山楂（Crataegus pinnatifida Bge.）是薔薇科（Rosaceae）山楂屬（Crataegus spp.）果樹(shù)。作為我國(guó)重要的果樹(shù)種質(zhì)資源之一,其自交不親和機(jī)制的研究尚未見(jiàn)報(bào)道,而‘紫珍珠’作為目前發(fā)現(xiàn)的唯一山楂自交親和性的種質(zhì)資源,為探究山楂自交親不和性的分子機(jī)制及山楂屬植物的自交不親和機(jī)制提供了重要的研究材料。本研究一方面利用薔薇科果樹(shù)基因組數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)核酸酶數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,分別在5’UTR和3’UTR區(qū)域設(shè)計(jì)引物克隆‘紫珍珠’S-RNase基因,并通過(guò)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)、Lasergene、MEGA7.0和SWISS MODLE軟件進(jìn)行同源比對(duì)、結(jié)構(gòu)分析、系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析和蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)分析;另一方面設(shè)計(jì)‘紫珍珠’的自交及雜交授粉試驗(yàn),通過(guò)對(duì)自交和雜交后代群體的遺傳分析,來(lái)討論其自交親和性突變的原因。結(jié)果如下:（1）從‘紫珍珠’中克隆出兩條長(zhǎng)度分別為960 bp和843 bp的全長(zhǎng)S-RNase基因序列,分別命名為ZZZS₁-RNase和ZZZS₂-RNase。登錄到GeneBank的ID分別為MG385836和MG38... 

【文章來(lái)源】：河北科技師范學(xué)院河北省

【文章頁(yè)數(shù)】：49 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

山楂‘紫珍珠’S-RNase基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖

本研究中克隆得到的 ZZZS1-RNase 基因中含有 1 個(gè)大小為 276 bp 的內(nèi)含子，外顯子序列可編碼 227 個(gè)氨基酸殘基；ZZZS2-RNase 基因含有 1 個(gè)大小為 162 bp的內(nèi)含子，外顯子序列可編碼 226 個(gè)氨基酸殘基。據(jù) BLAST 比對(duì)分析結(jié)果確定ZZZS1-RNase 和 ZZZS2-RNase 基因均屬于 RNase T2 基因家族。通過(guò) SignalP 預(yù)測(cè)信號(hào)肽，使用 NCBI 的 CDD（Conserved Domain Database）對(duì) ZZZS1-RNase 和ZZZS2-RNase 進(jìn)行保守結(jié)構(gòu)域分析，結(jié)果表明，‘紫珍珠’ZZZS1-RNase 和ZZZS2-RNase 與蘋(píng)果屬、梨屬、李屬 S-RNase 氨基酸序列結(jié)構(gòu)相似，都具有保守的結(jié)構(gòu)域和高變區(qū)。保守結(jié)構(gòu)域共 5 個(gè)（C1、C2、C3、RC4 和 C5），高變區(qū)（HV）1 個(gè)，位于保守區(qū) C2 和 C3 之間，前端都帶有１個(gè)信號(hào)肽（圖 4）。第一個(gè)保守區(qū)域位于第 29-45 氨基酸殘基之間；第二個(gè)保守區(qū)域位于第 58-67 氨基酸殘基之間；第三個(gè)保守區(qū)域位于 114-131 氨基酸殘基之間；第四個(gè)保守區(qū)域位于 142-156氨基酸殘基之間；第五個(gè)保守區(qū)域位于 171-180 氨基酸殘基之間，其中高變區(qū)位于 78-89 氨基酸殘基之間。

17進(jìn)化距離刻度標(biāo)尺=0.1；Scale bar=0.1;圖 5 S-RNases 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig. 5 Phylogenetic tree of S-RNases.5 山楂 S-RNase 基因的空間三級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)‘紫珍珠’花柱 ZZZS1-RNase 和 ZZZS2-RNase 基因的氨基酸進(jìn)行維空間結(jié)構(gòu)模擬，利用 SWISS MODEL 在線預(yù)測(cè)，搜索包含在 SM

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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