全世界分布葡萄屬植物約有70余種,由于種間雜交頻繁,形態(tài)變異較為復(fù)雜,部分葡萄屬植物的分類存在爭(zhēng)議。目前有關(guān)葡萄屬的進(jìn)化研究相對(duì)較少,而國內(nèi)的研究也多停留在形態(tài)方面,分子系統(tǒng)學(xué)研究開展的較少。葉綠體基因組在研究植物系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系方面具有獨(dú)特的價(jià)值,本研究選取葉綠體基因組為研究對(duì)象。首先,對(duì)實(shí)驗(yàn)室前期組裝得到的22個(gè)葡萄種的24個(gè)葉綠體基因組的重復(fù)序列、IR區(qū)段的收縮和擴(kuò)張、基因組變異、密碼子偏好性、序列分化等進(jìn)行系列比較分析。進(jìn)而,利用葉綠體基因組對(duì)葡萄屬系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行重建,主要的研究結(jié)果如下:1.重復(fù)序列分析表明,24個(gè)葡萄屬植物重復(fù)序列多分布在葉綠體基因組的非編碼區(qū),不同種之間重復(fù)序列的數(shù)量均變化不大;IR區(qū)的收縮和擴(kuò)張分析表明,大多數(shù)中國野生葡萄的ycf1假基因距JSA邊界為0bp,北美野生葡萄ycf1假基因距JSA邊界大都為20bp左右,表明與北美野生葡萄相比,中國野生葡萄葉綠體基因組IR序列發(fā)生了明顯的收縮;去除葉綠體基因組的IRB區(qū)域后,以刺葡萄塘尾葡萄為參考序列,從其他23個(gè)葡萄屬植物葉綠體基因組中共檢測(cè)到2238個(gè)變異位點(diǎn),其中包括1817個(gè)SNP位點(diǎn),421個(gè)INDE... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

4個(gè)葡萄屬植物重復(fù)序列分析

16圖 2.3 葡萄葉綠體基因組 SNP、INDEL 和核酸多樣性（PI）的分布從內(nèi)圈到外圈，分別顯示了 GC 含量、SNP 的密度、Indel 密度及核酸多樣性的分布Fig 2.3 Distribution of SNP, Indel and Pi in grape chloroplast genomeFrom the inner ring to the outer ring, the GC content, the density of the SNP, the Indel density, and thedistribution of nucleic acid diversity were shown

4個(gè)葡萄屬植物葉綠體基因組遺傳距離分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3276049