懸鉤子屬（Rubus L.）是薔薇科（Rosaceae）中的一個大屬,全世界已知750-1000種,其分布范圍廣泛。中國是懸鉤子屬植物的重要分布中心之一,現有懸鉤子屬植物201種98變種,其中特有種138種,包含于8組24個亞組,其野生樹莓資源極其豐富,很多種質具有較大育種潛力。但長期以來樹莓所屬的懸鉤子屬分類和系統(tǒng)發(fā)育關系還存在較大分歧,該屬植物種類多,變異大,且通過無融合生殖、雜交等產生大量多倍體,致使類群錯綜復雜,很多種的分類和系統(tǒng)位置都存在異議,影響了對優(yōu)良野生樹莓種質的育種利用。因此,本研究用懸鉤子屬107份材料試材,利用葉綠體DNA的非編碼區(qū)基因間隔區(qū)rpl20-rps12序列進行測序分析,并構建系統(tǒng)發(fā)育樹,探討中國懸鉤子屬植物的系統(tǒng)發(fā)育問題。主要的研究結果如下：1中國懸鉤子屬植物葉綠體基因rpl20-rps12序列特征。中國懸鉤子屬植物葉綠體基因rpl20-rps12序列為長度為772 bp。所測得的基因序列（外類群除外）組成C、 T、A、G平均含量分別為19.5%、36.1%、29.5%、14.9%,其A+T、C+G含量平均值分別為66.0%、34.0%,A+T含量明顯... 

【文章來源】：四川農業(yè)大學四川省 211工程院校

【文章頁數】：48 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

部分樹碑樣品DNA電泳檢洲結果

采用改良的ＣＴＡＢ法提取懸鉤子屬植物基因組ＤＮＡ，電泳檢測如圖１所示。經??核酸蛋白儀測定，基因組ＤＮＡ濃度約為５００？８００?ｎｇ？沖１，純度為〇ｍ６０／２８０＝ｌ．８￣２．０，??滿足ＤＮＡ序列擴增要求。??圖１部分樹霉樣品ＤＮＡ電泳檢測結果??Ｆｉｇ．?１?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｒｅｓｕｌｔ?ｏｆ?ｓｏｍｅ?Ｒｕｂｕｓ?ｔａｘａ??３．２?７７？／２０－／７？５ｉ２序列擴增及測序??本實驗參照Ｈａｍ化ｏｍｔ８４堪用ｒｐ口０－ｒｐｓｌ２引物對所有試驗材料的的２０－ＷＳ１２區(qū)域??進行ＰＣ民擴增。本實驗的ＰＣＲ體系采用引物、ｄｃｆｆｌｂＯ、Ｍｉｘ和ＤＮＡ模板混合組成，??其中？０１管單管體系為２５曲由ｄｄＨ２〇８．５＾ｉｌ、Ｍｉｘｌ２．５｜ｉｋ正反引物伴］４１１１６［？１叫、??Ｐｒｉｍｅｒ民１叫）、模板ＤＮＡ２叫組成。得到如圖２所示的擴增結果，圖中表現為條帶清??晰，無非特異性擴增現象，則擴增結果滿足測序要求。??

