組蛋白乙�；揎椩诨虮磉_(dá)調(diào)控方面扮演著重要角色。為深入挖掘番茄組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶（HAT）基因,本研究運(yùn)用生物信息學(xué)方法,共鑒定出26個番茄HAT。聚類分析發(fā)現(xiàn),這些HAT可以分為7組,分別為HAG、HAG1、HAG2、MCC1、HAM、HAF和HAC。其中,GNAT家族（GCN5、HAT1、MCC1） 18個、p300/CBP家族4個、MYST和TAFII250家族各1個。6對同源基因Ka/Ks值均小于1,說明其進(jìn)化中經(jīng)歷了純化選擇。不同家族HAT理化性質(zhì)存在差異,但均為親水蛋白質(zhì),主要定位于細(xì)胞核,蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)主要包括α螺旋和無規(guī)則卷曲,具有典型的保守基序和特征結(jié)構(gòu)域。染色體定位發(fā)現(xiàn),番茄HAT基因不均勻地散布于12條染色體上,且呈兩端分布,其中1號和9號染色體最多,部分基因經(jīng)串聯(lián)重復(fù)形成基因簇�；虮磉_(dá)分析發(fā)現(xiàn),GNAT家族番茄特有的HAT和HAG2組基因在病菌、鹽和熱脅迫下具有較高的表達(dá)水平,一些基因具有病菌誘導(dǎo)特異性和耐鹽（熱）與鹽（熱）敏材料上表達(dá)差異性�？梢�,番茄HAT在結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和功能上具有多樣性,其在全基因組水平上的鑒定與分析為相關(guān)基因克隆利用提供了依據(jù)。 

【文章來源】：江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2020,36(03)北大核心

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

番茄和擬南芥組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HAT)系統(tǒng)發(fā)生樹

基因結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),GNAT家族基因整體較小、外顯子數(shù)較少,Solyc10g045390.2.1基因較大但氨基酸數(shù)較少,推測主要由非編碼區(qū)組成;而MYST、TAFII250和p300/CBP家族基因較大、外顯子數(shù)較多。GNAT家族基因主要是1/2位內(nèi)含子,MYST是0/1位內(nèi)含子,TAFII250和p300/CBP是0/1/2位內(nèi)含子,同時,部分基因的部分外顯子為非對稱外顯子(圖3)�；蚍治霭l(fā)現(xiàn),20個蛋白質(zhì)保守基序大小為21～50,不同家族HAT所含基序種類不同,如GNAT組1主要含Motif 1、Motif 7、Motif 8和Motif 17,GNAT組2主要含Motif 14、Motif 18和Motif 19;MYST和TAFII250家族與GNAT組2相似;p300/CBP家族主要含Motif2～Motif6、Motif 9～Motif 13、Motif 15～Motif 16和Motif 20,同一家族成員存在基序丟失情況。另外,不同家族HAT具有典型的特征結(jié)構(gòu)域,如GNAT家族的Acetyltransf_1和Hat1_N,MYST家族的zf-MYST和MOZ_SAS,p300/CBP家族的HAT_KAT11和zf-TAZ。圖3 番茄組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HAT)基因結(jié)構(gòu)

番茄組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HAT)基因結(jié)構(gòu)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3071794