大白菜與根腫菌互作相關(guān)蛋白的挖掘
發(fā)布時(shí)間:2021-05-21 15:18
植物與病原物互作能夠引起以水楊酸(salicylic acid, SA)、茉莉酸(jasmonic acid,JA)和乙烯(ethylene, ET)介導(dǎo)的防衛(wèi)反應(yīng)。本研究利用雙向電泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)技術(shù)對(duì)根腫菌侵染的大白菜根系進(jìn)行了差異表達(dá)蛋白分析。試圖找到與防衛(wèi)反應(yīng)有關(guān)的信號(hào)途徑中相關(guān)蛋白,為揭示大白菜抗根腫病作用機(jī)制提供線索,主要研究結(jié)果如下:1.用新鮮的根腫菌侵染大白菜根系,通過顯微壓片觀察技術(shù),在侵染第5天時(shí)觀察到絕大多數(shù)孢子進(jìn)入根毛侵染期,所以將根腫菌接種第5天定為侵染初期。2.通過對(duì)蛋白上樣量及根系用量?jī)?yōu)化試驗(yàn),進(jìn)行大白菜根系蛋白雙向電泳時(shí),最佳蛋白上樣量為1000gg,采用Trizol沉淀法提取蛋白,幼苗根系用量不得少于1.5g。3.通過對(duì)根腫菌侵染和未接菌的大白菜根系蛋白進(jìn)行2-DE凝膠電泳,并經(jīng)PDQuest8.0.1軟分析,得到重復(fù)凝膠圖上的蛋白點(diǎn)均達(dá)400多個(gè)。找出蛋白質(zhì)豐度差異變化在2倍以上差異蛋白點(diǎn)共有48個(gè),選取其中的19個(gè)差異點(diǎn),進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,鑒定成功的差異蛋白點(diǎn)共有18個(gè),它們的Pro...
【文章來源】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 根腫菌及根腫病的概述
1.1.1 根腫菌分類地位及生活史
1.1.2 根腫菌發(fā)病條件及生活史
1.1.3 根腫菌的生理小種
1.2 大白菜抗根腫病遺傳規(guī)律及抗病基因的研究進(jìn)展
1.2.1 大白菜抗根腫病遺傳規(guī)律的研究
1.2.2 大白菜抗根腫病基因的研究進(jìn)展
1.3 植物防衛(wèi)反應(yīng)研究進(jìn)展
1.3.1 植物-病原物互作的防衛(wèi)反應(yīng)中相關(guān)基因的研究進(jìn)展
1.3.2 大白菜-根腫病互作的防衛(wèi)反應(yīng)相關(guān)研究進(jìn)展
1.4 雙向電泳在植物中的應(yīng)用
1.4.1 生物脅迫
1.4.2 非生物脅迫
1.4.3 蛋白質(zhì)組學(xué)在抗病分子機(jī)制研究中的應(yīng)用
1.5 研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 試材
2.1.2 根腫菌來源
2.2 方法
2.2.1 配制根腫菌休眠孢子懸浮液的方法
2.2.2 水培苗的獲得
2.2.3 接菌與觀察
2.2.4 取樣與制備蛋白質(zhì)樣品
2.2.5 雙向電泳(2-DE)
2.2.6 質(zhì)譜鑒定
2.2.7 生物信息學(xué)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 侵染初期的確定
3.2 上樣量對(duì)2-DE圖譜的影響
3.3 大白菜侵染初期根系最佳用量的優(yōu)化
3.4 分析2-DE圖譜及差異蛋白點(diǎn)
3.5 質(zhì)譜鑒定
3.6 生物信息學(xué)分析
3.6.1 Gene Ontology(GO)分析
3.6.2 KEGG分析
3.7 幾個(gè)防衛(wèi)基因的功能預(yù)測(cè)
3.7.1 差異點(diǎn)3414的功能預(yù)測(cè)
3.7.2 差異點(diǎn)3038的功能預(yù)測(cè)
3.7.3 差異點(diǎn)2358的功能預(yù)測(cè)
3.7.4 差異點(diǎn)4043的功能預(yù)測(cè)
3.7.5 差異點(diǎn)3129的功能預(yù)測(cè)
4 討論
4.1 水培接菌及侵染初期的確定
4.2 根腫菌與防衛(wèi)信號(hào)傳導(dǎo)途徑
4.2.1 水楊酸介導(dǎo)的防衛(wèi)反應(yīng)相關(guān)蛋白分析
4.2.2 茉莉酸和乙烯介導(dǎo)的防衛(wèi)反應(yīng)相關(guān)蛋白分析
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于根腫菌早期侵染量的白菜抗性分析[J]. 朱紅麗,肖崇剛,陳國(guó)康,馬冠華,青玲. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(04)
[2]土壤pH值與十字花科作物根腫病相互關(guān)系研究[J]. 黃蓉,黃瑞榮,胡建坤,華菊玲,閔躍中. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(01)
