‘秦冠’蘋果遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及褐斑病抗性基因的定位
發(fā)布時(shí)間:2021-04-25 02:06
我國(guó)是世界上最大的蘋果生產(chǎn)國(guó)和消費(fèi)國(guó),在世界蘋果產(chǎn)業(yè)中占有舉足輕重的地位。蘋果褐斑。∕arssonina Leaf Blotch)是我國(guó)蘋果生產(chǎn)中的主要病害之一。目前,生產(chǎn)上對(duì)蘋果褐斑病的防治以化學(xué)防治為主。然而,隨著抗藥性菌株的出現(xiàn)以及環(huán)境保護(hù)和食品安全問題的日益加重,藥劑防治的難度和使用風(fēng)險(xiǎn)也與日俱增。為此挖掘蘋果褐斑病抗性品種中的抗病基因,選育抗病品種,是控制蘋果褐斑病最經(jīng)濟(jì)有效的手段。本研究以蘋果褐斑病高抗品種‘秦冠’和易感品種‘長(zhǎng)富2號(hào)’及其雜交后代為試材,構(gòu)建‘秦冠’蘋果的高密度SNP遺傳連鎖圖譜,進(jìn)行褐斑病抗性相關(guān)基因座的定位和候選基因的篩選,旨在利用現(xiàn)代分子生物學(xué)和生物信息學(xué)技術(shù),為挖掘‘秦冠’蘋果褐斑病抗性相關(guān)的關(guān)鍵基因奠定基礎(chǔ)。獲得的主要結(jié)果如下:1. 依據(jù)2018年田間定植的蘋果雜交群體植株的抗病分級(jí)結(jié)果,選擇極端抗病和極端感病的F1代各17株。通過對(duì)216對(duì)SSR標(biāo)記進(jìn)行多態(tài)性和重復(fù)性檢測(cè),篩選出58對(duì)在‘秦冠’中表現(xiàn)為雜合且均勻分布在蘋果基因組上的多態(tài)性SSR標(biāo)記。利用基因組掃描方法(GSA)對(duì)親本和極端表型后代進(jìn)行檢測(cè),通過卡方檢驗(yàn)分...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 蘋果褐斑病的研究概況
1.1.1 蘋果褐斑病的分類學(xué)與病原學(xué)
1.1.2 蘋果褐斑病的生物學(xué)與流行病學(xué)
1.1.3 M.coronaria與寄主的相互作用研究
1.1.4 蘋果褐斑病的防治與抗性育種
1.2 蘋果遺傳圖譜構(gòu)建和QTL定位研究進(jìn)展
1.2.1 分子標(biāo)記技術(shù)
?芯片"> 1.2.2 蘋果20K SNP Illumina Infinium?芯片
1.2.3 蘋果遺傳連鎖圖譜的研究進(jìn)展
1.2.4 蘋果主要性狀QTL定位的研究進(jìn)展
1.3 本研究的目的與意義
第二章 ‘秦冠’蘋果褐斑病抗性相關(guān)基因座的預(yù)測(cè)(GSA)
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 褐斑病田間發(fā)病情況調(diào)查
2.2.2 基因組DNA的提取和檢測(cè)
2.2.3 GSA-SSR引物篩選
2.2.4 GSA-SSR分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 褐斑病田間發(fā)病情況調(diào)查
2.3.2 基因組DNA的質(zhì)量檢測(cè)
2.3.3 GSA-SSR多態(tài)性標(biāo)記篩選
2.3.4 GSA-SSR分析
2.4 討論與小結(jié)
2.4.1 討論
2.4.2 小結(jié)
第三章 ‘秦冠’蘋果遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 基因組DNA的提取與檢測(cè)
?芯片檢測(cè)"> 3.2.2 蘋果20K SNP Illumina Infinium?芯片檢測(cè)
3.2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 ‘秦冠’蘋果遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.3.2 ‘長(zhǎng)富2號(hào)’蘋果遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.4 討論與小結(jié)
3.4.1 討論
3.4.2 小結(jié)
第四章 ‘秦冠’蘋果褐斑病抗性相關(guān)QTL的定位
4.1 試驗(yàn)材料
4.2 試驗(yàn)方法
4.2.1 表型檢測(cè)
4.2.2 QTL定位
4.2.3 候選基因篩選
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 褐斑病抗性相關(guān)表型性狀調(diào)查
4.3.2 褐斑病抗性相關(guān)的QTL定位
4.3.3 候選基因的篩選與驗(yàn)證
4.3.4 候選基因?qū)职卟〗臃N的響應(yīng)
4.4 討論與小結(jié)
4.4.1 討論
4.4.2 小結(jié)
第五章 結(jié)論和創(chuàng)新點(diǎn)
5.1 結(jié)論
5.2 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
縮略詞
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蘋果樹早期落葉病綜合防治技術(shù)[J]. 程守云,周吉生,周中磊,張耀峰. 山西果樹. 2019(05)
