番茄果實主要糖酸成分全基因組關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2021-06-25 01:30
糖酸含量是影響番茄果實品質(zhì)特性的關(guān)鍵指標(biāo)之一。在長期的育種研究中,一般用可溶性固形物來間接反映番茄果實中的總糖分,利用可滴定酸來反映有機酸的含量。番茄果實糖酸性狀是一個典型的由多基因控制的數(shù)量性狀,國內(nèi)外針對番茄果實具體糖酸組分的QTL研究十分有限。本研究以174份具有廣泛代表性的番茄種質(zhì)為研究材料,對2014年的番茄紅熟期果實中的主要糖酸組分利用氣質(zhì)聯(lián)用儀進(jìn)行了測定;利用182對覆蓋番茄全基因組的SSR標(biāo)記對本試驗群體進(jìn)行了分子標(biāo)記,并對該群體的遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)、連鎖不平衡進(jìn)行了分析;最后利用182對SSR標(biāo)記對番茄主要糖酸物質(zhì)進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析。主要結(jié)果如下:1.利用氣質(zhì)聯(lián)用儀(GC-MS)對174份具有廣泛表型變異的番茄材料紅熟期果實中的主要糖酸組分進(jìn)行了測定和分析。共檢測到17種主要糖酸組分物質(zhì),包括8類糖類物質(zhì)和9種有機酸類物質(zhì)。其中主要的糖類物質(zhì)包括葡萄糖、果糖、蔗糖、半乳糖等,主要的有機酸類包括蘋果酸、檸檬酸、琥珀酸、丁酸、脯氨酸等。主要糖酸組分之間一般存在著較高的相關(guān)性,其中葡萄糖和半乳糖之間的相關(guān)系數(shù)達(dá)到0.958;果糖、葡萄糖和蘋果酸、谷氨酸、琥珀酸之間均為...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 常用分子標(biāo)記種類
1.1.1 RFLP標(biāo)記
1.1.2 RAPD標(biāo)記
1.1.3 AFLP標(biāo)記
1.1.4 SSR標(biāo)記
1.1.5 ISSR標(biāo)記
1.1.6 SRAP標(biāo)記
1.1.7 SSCP標(biāo)記
1.1.8 SNP標(biāo)記
1.1.9 EST標(biāo)記
1.2 數(shù)量性狀研究進(jìn)展
1.2.1 數(shù)量性狀研究的基本方法
1.2.2 番茄主要品質(zhì)相關(guān)性狀QTL研究進(jìn)展
1.3 關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
1.3.1 關(guān)聯(lián)分析的方法
1.3.2 關(guān)聯(lián)分析在植物學(xué)中研究進(jìn)展
1.3.3 關(guān)聯(lián)分析在番茄中研究進(jìn)展
1.3.4 關(guān)聯(lián)分析理論基礎(chǔ)及優(yōu)缺點
1.4 研究目的意義及技術(shù)路線
1.4.1 研究目的及意義
1.4.2 研究內(nèi)容
1.4.3 技術(shù)路線
第二章 番茄遺傳多樣性分析和群體結(jié)構(gòu)
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗材料
2.1.2 基因組DNA的提取
2.1.3 SSR-PCR反應(yīng)體系
2.1.4 聚丙烯酰胺凝膠電泳主要步驟
2.1.5 引物多態(tài)性篩選及群體標(biāo)記
2.1.6 數(shù)據(jù)分析方法
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 SSR最小等位基因頻率分析
2.2.2 群體結(jié)構(gòu)分析
2.2.3 遺傳連鎖不平衡分析
2.3 討論
2.3.1 番茄連鎖不平衡
2.3.2 番茄種質(zhì)資源群體結(jié)構(gòu)
2.4 小結(jié)
第三章 番茄果實主要糖酸成分分析
3.1 材料與方法
3.1.1 材料
3.1.2 番茄果實主要糖酸指標(biāo)測定方法
3.2 番茄主要糖酸性狀分析
3.2.1 番茄果實中主要的糖酸物質(zhì)
3.2.2 番茄果實中主要的糖酸聚類分析
3.2.3 番茄果實中主要的糖酸相關(guān)性分析
3.2.4 番茄果實中主要糖酸與其他果實品質(zhì)相關(guān)性狀相關(guān)性分析
3.3 討論
3.4 小結(jié)
第四章 番茄主要糖酸全基因組關(guān)聯(lián)分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 番茄果實主要糖酸成分測定
4.1.3 SSR分子標(biāo)記及基因組掃描
4.1.4 數(shù)據(jù)分析方法
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 與番茄果實主要糖顯著關(guān)聯(lián)的SSR位點
4.2.2 與番茄果實主要有機酸顯著關(guān)聯(lián)的SSR位點
4.3 討論
4.4 小結(jié)
第五章 結(jié)論
5.1 結(jié)論
5.1.1 番茄果實主要糖酸組分分析
5.1.2 番茄果實遺傳多樣性分析
5.1.3 番茄果實主要糖酸全基因組關(guān)聯(lián)分析
5.2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄紅素的生物學(xué)作用及應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 陳錦瑤,張立實. 衛(wèi)生研究. 2013(02)
[2]擬南芥HMGs家族成員全基因組分析[J]. 王鳳華,劉文鋒. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(36)
[3]植物性狀-標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展[J]. 金亮,包勁松. 分子植物育種. 2009(06)
[4]文心蘭種質(zhì)遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 周艷霞,尹俊梅,任羽,楊光穗. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(07)
