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黃瓜擴(kuò)張素蛋白基因CsEXPb1的克隆及功能研究

發(fā)布時(shí)間:2021-03-24 01:25
  黃瓜(Cucumis sativus L.)是市場(chǎng)需求量較大的蔬菜作物之一,然而在設(shè)施栽培中特別是反季節(jié)栽培中,由于濕度大、溫度低、雄花少、病害嚴(yán)重等不利因素嚴(yán)重影響了黃瓜的生長(zhǎng)及產(chǎn)量,造成經(jīng)濟(jì)損失。因此,研究黃瓜果實(shí)發(fā)育機(jī)理、多方面增強(qiáng)黃瓜生長(zhǎng)勢(shì)、增加座果率有利于切實(shí)解決生產(chǎn)中所存在的問(wèn)題。植物生長(zhǎng)發(fā)育是受多類基因調(diào)控的復(fù)雜過(guò)程,其中有一類擴(kuò)張蛋白基因(expansin)作用于植物細(xì)胞壁,通過(guò)引起細(xì)胞壁松弛促進(jìn)細(xì)胞伸展與分裂。多年來(lái),關(guān)于擴(kuò)張蛋白影響植物生長(zhǎng)發(fā)育的報(bào)道越來(lái)越多。本研究在對(duì)黃瓜果實(shí)轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的基礎(chǔ)上發(fā)現(xiàn)了在果實(shí)發(fā)育過(guò)程中差異表達(dá)的Csa5M561760.1基因,且屬于β-expansin基因家族。GeneBank登錄號(hào)為 XP011655449,本研究克隆了此基因,將之命名為CsEXPb1,并開(kāi)展了此基因相關(guān)的功能研究,主要研究?jī)?nèi)容及結(jié)果如下:1.黃瓜擴(kuò)張素蛋白基因CsEXPb1的克隆及表達(dá)分析本研究以黃瓜品種’EC1’雌花cDNA、雄花cDNA以及葉片總DNA為模板,克隆得到目的基因,全長(zhǎng)942 bp,其中開(kāi)放閱讀框(ORF)長(zhǎng)度為549 bp,共編碼182個(gè)氨基酸... 

【文章來(lái)源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

黃瓜擴(kuò)張素蛋白基因CsEXPb1的克隆及功能研究


圖2-1?pGreen〇〇29載體質(zhì)粒圖譜??

雄花,雌花,電泳圖,基因


用基因克隆引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以PMD19-T為克隆載體,將目的基因片段純化后用??T4連接酶和酶切開(kāi)的載體連接,導(dǎo)入大腸桿菌D/7知,測(cè)序,提取質(zhì)粒,PCR擴(kuò)增檢??測(cè)(圖2-2),3個(gè)條帶長(zhǎng)度相同。檢索黃瓜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)現(xiàn)目的基因全長(zhǎng)942?bp,??包含250?bp?5'端非翻譯區(qū),549?bp開(kāi)放閱讀框(0RF),143?bp?3'端非翻譯區(qū),共編??碼182個(gè)氨基酸(圖2-3),與黃瓜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)基因編碼區(qū)序列完??全一致,表明己經(jīng)成功獲得目的基因,且整個(gè)ORF區(qū)域全部為外顯子,不含內(nèi)含子。??|?■一2000??■—1000???750??—500??圖2-2?基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖??1:?‘EC1,雌花?cDNA;?2:?‘EC1,雄花?cDNA;?3:葉片總?DNA;?M:?2000?bp?mark。??Fig.?2-2?Agarosegel?electrophoresis?of?PCR?amplication?product?of?CsEXPbl?gene??29??

系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析,蛋白,親水性


個(gè)堿性氨基酸(精氨酸和賴氨酸),不穩(wěn)定系數(shù)為32.87,為穩(wěn)定蛋白。??ExPasy分析該蛋白的疏水性結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)蛋白大部分|><域表現(xiàn)為親水性(score大于??1.5的是疏水部分,<0的是親水部分),說(shuō)明此蛋白為親水性蛋白(


本文編號(hào):3096782

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