[3]大白菜根系蛋白質(zhì)雙向電泳體系優(yōu)化[J]. 趙玲玲,畢青,周雪,冀瑞琴,馮輝. 分子植物育種. 2015(01)
[4]十字花科白菜根腫病菌在不同溫度、pH值條件下致病性差異研究[J]. 楊明英,楊子林,馬桂明,裴衛(wèi)華,曹繼芬,楊佩文,畢云青,林興華,周麗鳳,李向東. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(04)
[5]油菜根腫病發(fā)病條件初探[J]. 胡瓊,鄭東影,汪春,范洪亮,宋煒,檀根甲. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(04)
[6]云南和西藏十字花科蔬菜根腫病菌生理小種鑒定[J]. 劉峰,張麗輝,姬廣海. 中國(guó)蔬菜. 2013(20)
[7]我國(guó)8省市十字花科蔬菜根腫病菌生理小種的鑒定[J]. 丁云花,簡(jiǎn)元才,余陽(yáng)俊,汪維紅,耿麗華,康俊根. 中國(guó)蔬菜. 2013(16)
[8]湖北省長(zhǎng)陽(yáng)縣十字花科蔬菜根腫病菌生理小種鑒定及抗源篩選[J]. 汪維紅,余陽(yáng)俊,丁云花,張鳳蘭,于拴倉(cāng),張德雙,趙岫云,盧桂香. 中國(guó)蔬菜. 2013(12)
[9]油菜根腫病病原主要生理小種和品種抗病性鑒定[J]. 季海雯,任莉,陳坤榮,徐理,劉凡,孫超超,李俊,劉勝毅,方小平. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2013(03)
[10]大白菜抗根腫病CRb基因緊密連鎖標(biāo)記的開發(fā)與定位[J]. 陳慧慧,張騰,梁珊,陳兵,張椿雨,樸鐘云. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(17)
博士論文
[1]低溫脅迫下野牛草生理生化響應(yīng)及蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 康俊梅.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
碩士論文
[1]大白菜根響應(yīng)根腫菌侵染的基因表達(dá)研究[D]. 譚翀.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]大白菜根腫病抗性基因分子標(biāo)記與定位[D]. 薛銀鴿.鄭州大學(xué) 2014
[3]白菜類作物抗根病種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及分子標(biāo)記輔助選擇[D]. 董森森.鄭州大學(xué) 2014
[4]大白菜抗霜霉病防御信號(hào)途徑中相關(guān)基因的表達(dá)分析[D]. 高婷婷.揚(yáng)州大學(xué) 2013
[5]蕓薹根腫菌生活史研究I[D]. 羅紅春.西南大學(xué) 2013
[6]番茄葉色黃化突變體差異蛋白研究及分析[D]. 徐磊.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3199938
【文章來源】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:54 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
前言
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 根腫菌及根腫病的概述
1.1.1 根腫菌分類地位及生活史
1.1.2 根腫菌發(fā)病條件及生活史
1.1.3 根腫菌的生理小種
1.2 大白菜抗根腫病遺傳規(guī)律及抗病基因的研究進(jìn)展
1.2.1 大白菜抗根腫病遺傳規(guī)律的研究
1.2.2 大白菜抗根腫病基因的研究進(jìn)展
1.3 植物防衛(wèi)反應(yīng)研究進(jìn)展
1.3.1 植物-病原物互作的防衛(wèi)反應(yīng)中相關(guān)基因的研究進(jìn)展
1.3.2 大白菜-根腫病互作的防衛(wèi)反應(yīng)相關(guān)研究進(jìn)展
1.4 雙向電泳在植物中的應(yīng)用
1.4.1 生物脅迫
1.4.2 非生物脅迫
1.4.3 蛋白質(zhì)組學(xué)在抗病分子機(jī)制研究中的應(yīng)用
1.5 研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 試材
2.1.2 根腫菌來源
2.2 方法
2.2.1 配制根腫菌休眠孢子懸浮液的方法
2.2.2 水培苗的獲得
2.2.3 接菌與觀察
2.2.4 取樣與制備蛋白質(zhì)樣品
2.2.5 雙向電泳(2-DE)
2.2.6 質(zhì)譜鑒定
2.2.7 生物信息學(xué)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 侵染初期的確定