[2]DNA分子標(biāo)記技術(shù)的研究與應(yīng)用[J]. 陳星,高子厚. 分子植物育種. 2019(06)
[3]蘋果遺傳圖譜的構(gòu)建與QTL定位研究進(jìn)展[J]. 陶紅霞,張軍科. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2015(06)
[4]蘋果果實(shí)輪紋病抗病性QTL定位及相關(guān)基因的初步預(yù)測(cè)[J]. 崔鎂沙,莊艷,申飛,楊麗麗,王憶,吳婷,趙永波,李春敏,韓月澎,陳東玫,楊鳳秋,張新忠,韓振海. 果樹學(xué)報(bào). 2014(05)
[5]我國(guó)蘋果主要病害研究進(jìn)展與病害防治中的問題[J]. 李保華,王彩霞,董向麗. 植物保護(hù). 2013(05)
[6]中國(guó)主要蘋果種質(zhì)抗褐斑病評(píng)價(jià)[J]. 黃園,張榮,朱剛,張麗娜,孫廣宇. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(08)
[7]溫度和濕度對(duì)越冬后蘋果褐斑病菌產(chǎn)孢的影響[J]. 高月娥,李保華,董向麗,王彩霞,李桂舫,李寶篤. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(07)
[8]單核苷酸多態(tài)性的發(fā)掘、鑒定及其在果樹上應(yīng)用的研究進(jìn)展[J]. 魏召新,張凌云,曾培,李翀,鐘廣炎. 中國(guó)南方果樹. 2010(03)
[9]蘋果雜交F1代抗褐斑病遺傳趨勢(shì)及抗性選擇研究[J]. 黨志國(guó),趙政陽,萬怡震,高華,王雷存,祁楠. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(05)
[10]蘋果盤二孢的分離培養(yǎng)研究[J]. 趙華,黃麗麗,謝芳芹,康振生. 菌物學(xué)報(bào). 2009(04)
博士論文
[1]干旱條件下蘋果水分利用效率相關(guān)性狀的QTL定位和候選基因的篩選與鑒定[D]. 王海波.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]蘋果高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建與重要果實(shí)品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 孫瑞.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]蘋果屬資源對(duì)蘋果褐斑病的抗性機(jī)理及抗性誘導(dǎo)研究[D]. 殷麗華.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[4]蘋果褐斑病病原學(xué)、組織細(xì)胞學(xué)和化學(xué)防治研究[D]. 趙華.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
碩士論文
[1]蘋果抗褐斑病性遺傳分析與SSR分子標(biāo)記[D]. 壽園園.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[2]秦冠、富士蘋果早期落葉病抗性比較研究[D]. 黨志國(guó).西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
本文編號(hào):3158494
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 蘋果褐斑病的研究概況
1.1.1 蘋果褐斑病的分類學(xué)與病原學(xué)
1.1.2 蘋果褐斑病的生物學(xué)與流行病學(xué)
1.1.3 M.coronaria與寄主的相互作用研究
1.1.4 蘋果褐斑病的防治與抗性育種
1.2 蘋果遺傳圖譜構(gòu)建和QTL定位研究進(jìn)展
1.2.1 分子標(biāo)記技術(shù)
?芯片"> 1.2.2 蘋果20K SNP Illumina Infinium?芯片
1.2.3 蘋果遺傳連鎖圖譜的研究進(jìn)展
1.2.4 蘋果主要性狀QTL定位的研究進(jìn)展
1.3 本研究的目的與意義
第二章 ‘秦冠’蘋果褐斑病抗性相關(guān)基因座的預(yù)測(cè)(GSA)
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 褐斑病田間發(fā)病情況調(diào)查
2.2.2 基因組DNA的提取和檢測(cè)
2.2.3 GSA-SSR引物篩選
2.2.4 GSA-SSR分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 褐斑病田間發(fā)病情況調(diào)查
2.3.2 基因組DNA的質(zhì)量檢測(cè)
2.3.3 GSA-SSR多態(tài)性標(biāo)記篩選
2.3.4 GSA-SSR分析
2.4 討論與小結(jié)
2.4.1 討論
2.4.2 小結(jié)
第三章 ‘秦冠’蘋果遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 基因組DNA的提取與檢測(cè)
