泳

為明晰1-FFT基因很有可能參與的生物學過程，通過PlantCARE對FFTP序列進行了生物信息學分析。FFTP序列中共檢測到121個順式作用元件，除啟動子所具備的基本元件39個TATA-box和22個CAAT-box之外，尚有60個參與1-FFT基因表達調控的順式作用元件。在60個順式作用元件中，26個順式作用元件能夠預測其功能。參與光調控的12個，與MYB轉錄因子作用元件有3個，茉莉酸反應、厭氧過程、脫落酸、抗逆反應的有2個，晝夜節(jié)律控制、生長素和赤霉素反應的調控元件各有1個(表2)。2 討論

使用Vector NTI 10生物學軟件(Invitrogen)進行序列拼接及比對。Primer Primer 5.0軟件設計引物。利用神經(jīng)網(wǎng)絡啟動子預測分析NNPP(http://www.fruitfly.org/seq＿tools/promoter.html)軟件進行啟動子核心區(qū)域生物信息學分析，利用PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)在線軟件預測順式作用元件。作者貢獻

【參考文獻】：
期刊論文
[1]‘赤霞珠’葡萄Vv5GT3基因啟動子的克隆及其對光照的響應[J]. 邢冉冉,潘秋紅.  基因組學與應用生物學. 2016(11)
[2]大豆GmGolS2基因啟動子的克隆及功能分析[J]. 李涵哲,姜敏,孫銘陽,陳薇,李悅,李永光,孟凡立,李文濱.  基因組學與應用生物學. 2015(12)
[3]菊芋的功能及其在食品中的應用[J]. 滿麗莉,向殿軍,牛墨,李鳳玉,孟祥晨,李曉紅,楊靜,王菲菲,隋春光,張春鳳.  畜牧與飼料科學. 2014(05)
[4]寡糖類能源植物菊芋及其綜合利用研究進展[J]. 寇一翾,呂世奇,劉建全,趙長明.  生命科學. 2014(05)
[5]高等植物果聚糖研究進展[J]. 成善漢,謝從華,柳俊.  植物學通報. 2002(03)



本文編號：3364053