番茄鋅指蛋白家族基因分析與功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-01 11:10
番茄(Solanum lycopersicum)是全球最重要的蔬菜作物之一,在我國(guó)蔬菜產(chǎn)業(yè)中同樣占據(jù)重要地位。番茄同時(shí)也是基礎(chǔ)研究的重要模式植物之一。利用番茄來(lái)揭示植物的發(fā)育和抗逆等機(jī)制,對(duì)于基礎(chǔ)研究和遺傳改良均有重要意義。本課題組前期研究中,通過(guò)對(duì)潘那利野生番茄(Spennellii,LA0716)為供體、栽培番茄(S.lycopersicum,M82)為受體的兩個(gè)耐早漸滲系開展干旱脅迫相關(guān)的芯片研究,發(fā)現(xiàn)幾個(gè)差異表達(dá)基因編碼DBB(Double B-BOX)類鋅指蛋白,這些DBB屬于鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子B-BOX(BBX)家族。BBX基因在擬南芥和水稻上均有相關(guān)研究,而在番茄中尚無(wú)報(bào)道。本研究中的另一個(gè)鋅指蛋白基因?yàn)镾lZF3,前期的鹽脅迫芯片研究表明該基因受鹽脅迫誘導(dǎo)。超量表達(dá)SlZF3導(dǎo)致番茄植株出現(xiàn)矮化等發(fā)育方面的改變,抗逆性提高。本研究旨在對(duì)番茄BBX鋅指蛋白基因進(jìn)行系統(tǒng)分析,并對(duì)SlZF3在發(fā)育和抗逆方面的功能及相關(guān)機(jī)理進(jìn)行解析。主要的研究結(jié)果如下:1番茄B-BOX基因家族全基因組分析B-BOX蛋白編碼一類擁有1個(gè)或2個(gè)B-BOX結(jié)構(gòu)域、有的還包含1個(gè)CCT(CO,CO-li...
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:116 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2-1番茄BBX蛋白的保守結(jié)構(gòu)域??數(shù)值代表相應(yīng)保守域中的氨基酸位置,紅色及藍(lán)色矩形代表B-BOX?1和B-BOX2結(jié)構(gòu)域的?
圖2-2番茄BBX蛋白B-BOX和CCT結(jié)構(gòu)域的保守性分析??A-C分別表示B-Boxl、B-Box2及CCT保守域的氨基酸序列保守性比較
??A?SIBBX12??圖2-4番茄BBX家族進(jìn)化分析??A,以全長(zhǎng)蛋白質(zhì)序列比對(duì)構(gòu)建的進(jìn)化樹;??B-D,分別以B-B0X1、B-B0X2、CCT結(jié)構(gòu)域序列比對(duì)獲得的進(jìn)化樹;??E,兩個(gè)B-BOX連同CCT保守域所構(gòu)建的進(jìn)化樹。自展值標(biāo)于每個(gè)節(jié)點(diǎn)處。??進(jìn)化樹通過(guò)MEGA5鄰接法(Neighbor-joining)構(gòu)建,并采用1000次重復(fù)的自舉檢驗(yàn)分析。比??例尺長(zhǎng)度表示0.1氨基酸。黑色三角形表示含有2個(gè)串聯(lián)B-BOX和丨個(gè)CCT保守域的蛋白。??Figure?2-4?Phylogenetic?analysis?of?the?tomato?BBX?family??The?trees?shown?are?based?on?the?alignments?of?the?protein?sequences?of?the?full?length?(A),?the??B-BOX?1?domain?(B),?B-BOX2?domain?(C),?CCT?domain?(D)?and?two?B-BOX?plus?the?CCT??domains?(E).?The?phylogenetic?trees?were?constructed?with?the?neighbor-joining?algorithm?in??MEGA?(version?5.1)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國(guó)近年旱情演變及其對(duì)農(nóng)業(yè)造成的影響[J]. 許朗,李梅艷,劉愛軍. 干旱區(qū)資源與環(huán)境. 2012(07)
[2]GSDS:基因結(jié)構(gòu)顯示系統(tǒng)[J]. 郭安源,朱其慧,陳新,羅靜初. 遺傳. 2007(08)
[3]利用轉(zhuǎn)基因標(biāo)記NPTⅡ快速、規(guī);兒限D(zhuǎn)基因番茄[J]. 歐陽(yáng)波,龍芳,張揚(yáng)勇,葉志彪. 武漢植物學(xué)研究. 2006(01)
[4]植物C2H2型鋅指蛋白的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 黃驥,王建飛,張紅生. 遺傳. 2004(03)
[5]中國(guó)土地鹽堿化及其防治對(duì)策研究[J]. 宇振榮,王建武. 農(nóng)村生態(tài)環(huán)境. 1997(03)
本文編號(hào):3259027
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
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【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2-1番茄BBX蛋白的保守結(jié)構(gòu)域??數(shù)值代表相應(yīng)保守域中的氨基酸位置,紅色及藍(lán)色矩形代表B-BOX?1和B-BOX2結(jié)構(gòu)域的?
圖2-2番茄BBX蛋白B-BOX和CCT結(jié)構(gòu)域的保守性分析??A-C分別表示B-Boxl、B-Box2及CCT保守域的氨基酸序列保守性比較
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國(guó)近年旱情演變及其對(duì)農(nóng)業(yè)造成的影響[J]. 許朗,李梅艷,劉愛軍. 干旱區(qū)資源與環(huán)境. 2012(07)
[2]GSDS:基因結(jié)構(gòu)顯示系統(tǒng)[J]. 郭安源,朱其慧,陳新,羅靜初. 遺傳. 2007(08)
[3]利用轉(zhuǎn)基因標(biāo)記NPTⅡ快速、規(guī);兒限D(zhuǎn)基因番茄[J]. 歐陽(yáng)波,龍芳,張揚(yáng)勇,葉志彪. 武漢植物學(xué)研究. 2006(01)
[4]植物C2H2型鋅指蛋白的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 黃驥,王建飛,張紅生. 遺傳. 2004(03)
[5]中國(guó)土地鹽堿化及其防治對(duì)策研究[J]. 宇振榮,王建武. 農(nóng)村生態(tài)環(huán)境. 1997(03)
本文編號(hào):3259027
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