Ｃ＋Ｇ含量，表明如２０－ＷＳ１２序列的堿基組成有明顯的Ａ＋Ｔ含量偏向性，??ＤＡＭＢＥ分析表明，ｒｆＯＯ－巧ｓｌ２序列的轉換與顛換偏向比與Ｆ８４遺傳距離大致呈??線性關系（圖３），說明該序列在懸鉤子屬植物中變異未飽和，可用于系統(tǒng)發(fā)育樹構??建�；冢粒桑眠x擇的Ｗ／２０－ＷＳ１２最優(yōu)進化模型為ＧＴＲ＋ｈＧ?（表２），這些參數估計??結果將直接用于ＭＬ和ＢＩ樹的模型參數設置。??〇’〇３２?Ｘ?Ｓ?轉換ｔｒａｎｓＵｉｏｎｓ．Ｔｓ??Ａ?■＇?巧巧Ｔｖ??０．０２７?－?ｍｍｍ?錢控（時換ｔｒ細ｓｉＵ〇ｎｓ＞Ｔｓ）?盧（知戶？??！。．＂６－??—??０．?０００＾＾－—：——．——ｉ——ｉ——．??０，００００?０．００％?０．０１?洗?０．０２９４?０．的９３?０．０４９１?０．０５朗??Ｆ８４?ｄｉｓｔａｎｃｅ??圖３?Ｗｌ２０－ｒ／ｗｌ２序列飽和性檢測結果??Ｆｉｇ．?３?Ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎ?ｓａ化ｒａｔｉｏｎ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?巧口０－／７７《１２??２０??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于ndhF序列的中國懸鉤子屬植物系統(tǒng)發(fā)育研究[J]. 張麗,王燕,陳清,羅婭,張勇,湯浩茹,王小蓉.  園藝學報. 2015(01)
[2]DNA序列在懸鉤子屬植物分子系統(tǒng)學研究中的應用進展[J]. 張麗,王小蓉,王燕,陳清,何文.  西北植物學報. 2014(02)
[3]浙江懸鉤子屬植物新變型及新記錄[J]. 毛美紅,朱煒,陳開超,馬丹丹.  浙江林業(yè)科技. 2012(04)
[4]紅泡刺藤居群的遺傳多樣性研究[J]. 和志嬌,和加衛(wèi),楊正松,程在全,楊燕林,李燕,黃杏娥.  西北植物學報. 2011(12)
[5]DNA序列分析在植物分子系統(tǒng)學研究中的應用現狀——以薔薇科為例[J]. 鄭小艷,曹家樹,滕元文.  園藝學報. 2009(12)
[6]植物核基因組核糖體基因間隔區(qū)序列的結構特點及其在系統(tǒng)發(fā)育研究中的應用[J]. 王川易,郭寶林.  武漢植物學研究. 2008(04)
[7]中國懸鉤子屬空心莓組與木莓組28種和變種的核型比較研究[J]. 王小蓉,湯浩茹,段娟,李玲.  植物分類學報. 2008(04)
[8]基于葉綠體DNA序列分析東亞七筋姑的遺傳進化[J]. 李欣,劉占林,王祎玲,李思鋒,趙桂仿.  西北植物學報. 2008(06)
[9]東北地區(qū)茅莓的性狀調查與倍性鑒定研究[J]. 曲延娜,代漢萍,薛志杰,范雯,王巖.  北方園藝. 2008(05)
[10]葉綠體DNA分析技術及其在栗屬植物中的應用[J]. 曹慶芹,甄貞,姜潔,劉玉芬,馮永慶,秦嶺.  果樹學報. 2008(03)

博士論文
[1]南瓜屬植物的分子系統(tǒng)發(fā)育及分子鐘研究[D]. 鄭怡鴻.武漢大學 2011
[2]西南地區(qū)懸鉤子屬植物分子系統(tǒng)學研究及其與栽培品種的遺傳差異分析[D]. 董曉莉.四川農業(yè)大學 2009
[3]基于多種DNA序列和cpSSR的梨屬（Pyrus L.）植物分子系統(tǒng)關系研究[D]. 鄭小艷.浙江大學 2008
[4]懸鉤子屬植物遺傳多樣性及其特異資源的篩選[D]. 王小蓉.四川農業(yè)大學 2008

碩士論文
[1]四川30個茶樹栽培品種葉綠體基因組PCR-RFLP分析[D]. 李歡.四川農業(yè)大學 2009
[2]懸鉤子屬6個野生種（變種）及10個栽培品種的細胞學研究[D]. 付華清.四川農業(yè)大學 2009
[3]RAPD對樹莓栽培品種及插田泡（Rubus coreanus）類型的遺傳差異分析[D]. 李玲.四川農業(yè)大學 2007
[4]峨眉山懸鉤子屬植物群落特征及資源利用評價[D]. 向麗.四川農業(yè)大學 2007
[5]分子系統(tǒng)學分析平臺的建立和應用[D]. 張原.中國科學院研究生院（植物研究所） 2004



本文編號：3284151