蘋果小吉丁蟲微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及其遺傳多樣性
發(fā)布時(shí)間:2021-06-26 06:27
新疆蘋果野果林是我國寶貴的種質(zhì)基因庫,已被列為中國具有生物多樣性國際意義的優(yōu)先保護(hù)物種及國家II級(jí)瀕危保護(hù)植物。蘋果小吉丁蟲Agrilus mali Matsumura入侵到新疆以后,造成新疆野果林大量的野蘋果樹枯死,使野蘋果林面臨著毀滅的威脅。該蟲在新疆也嚴(yán)重危害栽培蘋果,影響當(dāng)?shù)厝嗣竦慕?jīng)濟(jì)收入。因此,開展蘋果小吉丁蟲相關(guān)研究工作迫在眉睫。本研究利用磁珠富集法開發(fā)了7對(duì)能夠穩(wěn)定擴(kuò)增且多態(tài)性較好的微衛(wèi)星引物,并結(jié)合線粒體COI標(biāo)記和微衛(wèi)星標(biāo)記,分析了采自新疆野果林的7個(gè)蘋果小吉丁蟲種群和采自遼寧的1個(gè)蘋果小吉丁蟲種群的遺傳多樣性,研究結(jié)果對(duì)于進(jìn)一步闡明蘋果小吉丁蟲入侵到新疆后的種群擴(kuò)張與暴發(fā)機(jī)制,以及制定符合新疆野果林種群遺傳結(jié)構(gòu)特點(diǎn)的綜合治理策略具有重要的指導(dǎo)意義。主要研究結(jié)果如下:1.本研究采用磁珠富集法開發(fā)蘋果小吉丁蟲的微衛(wèi)星引物,構(gòu)建了蘋果小吉丁蟲微衛(wèi)星文庫。經(jīng)測(cè)序后共獲得含有微衛(wèi)星重復(fù)單元的克隆248個(gè),陽性克隆率為82.6%。除探針使用的AC、AG重復(fù)外,還得到了CT、ATCA和TCGT的重復(fù)序列,重復(fù)次數(shù)主要集中在1620左右。本研究得到的248個(gè)蘋...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 研究背景
1.1.1 新疆伊犁河谷概述
1.1.2 新疆野蘋果林概述
1.2 蘋果小吉丁蟲概述
1.2.1 蘋果小吉丁蟲的分類地位及形態(tài)特征
1.2.2 蘋果小吉丁蟲的生物學(xué)特性
1.2.3 蘋果小吉丁蟲的分布和危害
1.2.4 蘋果小吉丁蟲防治技術(shù)進(jìn)展
1.3 種群遺傳學(xué)相關(guān)概念
1.3.1 種群和種群遺傳學(xué)的概念
1.3.2 遺傳多樣性的概念
1.3.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)的概念
1.3.4 哈迪溫伯格平衡定律
1.3.5 中性突變理論的內(nèi)容
1.4 影響種群遺傳變異的因素
1.4.1 遺傳漂變和瓶頸效應(yīng)
1.4.2 基因流
1.4.3 繁殖方式
1.4.4 種群分化
1.5 生物入侵和入侵生物學(xué)的概念
1.6 入侵生物的種群遺傳學(xué)研究
1.7 分子標(biāo)記技術(shù)種類及特點(diǎn)
1.7.1 限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)
1.7.2 擴(kuò)增長度片段多態(tài)性(AFLP)
1.7.3 隨機(jī)片段長度多態(tài)性(RAPD)
1.7.4 線粒體基因標(biāo)記
1.7.5 微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR)標(biāo)記
1.8 本研究的目的和意義
第二章 磁珠富集法構(gòu)建蘋果小吉丁蟲微衛(wèi)星文庫
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 試蟲采集
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器和試劑
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 試蟲樣本的預(yù)處理
2.2.2 基因組DNA的提取
2.2.3 蘋果小吉丁蟲基因組DNA質(zhì)量及純度檢測(cè)
2.2.4 基因組DNA酶切和回收
2.2.5 接頭的制備及探針的合成
2.2.6 接頭的連接和連接產(chǎn)物的擴(kuò)增
2.2.7 微衛(wèi)星片段的富集及擴(kuò)增
2.2.8 微衛(wèi)星文庫的構(gòu)建及陽性克隆篩選
2.2.9 微衛(wèi)星引物的設(shè)計(jì)及篩選
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 基因組DNA的提取及酶切結(jié)果
2.3.2 磁珠雜交洗脫后富集片段的擴(kuò)增結(jié)果
2.3.3 微衛(wèi)星文庫的構(gòu)建及陽性克隆篩選結(jié)果
2.3.4 微衛(wèi)星引物的設(shè)計(jì)及篩選結(jié)果
2.4 結(jié)論與討論
第三章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的蘋果小吉丁蟲種群遺傳多樣性
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 試蟲的采集和保存
3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 樣本預(yù)處理
3.2.2 蘋果小吉丁蟲基因組DNA的提取
3.2.3 基因組DNA質(zhì)量及純度檢測(cè)
3.2.4 微衛(wèi)星位點(diǎn)的選取
3.2.5 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 基因組DNA的提取與檢測(cè)
3.3.2 PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.3.3 微衛(wèi)星數(shù)據(jù)分析結(jié)果
3.3.4 蘋果小吉丁蟲種群遺傳分化數(shù)據(jù)結(jié)果分析
3.4 討論
第四章 基于線粒體COI基因的蘋果小吉丁蟲種群結(jié)構(gòu)研究
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 試蟲采集
4.1.2 主要試劑與儀器
4.1.3 常用試劑的配制
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 試蟲樣本的預(yù)處理
4.2.2 蘋果小吉丁蟲基因組DNA的提取
4.2.3 蘋果小吉丁蟲基因組DNA質(zhì)量及純度檢測(cè)
4.2.4 線粒體引物的合成及目的片段擴(kuò)增