3.2 上樣量對(duì)2-DE圖譜的影響
3.3 大白菜侵染初期根系最佳用量的優(yōu)化
3.4 分析2-DE圖譜及差異蛋白點(diǎn)
3.5 質(zhì)譜鑒定
3.6 生物信息學(xué)分析
3.6.1 Gene Ontology(GO)分析
3.6.2 KEGG分析
3.7 幾個(gè)防衛(wèi)基因的功能預(yù)測(cè)
3.7.1 差異點(diǎn)3414的功能預(yù)測(cè)
3.7.2 差異點(diǎn)3038的功能預(yù)測(cè)
3.7.3 差異點(diǎn)2358的功能預(yù)測(cè)
3.7.4 差異點(diǎn)4043的功能預(yù)測(cè)
3.7.5 差異點(diǎn)3129的功能預(yù)測(cè)
4 討論
4.1 水培接菌及侵染初期的確定
4.2 根腫菌與防衛(wèi)信號(hào)傳導(dǎo)途徑
4.2.1 水楊酸介導(dǎo)的防衛(wèi)反應(yīng)相關(guān)蛋白分析
4.2.2 茉莉酸和乙烯介導(dǎo)的防衛(wèi)反應(yīng)相關(guān)蛋白分析
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于根腫菌早期侵染量的白菜抗性分析[J]. 朱紅麗,肖崇剛,陳國(guó)康,馬冠華,青玲. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2015(04)
[2]土壤pH值與十字花科作物根腫病相互關(guān)系研究[J]. 黃蓉,黃瑞榮,胡建坤,華菊玲,閔躍中. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(01)
[3]大白菜根系蛋白質(zhì)雙向電泳體系優(yōu)化[J]. 趙玲玲,畢青,周雪,冀瑞琴,馮輝. 分子植物育種. 2015(01)
[4]十字花科白菜根腫病菌在不同溫度、pH值條件下致病性差異研究[J]. 楊明英,楊子林,馬桂明,裴衛(wèi)華,曹繼芬,楊佩文,畢云青,林興華,周麗鳳,李向東. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(04)
[5]油菜根腫病發(fā)病條件初探[J]. 胡瓊,鄭東影,汪春,范洪亮,宋煒,檀根甲. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(04)
[6]云南和西藏十字花科蔬菜根腫病菌生理小種鑒定[J]. 劉峰,張麗輝,姬廣海. 中國(guó)蔬菜. 2013(20)
[7]我國(guó)8省市十字花科蔬菜根腫病菌生理小種的鑒定[J]. 丁云花,簡(jiǎn)元才,余陽(yáng)俊,汪維紅,耿麗華,康俊根. 中國(guó)蔬菜. 2013(16)
[8]湖北省長(zhǎng)陽(yáng)縣十字花科蔬菜根腫病菌生理小種鑒定及抗源篩選[J]. 汪維紅,余陽(yáng)俊,丁云花,張鳳蘭,于拴倉(cāng),張德雙,趙岫云,盧桂香. 中國(guó)蔬菜. 2013(12)
[9]油菜根腫病病原主要生理小種和品種抗病性鑒定[J]. 季海雯,任莉,陳坤榮,徐理,劉凡,孫超超,李俊,劉勝毅,方小平. 中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2013(03)
[10]大白菜抗根腫病CRb基因緊密連鎖標(biāo)記的開發(fā)與定位[J]. 陳慧慧,張騰,梁珊,陳兵,張椿雨,樸鐘云. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(17)
博士論文
[1]低溫脅迫下野牛草生理生化響應(yīng)及蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 康俊梅.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
碩士論文
[1]大白菜根響應(yīng)根腫菌侵染的基因表達(dá)研究[D]. 譚翀.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]大白菜根腫病抗性基因分子標(biāo)記與定位[D]. 薛銀鴿.鄭州大學(xué) 2014
[3]白菜類作物抗根病種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及分子標(biāo)記輔助選擇[D]. 董森森.鄭州大學(xué) 2014
[4]大白菜抗霜霉病防御信號(hào)途徑中相關(guān)基因的表達(dá)分析[D]. 高婷婷.揚(yáng)州大學(xué) 2013
[5]蕓薹根腫菌生活史研究I[D]. 羅紅春.西南大學(xué) 2013
[6]番茄葉色黃化突變體差異蛋白研究及分析[D]. 徐磊.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3199938
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