蜻蜓鳳梨AfSBP7旳克隆及功能鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-08-13 02:49
觀賞鳳梨為多年生草本植物,在我國的熱帶、亞熱帶地區(qū)都有種植,是僅次于蘭花和紅掌的重要熱帶花卉。觀賞鳳梨在自然生長的條件下開花慢,因此目前市場上,多用乙烯及其衍生物誘導(dǎo)其開花。由于乙烯催花機(jī)理尚不清楚,所以生產(chǎn)上常常有因乙烯催花質(zhì)量不佳而造成經(jīng)濟(jì)損失的情況發(fā)生。因此,探究并闡明觀賞鳳梨開花機(jī)理尤為重要。蜻蜒鳳梨(Aechmea fasciata)為觀賞鳳梨的一種,花呈粉紅色,故又名斑粉菠蘿。本實(shí)驗(yàn)以蜻蜒鳳梨為材料,對(duì)蜻蜒鳳梨的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,獲得一個(gè)與擬南芥(Arabidopsis thaliana)SQUAMOSA Promoter-binding Protein-like(SPL)家族同源的序列片段,通過RACE(rapid amplification of cDNA ends)技術(shù)狹得3’和5’端序列,拼接得到cDNA序列全長2438 bp,開放閱讀框全長1194 bp,編碼398個(gè)氨基酸,并將其命名為AfS8P7。對(duì)AfSBP7的蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)它有SPL家族獨(dú)有的SBP結(jié)構(gòu)域,屬于蜻蜒鳳梨SPL家族。將它與擬南芥SPL家族成員進(jìn)行進(jìn)化樹分析,結(jié)果顯示它與擬南芥AtSP...
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1. 前言
1.1 文獻(xiàn)綜述
1.1.1 蜻蜓鳳梨
1.1.2 植物的開花及其調(diào)控
1.1.3 SPL是一類重要的轉(zhuǎn)錄因子
1.1.4 擬南芥中的SPL家族
1.1.5 SPL基因家族在其他物種中的重要作用
1.2 酵母單雜交實(shí)驗(yàn)原理
1.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)
1.4 研究的目的與意義
1.5 研究的技術(shù)路線
2 材料和方法
2.1 材料
2.1.1 植物材料與菌種質(zhì)粒
2.1.2 藥品與試劑
2.2 方法
2.2.1 蜻蜓鳳梨總RNA的提取
2.2.2 RACE拼接獲得AfSBP7基因全長
2.2.3 AfSBP7的生物信息學(xué)分析
2.2.4 AfSBP7轉(zhuǎn)錄活性的驗(yàn)證
2.2.5 使用熒光定量對(duì)蜻蜓鳳梨AfSBP7的表達(dá)量進(jìn)行分析
2.2.6 CaMV35S::AfSBP7過表達(dá)載體的構(gòu)建
2.2.7 將構(gòu)建成功的過表達(dá)載體轉(zhuǎn)化到農(nóng)桿菌中
2.2.8 擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化
3 結(jié)果與分析
3.1 蜻蜓鳳梨總RNA的提取
3.2 蜻蜓鳳梨AfSBP7編碼區(qū)序列全長的獲得
3.3. AfSBP7的生物信息學(xué)分析
3.3.1 閱讀框
3.3.2 基因系統(tǒng)進(jìn)化樹分析、同源性比對(duì)分析和結(jié)構(gòu)域分析
3.4 AfSBP7轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域的驗(yàn)證
3.4.1 酵母pGBKT7-AfSBP7表達(dá)載體的構(gòu)建
3.4.2. 鑒定AfSBP7是否具有轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域
3.5 AfSBP7的組織特異性表達(dá)分析
3.5.1 溶解曲線分析
3.5.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線制作結(jié)果
3.5.3 AfSBP7成株幼株晝夜節(jié)律表達(dá)分析
3.5.4 AfSBP7在組織器官里的表達(dá)分析
3.5.5 AfSBP7在不同時(shí)期里根、莖、葉的表達(dá)分析
3.5.6 AfSBP7成株幼株對(duì)乙烯的響應(yīng)
3.6 AfSBP7基因的功能分析
3.6.1. CaMV35S::AfSBP7表達(dá)載體的構(gòu)建
3.6.2 CaMV35S::AfSBP7轉(zhuǎn)擬南芥植株的分子鑒定