4.2.5 數(shù)據(jù)處理與分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 蘋果小吉丁蟲線粒體基因的PCR擴(kuò)增
4.3.2 蘋果小吉丁蟲COI基因序列變異分析
4.3.3 蘋果小吉丁蟲COI基因遺傳多樣性分析
4.3.4 蘋果小吉丁蟲種群遺傳分化分析
4.3.5 蘋果小吉丁蟲COI基因分子方差分析
4.3.6 討論
第五章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新疆野蘋果小吉丁蟲防治試驗(yàn)[J]. 劉逸泠,祝建波. 福建林業(yè)科技. 2015(02)
[2]我國禾谷縊管蚜微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增穩(wěn)定性及遺傳多樣性[J]. 段辛樂,喬憲鳳,彭雄,左亞運(yùn),劉高鳴,陳茂華. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(03)
[3]蘋果小吉丁蟲綜合防控研究進(jìn)展[J]. 崔曉寧,劉德廣,劉愛華. 植物保護(hù). 2015(02)
[4]太湖新銀魚微衛(wèi)星位點(diǎn)的分離與序列特征分析[J]. 李存耀,劉紅艷,熊飛. 水生態(tài)學(xué)雜志. 2015(02)
[5]諸氏鯔蝦虎魚多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及評(píng)價(jià)[J]. 蔡磊,陳小曲,鄭偉強(qiáng),李建軍. 中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2015(01)
[6]基于COI基因全長序列的假眼小綠葉蟬地理種群遺傳分化研究[J]. 周寧寧,王夢(mèng)馨,崔林,潘鋮,張新亭,韓寶瑜. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2014(23)
[7]溝脛天牛亞科部分種類線粒體COⅡ基因特征及其系統(tǒng)發(fā)育研究[J]. 李京,安世恒,張鴻飛,魏子涵,尹新明. 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(06)
[8]甘肅河西走廊蘋果蠹蛾種群遺傳分化研究——基于COI基因序列分析[J]. 李玉婷,王康,鄭燕,門秋雷,錢路,安榆林,馮紀(jì)年,張雅林,陳茂華. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(09)
[9]柑橘大實(shí)蠅微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選[J]. 高立志,劉映紅,萬宣伍,王佳,洪楓. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(15)
[10]內(nèi)蒙古亞洲小車蝗種群遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[J]. 韓海斌,周曉榕,龐保平,張敏哲,李海平. 昆蟲學(xué)報(bào). 2013(01)
博士論文
[1]世界主要分布區(qū)番石榴果實(shí)蠅種群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. Buahom Nopparat(陳英才).中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]新疆野蘋果林蘋小吉丁生物防治技術(shù)研究[D]. 王智勇.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[3]基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記的中國疫區(qū)內(nèi)蘋果蠹蛾Cydia pomonella(L.)種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 門秋雷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
本文編號(hào):3250816
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 研究背景
1.1.1 新疆伊犁河谷概述
1.1.2 新疆野蘋果林概述
1.2 蘋果小吉丁蟲概述
1.2.1 蘋果小吉丁蟲的分類地位及形態(tài)特征
1.2.2 蘋果小吉丁蟲的生物學(xué)特性
1.2.3 蘋果小吉丁蟲的分布和危害
1.2.4 蘋果小吉丁蟲防治技術(shù)進(jìn)展
1.3 種群遺傳學(xué)相關(guān)概念
1.3.1 種群和種群遺傳學(xué)的概念
1.3.2 遺傳多樣性的概念
1.3.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)的概念
1.3.4 哈迪溫伯格平衡定律
1.3.5 中性突變理論的內(nèi)容
1.4 影響種群遺傳變異的因素
1.4.1 遺傳漂變和瓶頸效應(yīng)
1.4.2 基因流
1.4.3 繁殖方式
1.4.4 種群分化
1.5 生物入侵和入侵生物學(xué)的概念
1.6 入侵生物的種群遺傳學(xué)研究
1.7 分子標(biāo)記技術(shù)種類及特點(diǎn)
1.7.1 限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)
1.7.2 擴(kuò)增長度片段多態(tài)性(AFLP)
1.7.3 隨機(jī)片段長度多態(tài)性(RAPD)
1.7.4 線粒體基因標(biāo)記
1.7.5 微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR)標(biāo)記
1.8 本研究的目的和意義
第二章 磁珠富集法構(gòu)建蘋果小吉丁蟲微衛(wèi)星文庫
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 試蟲采集
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器和試劑
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 試蟲樣本的預(yù)處理
2.2.2 基因組DNA的提取
2.2.3 蘋果小吉丁蟲基因組DNA質(zhì)量及純度檢測(cè)
2.2.4 基因組DNA酶切和回收
2.2.5 接頭的制備及探針的合成
2.2.6 接頭的連接和連接產(chǎn)物的擴(kuò)增
2.2.7 微衛(wèi)星片段的富集及擴(kuò)增
