發(fā)布時間：2021-06-14 22:59

　　【目的】探究江西鉛山紅芽芋對超低溫療法脫毒的轉(zhuǎn)錄組響應機制,為江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗的規(guī)�；瘧玫於ɡ碚撘罁�(jù)�！痉椒ā恳越縻U山紅芽芋超低溫療法脫毒苗（VF組）和江西鉛山紅芽芋超低溫療法帶毒苗（V組）試驗材料進行轉(zhuǎn)錄組比較分析�！窘Y(jié)果】VF組Clean reads為42 406 188,GC含量為54.09%;V組Clean reads為46 818 060,GC含量為50.36%。VF組和V組表達量FPKM的對數(shù)值在0～2,表達量密度在0～0.8。VF組和V組表達的共有基因數(shù)為23 820,V組單獨表達的基因數(shù)為10 298,VF組單獨表達的基因數(shù)為4 477。VF組和V組表達量的相關系數(shù)為0.287,樣本間相關性較差。VF組和V組共產(chǎn)生差異表達基因5 282個,與V組比較,VF組上調(diào)基因3 011,下調(diào)基因2 271。GO富集分析顯示,差異基因主要注釋到過氧化氫分解過程、過氧化氫代謝過程、一元羧酸生物合成過程、多糖分解代謝過程、金屬離子輸運、細胞外區(qū)、細胞壁、外部封裝結(jié)構、膜的固有成分、質(zhì)膜固有成分、核酸結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子活性、序列特異性DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子活性、單加氧酶活性、鐵離... 

【文章來源】：福建農(nóng)業(yè)學報. 2020,35(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：13 頁

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 試驗方法
        1.2.1 RNA提取
        1.2.2 Illumina Hiseq測序
        1.2.3 數(shù)據(jù)分析
        1.2.4 差異基因的q RT-PCR驗證
2 結(jié)果與分析
    2.1 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出分析
    2.2 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗測序數(shù)據(jù)與組裝結(jié)果
    2.3 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗表達量分析
    2.4 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗表達量樣本間Venn分析
    2.5 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗表達量樣本間相關性分析
    2.6 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗差異表達分析
    2.7 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗差異表達基因GO富集分析
    2.8 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗差異表達基因KEGG注釋
    2.9 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗相關差異表達基因的q RT-PCR分析驗證
3 討論與結(jié)論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]絲氨酸/甘氨酸代謝在腫瘤中的研究進展[J]. 馬瑞肖,張慧杰,李馨慧,張淑蘭.  現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學. 2020(06)
[2]蘋果莖尖超低溫脫毒體系的建立[J]. 李艷林,渠慎春,欒雨婷,高志紅.  分子植物育種. 2019(09)
[3]脫毒紅芽芋試管芋盆栽種植的農(nóng)藝性狀分析[J]. 鄧接樓,曹昊瑋,李玲,方加軍,肖慈生,肖月土.  分子植物育種. 2019(22)
[4]冷凍脅迫轉(zhuǎn)金柑MLP2–1基因擬南芥的轉(zhuǎn)錄組測序和代謝通路[J]. 滕進婧,李夢蕓,郭純,何瑩,喬克威,楊華.  湖南農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2018(04)
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[6]植物類病毒脫除技術進展[J]. 胡國君,董雅鳳,張尊平,范旭東,任芳,周俊.  植物保護學報. 2017(02)
[7]鉛山紅芽芋產(chǎn)業(yè)發(fā)展概況[J]. 余志平,林海紅,余俊紅,曾廣恒,洪岳善,黃新芳.  長江蔬菜. 2016(20)
[8]舉全縣之力打,造鉛山紅芽芋支柱產(chǎn)業(yè)[J]. 山娜,楊文俊,李斌.  長江蔬菜. 2016(04)
[9]紅芽芋的叢生芽誘導和再生體系建立[J]. 江芹,廖華俊,董玲,陳靜嫻,寧志怨,李衛(wèi)文,許曉婷.  分子植物育種. 2015(03)
[10]紅芽芋營養(yǎng)成分分析及評價[J]. 姜紹通,程元珍,鄭志,潘麗軍.  食品科學. 2012(11)

碩士論文
[1]百子蓮胚性愈傷組織超低溫保存中鈣離子的分布變化及逆境應答機制初探[D]. 何廣深.上海交通大學 2014



本文編號：3230387