3.6.3 CaMV35S::AfSBP7表型分析
4 討論
4.1 蜻蜓鳳梨AfSBP7蛋白相關(guān)的生物信息學(xué)分析
4.2 AfSBP7轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域分析
4.3 AfSBP7組織特異性分析
4.4 AfSBP7基因的功能分析
5 結(jié)論
6 參考文獻(xiàn)
7 中英文縮略語
8 附錄
附錄1 引物序列
附錄2:實(shí)驗(yàn)中常用的培養(yǎng)基及藥瓶配方
附錄3:實(shí)驗(yàn)中所用到的實(shí)驗(yàn)設(shè)備
附錄4:酵母單雜交結(jié)果
附錄5:作者簡歷
9. 致謝
本文編號(hào):3339590
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1. 前言
1.1 文獻(xiàn)綜述
1.1.1 蜻蜓鳳梨
1.1.2 植物的開花及其調(diào)控
1.1.3 SPL是一類重要的轉(zhuǎn)錄因子
1.1.4 擬南芥中的SPL家族
1.1.5 SPL基因家族在其他物種中的重要作用
1.2 酵母單雜交實(shí)驗(yàn)原理
1.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)
1.4 研究的目的與意義
1.5 研究的技術(shù)路線
2 材料和方法
2.1 材料
2.1.1 植物材料與菌種質(zhì)粒
2.1.2 藥品與試劑
2.2 方法
2.2.1 蜻蜓鳳梨總RNA的提取
2.2.2 RACE拼接獲得AfSBP7基因全長
2.2.3 AfSBP7的生物信息學(xué)分析
2.2.4 AfSBP7轉(zhuǎn)錄活性的驗(yàn)證
2.2.5 使用熒光定量對(duì)蜻蜓鳳梨AfSBP7的表達(dá)量進(jìn)行分析
2.2.6 CaMV35S::AfSBP7過表達(dá)載體的構(gòu)建
2.2.7 將構(gòu)建成功的過表達(dá)載體轉(zhuǎn)化到農(nóng)桿菌中
2.2.8 擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化
3 結(jié)果與分析
3.1 蜻蜓鳳梨總RNA的提取
3.2 蜻蜓鳳梨AfSBP7編碼區(qū)序列全長的獲得
3.3. AfSBP7的生物信息學(xué)分析
3.3.1 閱讀框
3.3.2 基因系統(tǒng)進(jìn)化樹分析、同源性比對(duì)分析和結(jié)構(gòu)域分析
3.4 AfSBP7轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域的驗(yàn)證
3.4.1 酵母pGBKT7-AfSBP7表達(dá)載體的構(gòu)建
3.4.2. 鑒定AfSBP7是否具有轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域
3.5 AfSBP7的組織特異性表達(dá)分析
3.5.1 溶解曲線分析
3.5.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線制作結(jié)果
3.5.3 AfSBP7成株幼株晝夜節(jié)律表達(dá)分析
3.5.4 AfSBP7在組織器官里的表達(dá)分析
3.5.5 AfSBP7在不同時(shí)期里根、莖、葉的表達(dá)分析
3.5.6 AfSBP7成株幼株對(duì)乙烯的響應(yīng)
3.6 AfSBP7基因的功能分析
3.6.1. CaMV35S::AfSBP7表達(dá)載體的構(gòu)建
3.6.2 CaMV35S::AfSBP7轉(zhuǎn)擬南芥植株的分子鑒定
3.6.3 CaMV35S::AfSBP7表型分析
4 討論
4.1 蜻蜓鳳梨AfSBP7蛋白相關(guān)的生物信息學(xué)分析
4.2 AfSBP7轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域分析
4.3 AfSBP7組織特異性分析
4.4 AfSBP7基因的功能分析
5 結(jié)論
6 參考文獻(xiàn)
7 中英文縮略語
8 附錄
附錄1 引物序列
附錄2:實(shí)驗(yàn)中常用的培養(yǎng)基及藥瓶配方
附錄3:實(shí)驗(yàn)中所用到的實(shí)驗(yàn)設(shè)備
附錄4:酵母單雜交結(jié)果
附錄5:作者簡歷
9. 致謝
本文編號(hào):3339590
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/yylw/3339590.html
最近更新
教材專著