本研究通過(guò)Tail-PCR方法分離到菊芋1-FFT基因上游長(zhǎng)度為1 611 bp的片段（FFTP）。神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)子在FFTP序列中預(yù)測(cè)到8個(gè)啟動(dòng)子核心結(jié)構(gòu),瞬時(shí)表達(dá)結(jié)果顯示起始密碼子上游400 bp的啟動(dòng)子核心結(jié)構(gòu)域與1 611 bp的啟動(dòng)GUS基因表達(dá)的活性無(wú)明顯差異,表明-296到-246區(qū)域就是1-FFT基因的啟動(dòng)子區(qū)域。PlantCARE分析表明,FFTP序列中除基本啟動(dòng)子元件（TATA-box和CAAT-box）外,還含有與MYB轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的元件3個(gè),參與光調(diào)控的順式作用元件12個(gè),茉莉酸反應(yīng)、厭氧過(guò)程、脫落酸、抗逆反應(yīng)的元件各2個(gè),晝夜節(jié)律控制、生長(zhǎng)素和赤霉素反應(yīng)的元件各1個(gè)。這些順式作用元件的鑒定為1-FFT參與相應(yīng)的生物學(xué)過(guò)程提供理論依據(jù)。 

【文章來(lái)源】：分子植物育種. 2020,18(06)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

1-FFT啟動(dòng)子Tail-PCR擴(kuò)增電泳

為明晰1-FFT基因很有可能參與的生物學(xué)過(guò)程，通過(guò)PlantCARE對(duì)FFTP序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。FFTP序列中共檢測(cè)到121個(gè)順式作用元件，除啟動(dòng)子所具備的基本元件39個(gè)TATA-box和22個(gè)CAAT-box之外，尚有60個(gè)參與1-FFT基因表達(dá)調(diào)控的順式作用元件。在60個(gè)順式作用元件中，26個(gè)順式作用元件能夠預(yù)測(cè)其功能。參與光調(diào)控的12個(gè)，與MYB轉(zhuǎn)錄因子作用元件有3個(gè)，茉莉酸反應(yīng)、厭氧過(guò)程、脫落酸、抗逆反應(yīng)的有2個(gè)，晝夜節(jié)律控制、生長(zhǎng)素和赤霉素反應(yīng)的調(diào)控元件各有1個(gè)(表2)。2 討論

使用Vector NTI 10生物學(xué)軟件(Invitrogen)進(jìn)行序列拼接及比對(duì)。Primer Primer 5.0軟件設(shè)計(jì)引物。利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)啟動(dòng)子預(yù)測(cè)分析NNPP(http://www.fruitfly.org/seq＿tools/promoter.html)軟件進(jìn)行啟動(dòng)子核心區(qū)域生物信息學(xué)分析，利用PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)在線軟件預(yù)測(cè)順式作用元件。作者貢獻(xiàn)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3364053