[5]番茄紅素功能及研究進(jìn)展[J]. 李鐵軍. 學(xué)理論. 2009(14)
[6]利用永久F2群體定位小麥株高的QTL[J]. 王巖,李卓坤,田紀(jì)春. 作物學(xué)報. 2009(06)
[7]DNA分子標(biāo)記的研究進(jìn)展及幾種新型分子標(biāo)記技術(shù)[J]. 關(guān)強,張月學(xué),徐香玲,孫德全,李綏艷,林紅,潘麗艷,馬延華. 黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(01)
[8]DNA分子標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 白玉. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(24)
[9]遺傳多樣性與植物的遺傳標(biāo)記[J]. 張傳軍,劉亦肖,肖婭萍. 陜西師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2006(S1)
[10]作物QTL定位方法研究進(jìn)展[J]. 章元明. 科學(xué)通報. 2006(19)
博士論文
[1]玉米12個農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析及玉米氮響應(yīng)相關(guān)基因的鑒定[D]. 劉志鵬.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]番茄重要農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析及野生種質(zhì)在栽培種的漸滲分析[D]. 祝光濤.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[3]中國冬小麥抗旱指標(biāo)評價、種質(zhì)篩選及重要性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[D]. 陳曉杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[4]小麥主要農(nóng)藝性狀的條件和非條件QTL定位[D]. 劉賓.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]不結(jié)球白菜遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀的QTL定位[D]. 王倩.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]不同蘋果糖酸組成及蘋果酸轉(zhuǎn)運體功能研究[D]. 張燕子.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
碩士論文
[1]大豆農(nóng)藝性狀、遺傳多樣性及其育種性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 楊凱敏.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]小麥3個重要農(nóng)藝性狀的SSR標(biāo)記全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 李桂冬.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]氮素形態(tài)對番茄果實生長和有機酸代謝動態(tài)變化的影響[D]. 徐新娟.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[4]F2:3設(shè)計多QTL定位新方法研究[D]. 萬素琴.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3248218
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 常用分子標(biāo)記種類
1.1.1 RFLP標(biāo)記
1.1.2 RAPD標(biāo)記
1.1.3 AFLP標(biāo)記
1.1.4 SSR標(biāo)記
1.1.5 ISSR標(biāo)記
1.1.6 SRAP標(biāo)記
1.1.7 SSCP標(biāo)記
1.1.8 SNP標(biāo)記
1.1.9 EST標(biāo)記
1.2 數(shù)量性狀研究進(jìn)展
1.2.1 數(shù)量性狀研究的基本方法
1.2.2 番茄主要品質(zhì)相關(guān)性狀QTL研究進(jìn)展
1.3 關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展
1.3.1 關(guān)聯(lián)分析的方法
1.3.2 關(guān)聯(lián)分析在植物學(xué)中研究進(jìn)展
1.3.3 關(guān)聯(lián)分析在番茄中研究進(jìn)展
1.3.4 關(guān)聯(lián)分析理論基礎(chǔ)及優(yōu)缺點
1.4 研究目的意義及技術(shù)路線
1.4.1 研究目的及意義
1.4.2 研究內(nèi)容
1.4.3 技術(shù)路線
第二章 番茄遺傳多樣性分析和群體結(jié)構(gòu)
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗材料
2.1.2 基因組DNA的提取
2.1.3 SSR-PCR反應(yīng)體系
2.1.4 聚丙烯酰胺凝膠電泳主要步驟
2.1.5 引物多態(tài)性篩選及群體標(biāo)記
2.1.6 數(shù)據(jù)分析方法
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 SSR最小等位基因頻率分析
2.2.2 群體結(jié)構(gòu)分析
2.2.3 遺傳連鎖不平衡分析
2.3 討論
2.3.1 番茄連鎖不平衡
2.3.2 番茄種質(zhì)資源群體結(jié)構(gòu)
2.4 小結(jié)
第三章 番茄果實主要糖酸成分分析
3.1 材料與方法
3.1.1 材料
