番茄鋅指蛋白家族基因分析與功能研究
發(fā)布時間:2021-07-01 11:10
番茄(Solanum lycopersicum)是全球最重要的蔬菜作物之一,在我國蔬菜產業(yè)中同樣占據(jù)重要地位。番茄同時也是基礎研究的重要模式植物之一。利用番茄來揭示植物的發(fā)育和抗逆等機制,對于基礎研究和遺傳改良均有重要意義。本課題組前期研究中,通過對潘那利野生番茄(Spennellii,LA0716)為供體、栽培番茄(S.lycopersicum,M82)為受體的兩個耐早漸滲系開展干旱脅迫相關的芯片研究,發(fā)現(xiàn)幾個差異表達基因編碼DBB(Double B-BOX)類鋅指蛋白,這些DBB屬于鋅指蛋白轉錄因子B-BOX(BBX)家族。BBX基因在擬南芥和水稻上均有相關研究,而在番茄中尚無報道。本研究中的另一個鋅指蛋白基因為SlZF3,前期的鹽脅迫芯片研究表明該基因受鹽脅迫誘導。超量表達SlZF3導致番茄植株出現(xiàn)矮化等發(fā)育方面的改變,抗逆性提高。本研究旨在對番茄BBX鋅指蛋白基因進行系統(tǒng)分析,并對SlZF3在發(fā)育和抗逆方面的功能及相關機理進行解析。主要的研究結果如下:1番茄B-BOX基因家族全基因組分析B-BOX蛋白編碼一類擁有1個或2個B-BOX結構域、有的還包含1個CCT(CO,CO-li...
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖2-1番茄BBX蛋白的保守結構域??數(shù)值代表相應保守域中的氨基酸位置,紅色及藍色矩形代表B-BOX?1和B-BOX2結構域的?
圖2-2番茄BBX蛋白B-BOX和CCT結構域的保守性分析??A-C分別表示B-Boxl、B-Box2及CCT保守域的氨基酸序列保守性比較
??A?SIBBX12??圖2-4番茄BBX家族進化分析??A,以全長蛋白質序列比對構建的進化樹;??B-D,分別以B-B0X1、B-B0X2、CCT結構域序列比對獲得的進化樹;??E,兩個B-BOX連同CCT保守域所構建的進化樹。自展值標于每個節(jié)點處。??進化樹通過MEGA5鄰接法(Neighbor-joining)構建,并采用1000次重復的自舉檢驗分析。比??例尺長度表示0.1氨基酸。黑色三角形表示含有2個串聯(lián)B-BOX和丨個CCT保守域的蛋白。??Figure?2-4?Phylogenetic?analysis?of?the?tomato?BBX?family??The?trees?shown?are?based?on?the?alignments?of?the?protein?sequences?of?the?full?length?(A),?the??B-BOX?1?domain?(B),?B-BOX2?domain?(C),?CCT?domain?(D)?and?two?B-BOX?plus?the?CCT??domains?(E).?The?phylogenetic?trees?were?constructed?with?the?neighbor-joining?algorithm?in??MEGA?(version?5.1)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國近年旱情演變及其對農業(yè)造成的影響[J]. 許朗,李梅艷,劉愛軍. 干旱區(qū)資源與環(huán)境. 2012(07)
[2]GSDS:基因結構顯示系統(tǒng)[J]. 郭安源,朱其慧,陳新,羅靜初. 遺傳. 2007(08)
[3]利用轉基因標記NPTⅡ快速、規(guī);兒限D基因番茄[J]. 歐陽波,龍芳,張揚勇,葉志彪. 武漢植物學研究. 2006(01)
[4]植物C2H2型鋅指蛋白的結構與功能[J]. 黃驥,王建飛,張紅生. 遺傳. 2004(03)
[5]中國土地鹽堿化及其防治對策研究[J]. 宇振榮,王建武. 農村生態(tài)環(huán)境. 1997(03)
本文編號:3259027
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖2-1番茄BBX蛋白的保守結構域??數(shù)值代表相應保守域中的氨基酸位置,紅色及藍色矩形代表B-BOX?1和B-BOX2結構域的?
圖2-2番茄BBX蛋白B-BOX和CCT結構域的保守性分析??A-C分別表示B-Boxl、B-Box2及CCT保守域的氨基酸序列保守性比較
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國近年旱情演變及其對農業(yè)造成的影響[J]. 許朗,李梅艷,劉愛軍. 干旱區(qū)資源與環(huán)境. 2012(07)
[2]GSDS:基因結構顯示系統(tǒng)[J]. 郭安源,朱其慧,陳新,羅靜初. 遺傳. 2007(08)
[3]利用轉基因標記NPTⅡ快速、規(guī);兒限D基因番茄[J]. 歐陽波,龍芳,張揚勇,葉志彪. 武漢植物學研究. 2006(01)
[4]植物C2H2型鋅指蛋白的結構與功能[J]. 黃驥,王建飛,張紅生. 遺傳. 2004(03)
[5]中國土地鹽堿化及其防治對策研究[J]. 宇振榮,王建武. 農村生態(tài)環(huán)境. 1997(03)
本文編號:3259027
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