?芯片檢測(cè)"> 3.2.2 蘋果20K SNP Illumina Infinium?芯片檢測(cè)
3.2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 ‘秦冠’蘋果遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.3.2 ‘長(zhǎng)富2號(hào)’蘋果遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
3.4 討論與小結(jié)
3.4.1 討論
3.4.2 小結(jié)
第四章 ‘秦冠’蘋果褐斑病抗性相關(guān)QTL的定位
4.1 試驗(yàn)材料
4.2 試驗(yàn)方法
4.2.1 表型檢測(cè)
4.2.2 QTL定位
4.2.3 候選基因篩選
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 褐斑病抗性相關(guān)表型性狀調(diào)查
4.3.2 褐斑病抗性相關(guān)的QTL定位
4.3.3 候選基因的篩選與驗(yàn)證
4.3.4 候選基因?qū)职卟〗臃N的響應(yīng)
4.4 討論與小結(jié)
4.4.1 討論
4.4.2 小結(jié)
第五章 結(jié)論和創(chuàng)新點(diǎn)
5.1 結(jié)論
5.2 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
縮略詞
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蘋果樹早期落葉病綜合防治技術(shù)[J]. 程守云,周吉生,周中磊,張耀峰. 山西果樹. 2019(05)
[2]DNA分子標(biāo)記技術(shù)的研究與應(yīng)用[J]. 陳星,高子厚. 分子植物育種. 2019(06)
[3]蘋果遺傳圖譜的構(gòu)建與QTL定位研究進(jìn)展[J]. 陶紅霞,張軍科. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2015(06)
[4]蘋果果實(shí)輪紋病抗病性QTL定位及相關(guān)基因的初步預(yù)測(cè)[J]. 崔鎂沙,莊艷,申飛,楊麗麗,王憶,吳婷,趙永波,李春敏,韓月澎,陳東玫,楊鳳秋,張新忠,韓振海. 果樹學(xué)報(bào). 2014(05)
[5]我國(guó)蘋果主要病害研究進(jìn)展與病害防治中的問題[J]. 李保華,王彩霞,董向麗. 植物保護(hù). 2013(05)
[6]中國(guó)主要蘋果種質(zhì)抗褐斑病評(píng)價(jià)[J]. 黃園,張榮,朱剛,張麗娜,孫廣宇. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(08)
[7]溫度和濕度對(duì)越冬后蘋果褐斑病菌產(chǎn)孢的影響[J]. 高月娥,李保華,董向麗,王彩霞,李桂舫,李寶篤. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(07)
[8]單核苷酸多態(tài)性的發(fā)掘、鑒定及其在果樹上應(yīng)用的研究進(jìn)展[J]. 魏召新,張凌云,曾培,李翀,鐘廣炎. 中國(guó)南方果樹. 2010(03)
[9]蘋果雜交F1代抗褐斑病遺傳趨勢(shì)及抗性選擇研究[J]. 黨志國(guó),趙政陽,萬怡震,高華,王雷存,祁楠. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(05)
[10]蘋果盤二孢的分離培養(yǎng)研究[J]. 趙華,黃麗麗,謝芳芹,康振生. 菌物學(xué)報(bào). 2009(04)
博士論文
[1]干旱條件下蘋果水分利用效率相關(guān)性狀的QTL定位和候選基因的篩選與鑒定[D]. 王海波.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]蘋果高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建與重要果實(shí)品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 孫瑞.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]蘋果屬資源對(duì)蘋果褐斑病的抗性機(jī)理及抗性誘導(dǎo)研究[D]. 殷麗華.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[4]蘋果褐斑病病原學(xué)、組織細(xì)胞學(xué)和化學(xué)防治研究[D]. 趙華.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
碩士論文
[1]蘋果抗褐斑病性遺傳分析與SSR分子標(biāo)記[D]. 壽園園.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[2]秦冠、富士蘋果早期落葉病抗性比較研究[D]. 黨志國(guó).西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
本文編號(hào):3158494
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