以人工種植的商品松茸子實體為對象,利用Illumina Novaseq 6000測序平臺對松茸子實體進行轉(zhuǎn)錄組測序,并通過生物信息學(xué)手段對松茸轉(zhuǎn)錄組進行注釋和分析.基于9個松茸樣品的測序共獲得76.38 Gb的數(shù)據(jù)量,組裝得到的轉(zhuǎn)錄本和unigene個數(shù)分別為26 285和87 174.將獲得的unigene與6大功能數(shù)據(jù)庫進行比對,共有19 964個unigene得到注釋.基于GO和KEGG數(shù)據(jù)庫的注釋和分析,松茸子實體unigene被注釋和劃分為45個和28個功能類別.在松茸子實體中,涉及unigene數(shù)量最多的生理過程包括碳水化合物代謝、運輸和分解代謝、氨基酸代謝等.結(jié)果表明,松茸子實體中代謝旺盛,應(yīng)采取合理措施以延緩其品質(zhì)下降.松茸子實體的轉(zhuǎn)錄組測序?qū)槠涔δ芑虻耐诰蛞约安珊笃焚|(zhì)變化機制的研究提供重要遺傳數(shù)據(jù)和參考. 

【文章來源】：成都大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,39(02)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
0 引 言
1 材料與方法
    1.1 材 料
    1.2 儀 器
    1.3 方 法
        1.3.1 松茸子實體總RNA提取
        1.3.2 松茸子實體RNA測序
        1.3.3 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)處理
        1.3.4 unigene功能注釋
2 結(jié)果與分析
    2.1 松茸子實體RNA測序數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測
    2.2 松茸子實體轉(zhuǎn)錄組的從頭組裝
    2.3 松茸子實體unigene的功能注釋及分類
        2.3.1 同源物種比對分析
        2.3.2 GO功能注釋和分類
        2.3.3 KOG功能分類
        2.3.4 KEGG通路注釋
3 結(jié) 論


【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3170170