2.2.8 微衛(wèi)星文庫的構(gòu)建及陽性克隆篩選
2.2.9 微衛(wèi)星引物的設(shè)計(jì)及篩選
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 基因組DNA的提取及酶切結(jié)果
2.3.2 磁珠雜交洗脫后富集片段的擴(kuò)增結(jié)果
2.3.3 微衛(wèi)星文庫的構(gòu)建及陽性克隆篩選結(jié)果
2.3.4 微衛(wèi)星引物的設(shè)計(jì)及篩選結(jié)果
2.4 結(jié)論與討論
第三章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的蘋果小吉丁蟲種群遺傳多樣性
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 試蟲的采集和保存
3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 樣本預(yù)處理
3.2.2 蘋果小吉丁蟲基因組DNA的提取
3.2.3 基因組DNA質(zhì)量及純度檢測(cè)
3.2.4 微衛(wèi)星位點(diǎn)的選取
3.2.5 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 基因組DNA的提取與檢測(cè)
3.3.2 PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.3.3 微衛(wèi)星數(shù)據(jù)分析結(jié)果
3.3.4 蘋果小吉丁蟲種群遺傳分化數(shù)據(jù)結(jié)果分析
3.4 討論
第四章 基于線粒體COI基因的蘋果小吉丁蟲種群結(jié)構(gòu)研究
4.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.1 試蟲采集
4.1.2 主要試劑與儀器
4.1.3 常用試劑的配制
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 試蟲樣本的預(yù)處理
4.2.2 蘋果小吉丁蟲基因組DNA的提取
4.2.3 蘋果小吉丁蟲基因組DNA質(zhì)量及純度檢測(cè)
4.2.4 線粒體引物的合成及目的片段擴(kuò)增
4.2.5 數(shù)據(jù)處理與分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 蘋果小吉丁蟲線粒體基因的PCR擴(kuò)增
4.3.2 蘋果小吉丁蟲COI基因序列變異分析
4.3.3 蘋果小吉丁蟲COI基因遺傳多樣性分析
4.3.4 蘋果小吉丁蟲種群遺傳分化分析
4.3.5 蘋果小吉丁蟲COI基因分子方差分析
4.3.6 討論
第五章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新疆野蘋果小吉丁蟲防治試驗(yàn)[J]. 劉逸泠,祝建波. 福建林業(yè)科技. 2015(02)
[2]我國禾谷縊管蚜微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增穩(wěn)定性及遺傳多樣性[J]. 段辛樂,喬憲鳳,彭雄,左亞運(yùn),劉高鳴,陳茂華. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(03)
[3]蘋果小吉丁蟲綜合防控研究進(jìn)展[J]. 崔曉寧,劉德廣,劉愛華. 植物保護(hù). 2015(02)
[4]太湖新銀魚微衛(wèi)星位點(diǎn)的分離與序列特征分析[J]. 李存耀,劉紅艷,熊飛. 水生態(tài)學(xué)雜志. 2015(02)
[5]諸氏鯔蝦虎魚多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)及評(píng)價(jià)[J]. 蔡磊,陳小曲,鄭偉強(qiáng),李建軍. 中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào). 2015(01)
[6]基于COI基因全長序列的假眼小綠葉蟬地理種群遺傳分化研究[J]. 周寧寧,王夢(mèng)馨,崔林,潘鋮,張新亭,韓寶瑜. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2014(23)
[7]溝脛天牛亞科部分種類線粒體COⅡ基因特征及其系統(tǒng)發(fā)育研究[J]. 李京,安世恒,張鴻飛,魏子涵,尹新明. 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(06)
[8]甘肅河西走廊蘋果蠹蛾種群遺傳分化研究——基于COI基因序列分析[J]. 李玉婷,王康,鄭燕,門秋雷,錢路,安榆林,馮紀(jì)年,張雅林,陳茂華. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(09)
[9]柑橘大實(shí)蠅微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選[J]. 高立志,劉映紅,萬宣伍,王佳,洪楓. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(15)
[10]內(nèi)蒙古亞洲小車蝗種群遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[J]. 韓海斌,周曉榕,龐保平,張敏哲,李海平. 昆蟲學(xué)報(bào). 2013(01)
博士論文
[1]世界主要分布區(qū)番石榴果實(shí)蠅種群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. Buahom Nopparat(陳英才).中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]新疆野蘋果林蘋小吉丁生物防治技術(shù)研究[D]. 王智勇.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[3]基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記的中國疫區(qū)內(nèi)蘋果蠹蛾Cydia pomonella(L.)種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 門秋雷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
本文編號(hào):3250816
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