發(fā)布時(shí)間：2021-05-14 12:45

　　枇杷（Eriobotrya japonica Lindl.）起源于我國東南部,是中國特色水果,具有極高醫(yī)療保健價(jià)值,栽培歷史悠久,品種繁多,與其他國家相比我國枇杷種質(zhì)資源更為豐富。但目前對(duì)枇杷的遺傳研究及基因組信息研究較少,因此我們需要對(duì)枇杷進(jìn)行更深一步的分子基因組研究,為其種質(zhì)資源分類、遺傳多樣性分析及分子標(biāo)記輔助選育等研究奠定基礎(chǔ)。本試驗(yàn)通過對(duì)洞庭枇杷的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行大規(guī)模測序,利用獲得的轉(zhuǎn)錄組序列進(jìn)行EST-SSR分子標(biāo)記的開發(fā),將開發(fā)的標(biāo)記進(jìn)行枇杷及其近緣物種間的通用性分析和遺傳多樣性分析,并對(duì)洞庭野生型和突變型枇杷進(jìn)行特異EST-SSR片段克隆進(jìn)而對(duì)其差異基因進(jìn)行探討,主要研究結(jié)果如下：1.我們總共獲得61587個(gè)Unigene,對(duì)其進(jìn)行微衛(wèi)星搜索,得到6693個(gè)Unigene包含7649個(gè)SSR位點(diǎn)。在對(duì)SSR位點(diǎn)進(jìn)行重復(fù)類型統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),在二核苷酸到六核苷酸之間,重復(fù)類型最多的是二核苷酸其數(shù)量總計(jì)4593,占所有重復(fù)類型的60.05%;最少的重復(fù)類型是五核苷酸,占總數(shù)的2.08%。在對(duì)重復(fù)類型最多的序列進(jìn)行統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),重復(fù)序列中出現(xiàn)頻率最高的是二核苷酸重復(fù)類型中的AG/CT,占所有... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：63 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
縮略詞匯
前言
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 遺傳標(biāo)記
        1.1.1 遺傳標(biāo)記類型
        1.1.2 分子標(biāo)記的分類
    1.2 枇杷分子標(biāo)記的研究
        1.2.1 枇杷種質(zhì)資源概述
        1.2.2 分子標(biāo)記在枇杷種質(zhì)資源上的研究
    1.3 SSR標(biāo)記的開發(fā)及利用現(xiàn)狀
        1.3.1 SSR分子標(biāo)記的原理及特點(diǎn)
        1.3.2 SSR分子標(biāo)記的開發(fā)分析路線
        1.3.3 SSR分子標(biāo)記的研究現(xiàn)狀
2 試驗(yàn)?zāi)康呐c意義
3 材料與方法
    3.1 試驗(yàn)材料
    3.2 主要儀器設(shè)備
    3.3 試驗(yàn)方法
        3.3.1 DNA的提取
        3.3.2 轉(zhuǎn)錄組微衛(wèi)星搜索及SSR引物設(shè)計(jì)
        3.3.3 SSR分子標(biāo)記擴(kuò)增
        3.3.4 枇杷SSR標(biāo)記通用性及遺傳多樣性分析
        3.3.5 特異EST-SSR片段的獲取
        3.3.6 特異EST-SSR片段的純化
        3.3.7 目的片段連接與轉(zhuǎn)化
        3.3.8 重組菌落PCR鑒定
        3.3.9 質(zhì)粒提取及測序分析
4 結(jié)果與分析
    4.1 DNA提取結(jié)果分析
    4.2 轉(zhuǎn)錄組SSR信息搜索及SSR引物確定
        4.2.1 轉(zhuǎn)錄組SSR信息分析
        4.2.2 EST-SSR引物確定
        4.2.3 EST-SSR引物的篩選
    4.3 枇杷EST-SSR分子標(biāo)記通用性及遺傳多樣性分析
        4.3.1 通用性分析
        4.3.2 遺傳多樣性分析
    4.4 特異EST-SSR片段克隆測序分析
        4.4.1 特異EST-SSR片段的確定
        4.4.2 質(zhì)粒純度檢測分析
        4.4.3 特異EST-SSR片段序列分析
5 討論
    5.1 DNA提取方法
    5.2 引物篩選及通用性研究
    5.3 遺傳多樣性研究
    5.4 特異EST-SSR片段測序研究
6 總結(jié)
    6.1 主要結(jié)論
        6.1.1 枇杷轉(zhuǎn)錄組信息搜索
        6.1.2 枇杷EST-SSR分子標(biāo)記獲得
        6.1.3 分子標(biāo)記通用性及遺傳多樣性研究
        6.1.4 特異EST-SSR片段測序結(jié)果
    6.2 存在的問題及不足
    6.3 今后研究方向
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]枇杷種質(zhì)資源SSR標(biāo)記指紋圖譜的構(gòu)建[J]. 岳娜,胡倩倩,方星,邱學(xué)林,儲(chǔ)春榮,祁紅麗,孟祥勛.  中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(16)
[2]福建道地藥材枇杷葉ISSR反應(yīng)體系的建立與優(yōu)化[J]. 李婷,徐榕青,林文津,張亞敏.  中國現(xiàn)代應(yīng)用藥學(xué). 2012(04)
[3]枇杷SSR反應(yīng)體系的建立及優(yōu)化[J]. 謝麗雪,張小艷,張立杰,鄭姍,李韜.  福建果樹. 2011(04)
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[9]EST-SSR熒光標(biāo)記毛細(xì)管電泳檢測法在豌豆上的應(yīng)用及評(píng)價(jià)[J]. 龔亞明,胡齊贊,毛偉華,李亞丹,張古文,丁桔.  浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2009(06)
[10]利用SSR標(biāo)記分析部分煙草種質(zhì)的遺傳多樣性[J]. 劉勝傳,劉仁祥,雷紅梅,陳春艷.  貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(07)

博士論文
[1]基于AFLP和SSR分子標(biāo)記的中國楊梅遺傳多樣性分析[D]. 張水明.浙江大學(xué) 2009
[2]柑橘胚胎發(fā)生過程中DNA甲基化/去甲基化研究及SSR標(biāo)記開發(fā)[D]. 孟海軍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[3]枇杷屬的等位酶遺傳多樣性和種間關(guān)系及品種鑒定研究[D]. 蔡禮鴻.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2000

碩士論文
[1]枇杷屬植物的遺傳多樣性分析和指紋圖譜初步構(gòu)建[D]. 龍治堅(jiān).西南大學(xué) 2013
[2]枇杷葉的ISSR遺傳差異分析及化學(xué)成分含量相關(guān)性研究[D]. 李婷.福建中醫(yī)藥大學(xué) 2011
[3]蘋果EST-SSR引物的開發(fā)及部分品種親緣關(guān)系分析[D]. 王娟.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[4]蘋果抗褐斑病性遺傳分析與SSR分子標(biāo)記[D]. 壽園園.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[5]白沙枇杷離體再生及ISSR分子標(biāo)記研究[D]. 范晨昕.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[6]蘋果屬EST-SSR標(biāo)記開發(fā)及其在梨屬上的轉(zhuǎn)移性[D]. 姚利華.浙江大學(xué) 2008
[7]白沙枇杷優(yōu)良單株—蘇白1號(hào)的選育及其分子鑒定[D]. 盛良明.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[8]桃、李、杏、核桃不同品種的SSR指紋圖譜構(gòu)建[D]. 楊本蕓.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006



本文編號(hào)：3185663