3.1.2 番茄果實主要糖酸指標(biāo)測定方法
3.2 番茄主要糖酸性狀分析
3.2.1 番茄果實中主要的糖酸物質(zhì)
3.2.2 番茄果實中主要的糖酸聚類分析
3.2.3 番茄果實中主要的糖酸相關(guān)性分析
3.2.4 番茄果實中主要糖酸與其他果實品質(zhì)相關(guān)性狀相關(guān)性分析
3.3 討論
3.4 小結(jié)
第四章 番茄主要糖酸全基因組關(guān)聯(lián)分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 番茄果實主要糖酸成分測定
4.1.3 SSR分子標(biāo)記及基因組掃描
4.1.4 數(shù)據(jù)分析方法
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 與番茄果實主要糖顯著關(guān)聯(lián)的SSR位點
4.2.2 與番茄果實主要有機酸顯著關(guān)聯(lián)的SSR位點
4.3 討論
4.4 小結(jié)
第五章 結(jié)論
5.1 結(jié)論
5.1.1 番茄果實主要糖酸組分分析
5.1.2 番茄果實遺傳多樣性分析
5.1.3 番茄果實主要糖酸全基因組關(guān)聯(lián)分析
5.2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄紅素的生物學(xué)作用及應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 陳錦瑤,張立實. 衛(wèi)生研究. 2013(02)
[2]擬南芥HMGs家族成員全基因組分析[J]. 王鳳華,劉文鋒. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(36)
[3]植物性狀-標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展[J]. 金亮,包勁松. 分子植物育種. 2009(06)
[4]文心蘭種質(zhì)遺傳多樣性的SRAP分析[J]. 周艷霞,尹俊梅,任羽,楊光穗. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(07)
[5]番茄紅素功能及研究進(jìn)展[J]. 李鐵軍. 學(xué)理論. 2009(14)
[6]利用永久F2群體定位小麥株高的QTL[J]. 王巖,李卓坤,田紀(jì)春. 作物學(xué)報. 2009(06)
[7]DNA分子標(biāo)記的研究進(jìn)展及幾種新型分子標(biāo)記技術(shù)[J]. 關(guān)強,張月學(xué),徐香玲,孫德全,李綏艷,林紅,潘麗艷,馬延華. 黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(01)
[8]DNA分子標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 白玉. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(24)
[9]遺傳多樣性與植物的遺傳標(biāo)記[J]. 張傳軍,劉亦肖,肖婭萍. 陜西師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2006(S1)
[10]作物QTL定位方法研究進(jìn)展[J]. 章元明. 科學(xué)通報. 2006(19)
博士論文
[1]玉米12個農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析及玉米氮響應(yīng)相關(guān)基因的鑒定[D]. 劉志鵬.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]番茄重要農(nóng)藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析及野生種質(zhì)在栽培種的漸滲分析[D]. 祝光濤.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[3]中國冬小麥抗旱指標(biāo)評價、種質(zhì)篩選及重要性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[D]. 陳曉杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[4]小麥主要農(nóng)藝性狀的條件和非條件QTL定位[D]. 劉賓.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]不結(jié)球白菜遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀的QTL定位[D]. 王倩.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[6]不同蘋果糖酸組成及蘋果酸轉(zhuǎn)運體功能研究[D]. 張燕子.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
碩士論文
[1]大豆農(nóng)藝性狀、遺傳多樣性及其育種性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 楊凱敏.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]小麥3個重要農(nóng)藝性狀的SSR標(biāo)記全基因組關(guān)聯(lián)分析[D]. 李桂冬.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[3]氮素形態(tài)對番茄果實生長和有機酸代謝動態(tài)變化的影響[D]. 徐新娟.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[4]F2:3設(shè)計多QTL定位新方法研究[D]. 萬素琴.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3248218
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