大球蓋菇Stropharia rugosoannulata是一種具有較強木質(zhì)纖維素降解能力以及高營養(yǎng)的重要食用菌。此菌屬于四極性異宗結(jié)合擔(dān)子菌,但是交配型位點結(jié)構(gòu)仍未被解析。本研究利用基因組數(shù)據(jù)通過生物信息學(xué)方法進行大球蓋菇的A和B交配型位點解析,并與其他大型真菌進行比較。結(jié)果顯示大球蓋菇的A交配型位點包含了一對保守的HD1和HD2基因,位點上下游基因的共線性較高,與Galerina patagonica和磚紅韌黑傘Hypholoma sublateritium相似度最高,A位點結(jié)構(gòu)上也較為保守,在上下游具有保守的MIP、Sec61蛋白、甘氨酸脫氫酶和β側(cè)翼蛋白。B位點包含5個信息素受體和3個信息素前體基因,與其他真菌相比較發(fā)現(xiàn),B位點及上下游基因的共線性較差,表明在不同的真菌中B位點變異性較大。本研究所獲得的結(jié)果將有助于詮釋大球蓋菇交配型位點結(jié)構(gòu),為今后的遺傳育種提供了理論依據(jù)。 

【文章來源】：菌物學(xué)報. 2020,39(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

大球蓋菇A交配型位點的結(jié)構(gòu)

通過共線性分析發(fā)現(xiàn)，不同真菌B交配型上下游基因的共線性較差，信息素前體和信息素受體橫跨的區(qū)域在大球蓋菇、磚紅韌黑傘、Galerina patagonica和灰蓋鬼傘分別為9 476bp、5 867bp、7 770bp和48 995bp，在草菇基因組中跨度最大，僅僅在同一個scaffold上的PP1-STE3之間就達到了76 748bp。雖然它們之間的共線性相對較差，但是大球蓋菇與磚紅韌黑傘相似度更近，與灰蓋鬼傘相比，結(jié)構(gòu)組成完全不同，可見親緣關(guān)系越近，共線性越好。圖3 大球蓋菇信息素前體的多序列比對

大球蓋菇信息素前體的多序列比對


本文編號：3096746