植物自交不親和性（self-incompatibility,SI）是植物在進(jìn)化過程中形成的一種遺傳機(jī)制,能夠維持植物的遺傳多樣性,實(shí)現(xiàn)遺傳重組,在被子植物的進(jìn)化過程中發(fā)揮了重要的作用。目前,在蘭科植物中自交親和性植株占大多數(shù),但也存在自交不親和的類群,其中束花石斛又占了大約3/4。本研究以國家蘭科中心栽培的束花石斛為材料,通過Illumina技術(shù)對(duì)束花石斛自交和異交的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測序及組裝,并利用基因克隆、遺傳轉(zhuǎn)化等研究手段對(duì)束花石斛自交親和、不親和的分子機(jī)制進(jìn)行了分析研究,初步篩選出一些有關(guān)束花石斛自交不親和的基因。具體研究結(jié)果如下;1)首次對(duì)束花石斛進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得51,577,372條clean reads,數(shù)據(jù)量達(dá)到5.16G。利用SOAPdenovo軟件以及Trinity軟件最終組裝到91,457個(gè)有功能注釋的unigenes,其平均長度為1105bp。2)通過對(duì)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行Blast搜索,共有25,208條Unigene被注釋,其中多數(shù)基因可劃歸于44個(gè)功能條目、25個(gè)蛋白族和256條KEGG途徑。3)將束花石斛三個(gè)轉(zhuǎn)錄組中的All-Unigenes按照表達(dá)量（R... 

【文章來源】：深圳大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

pCAMBIA1302載體結(jié)構(gòu)示意圖

圖 6 miRNA 測序信息分析流程2.2.6.3 基于同源性篩選出的潛在候選 miRNA我們可參考 FriedlanderMR 以及 WenM 等人的方法來進(jìn)行篩選[51,52]。具體方法見附錄 72.2.6.4 候選 miRNA 的靶基因預(yù)測我們對(duì)通過測序得到的 known-miRNA 以及 novel-miRNA 進(jìn)行靶基因的預(yù)測，根據(jù)植物 miRNA 獨(dú)有的特點(diǎn)(與靶基因匹配度高)，因此我們采用了計(jì)算機(jī)預(yù)測的方法對(duì)其進(jìn)行靶基因預(yù)測。

束花石斛自交不親和的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析及相關(guān) miRNA 的挖掘3、結(jié)果與分析石斛轉(zhuǎn)錄組測序及其生物信息學(xué)分析石斛總 RNA 提取及其質(zhì)量檢測 RNA 經(jīng)核酸電泳檢測結(jié)果如下圖所示，三個(gè)組樣品所提28S 兩條帶，凝膠電泳顯示無明顯降解情況。通過 NanoDH4、ZH4、CK 組的 RNA 樣品的 A260/A280 比值，分別為 1 1.9 和 2.2 之間，并且三個(gè)組的 RNA 濃度分別為：325ng/μL、RNA 總量都在 30μg 以上；符合建庫要求。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]SRK-SCR轉(zhuǎn)基因擬南芥自交不親和性的研究進(jìn)展[J]. 郝艾馨,藍(lán)興國,王宇,李玉花.  植物生理學(xué)報(bào). 2013(11)
[2]轉(zhuǎn)錄組與RNA-Seq技術(shù)[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀(jì)志賓,王建民.  生物技術(shù)通報(bào). 2012(12)
[3]高通量測序技術(shù)及其在農(nóng)業(yè)科學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 閆紹鵬,楊瑞華,冷淑嬌,王秋玉,周容濤.  中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(30)
[4]植物配子體自交不親和機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 胡彬,蔣建雄,易自力.  中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(18)
[5]高通量測序技術(shù)在動(dòng)植物研究領(lǐng)域中的應(yīng)用[J]. 岳桂東,高強(qiáng),羅龍海,王軍一,許姣卉,尹燁.  中國科學(xué):生命科學(xué). 2012(02)
[6]植物自交不親和機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 楊紅花,秦宏偉.  泰山學(xué)院學(xué)報(bào). 2009(03)
[7]植物自交不親和性的分子研究[J]. 程萍,馮仁軍,袁克華,張銀東.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(32)
[8]配子體自交不親和植物花粉S基因研究進(jìn)展[J]. 楊谷良,譚曉風(fēng),烏云塔娜.  中國生物工程雜志. 2005(10)
[9]果樹自交不親和花粉S基因研究進(jìn)展[J]. 張曉明,朱墨,姜立杰,張開春,閆國華.  果樹學(xué)報(bào). 2005(03)
[10]蕓苔屬植物自交不親和性及其機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 湯青林,宋明,王小佳.  生物工程進(jìn)展. 2001(04)

博士論文
[1]玉米授粉過程中microRNA的表達(dá)分析[D]. 李曉明.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011



本文編號(hào)：3262389