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柑橘TCP家族生物信息學(xué)分析及CsTCP1轉(zhuǎn)錄因子參與果實(shí)成熟的功能驗(yàn)證

發(fā)布時(shí)間:2021-08-19 10:25
  果實(shí)成熟是一個(gè)復(fù)雜的過程,受多個(gè)代謝途徑共同調(diào)控。目前,針對(duì)非躍變型果實(shí)成熟機(jī)制方面的研究較少。因此研究柑橘果實(shí)成熟相關(guān)的基因,并探究它們與果實(shí)成熟調(diào)控之間的關(guān)系,進(jìn)而選育出不同成熟期的優(yōu)良品種,對(duì)柑橘產(chǎn)業(yè)發(fā)展有重要意義。TCP(TEOSINTEBRANCHEDI/CYCLOIDEA/PROLIFERATING CELL FACTOR)蛋白是植物所特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,參與植物葉的發(fā)育、花的對(duì)稱性、莖的分支等進(jìn)程,但在果實(shí)成熟上的研究較少。前人通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及SSR分析發(fā)現(xiàn)柑橘CsTCP1基因可能參與果實(shí)的成熟。本實(shí)驗(yàn)通過生物信息學(xué)和基因表達(dá)兩種方法對(duì)柑橘TCP家族成員進(jìn)行研究。同時(shí)克隆CsTCP1基因,通過對(duì)該基因在番茄中的超量表達(dá)研究分析其功能。主要研究結(jié)果如下:1、柑橘全基因組共編碼20個(gè)TCP家族成員基因,編號(hào)分別為CsTCP1CsTCP20,系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系結(jié)果將CsTCPs分為兩個(gè)亞家族:Class I和Class II。序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)它們都含有典型的BHLH結(jié)構(gòu)域。除1號(hào)和4號(hào)染色體外,其它7條染色體均有TCP基因的分布。多數(shù)基因結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,無(wú)內(nèi)含子。2、根據(jù)... 

【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
1 前言
    1.1 課題提出
    1.2 果實(shí)成熟相關(guān)研究進(jìn)展
        1.2.1 果實(shí)品質(zhì)研究進(jìn)展
        1.2.2 果實(shí)成熟相關(guān)激素研究進(jìn)展
        1.2.3 TCP轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展
    1.3 生物信息學(xué)研究進(jìn)展
    1.4 本研究的目的和意義
    1.5 實(shí)驗(yàn)思路及技術(shù)路線
2 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 植物材料
        2.1.2 菌株與質(zhì)粒
        2.1.3 主要酶與生化試劑及實(shí)驗(yàn)儀器
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 柑橘CsTCPs家族生物信息學(xué)分析
        2.2.2 植物基因組DNA的提。–TAB法)
        2.2.3 植物RNA提。ㄔ噭┖蟹ǎ
        2.2.4 實(shí)時(shí)定量PCR
        2.2.5 柑橘CsTCP1的克隆
        2.2.6 植物表達(dá)載體的構(gòu)建
        2.2.7 農(nóng)桿菌感受態(tài)的制備及轉(zhuǎn)化方法
        2.2.8 農(nóng)桿菌介導(dǎo)番茄的轉(zhuǎn)化
        2.2.9 轉(zhuǎn)基因植株的檢測(cè)
3 結(jié)果與分析
    3.1 柑橘TCP家族生物信息學(xué)分析
        3.1.1 柑橘TCP家族基因的序列特征鑒定
        3.1.2 柑橘TCP家族系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系及其基因結(jié)構(gòu)分析
        3.1.3 柑橘TCP家族基因保守結(jié)構(gòu)域及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析
    3.2 柑橘CsTCPs基因表達(dá)量分析
        3.2.1 柑橘CsTCPs基因在不同組織中的表達(dá)量分析
        3.2.2 柑橘TCP基因在‘興錦 101’及晚熟芽變中的表達(dá)分析
    3.3 柑橘CsTCP1基因的克隆
    3.4 CsTCP1基因的功能驗(yàn)證
        3.4.1 亞細(xì)胞定位表達(dá)載體的構(gòu)建
        3.4.2 CsTCP1基因超表達(dá)載體的構(gòu)建
        3.4.3 轉(zhuǎn)基因番茄植株的鑒定
        3.4.4 轉(zhuǎn)基因番茄植株的表型觀察
        3.4.5 CsTCP1基因介導(dǎo)果實(shí)成熟相關(guān)基因的調(diào)控
4 討論
    4.1 柑橘TCP家族成員基于生物信息學(xué)的探討
    4.2 CsTCPs家族基因的時(shí)空表達(dá)
    4.3 CsTCP1基因的功能探討
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蘋果TCP轉(zhuǎn)錄因子家族生物信息學(xué)分析[J]. 張士剛.  山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
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[3]黃瓜轉(zhuǎn)錄因子TCP基因家族的鑒定及結(jié)構(gòu)分析[J]. 袁偉,顧掌根,褚偉雄,葉立華,楊國(guó)志.  分子植物育種. 2014(02)
[4]Two Lycopene β-Cyclases Genes from Sweet Orange (Citrus sinensis L. Osbeck) Encode Enzymes With Different Functional Efficiency During the Conversion of Lycopene-to-Provitamin A[J]. ZHANG Jian-cheng,ZHOU Wen-jing,XU Qiang,TAO Neng-guo,YE Jun-li,GUO Fei,XU Juan,DENG Xiu-xin.  Journal of Integrative Agriculture. 2013(10)
[5]分子系統(tǒng)發(fā)育分析的生物信息學(xué)方法[J]. 張樹波,賴劍煌.  計(jì)算機(jī)科學(xué). 2010(08)
[6]乙烯信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與果實(shí)成熟衰老的研究進(jìn)展[J]. 殷學(xué)仁,張波,李鮮,陳昆松.  園藝學(xué)報(bào). 2009(01)
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[8]不同來(lái)源桃種質(zhì)果實(shí)糖酸組分含量特點(diǎn)的研究[J]. 牛景,趙劍波,吳本宏,李紹華,劉國(guó)杰,姜全.  園藝學(xué)報(bào). 2006(01)
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博士論文
[1]錦橙晚熟性狀機(jī)理探討及候選基因的鑒定[D]. 張雅劍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]柑桔果實(shí)有機(jī)酸代謝生理和奉節(jié)臍橙芽變株系的AFLP分析研究[D]. 羅安才.西南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003

碩士論文
[1]矮牽牛PhTCP2基因的克隆、表達(dá)分析及超量表達(dá)研究[D]. 王會(huì)平.西南大學(xué) 2013
[2]農(nóng)桿菌介導(dǎo)的豌豆花瓣瞬間表達(dá)系統(tǒng)的建立及利用該系統(tǒng)對(duì)百脈根TCP基因亞細(xì)胞定位的研究[D]. 李超.上海交通大學(xué) 2009
[3]柑橘特征糖酸組成及其與果汁褐變關(guān)系研究[D]. 李云康.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006



本文編號(hào):3351232

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