絲瓜種質資源性狀調(diào)查及遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2021-03-05 14:01
我國絲瓜地方品種在市場中占主導地位,雜交品種較少。近幾年,我國開始重視對雜交品種的選育。通過利用形態(tài)學標記和分子標記對絲瓜親緣關系進行分析是一種有效的輔助育種手段。本試驗以高度純化、性狀穩(wěn)定的60份絲瓜自交系為試驗材料,調(diào)查16個田間農(nóng)藝性狀,分析其遺傳多樣性;在優(yōu)化絲瓜SRAP、ISSR分子標記反應體系的基礎上,對60份絲瓜種質資源進行SRAP、ISSR分子標記,對遺傳多樣性和親緣關系進行分析,構建遺傳聚類圖,鑒定絲瓜種質資源間的親緣遠近,為絲瓜種質資源鑒定、分類和絲瓜的雜交育種提供參考依據(jù)。主要研究結果如下:1.60份絲瓜材料田間農(nóng)藝性狀調(diào)查分析對60份絲瓜材料的16個農(nóng)藝性狀進行田間觀察分析:60份絲瓜種質資源變異系數(shù)范圍在0%-111%;多樣性信息指數(shù)在0-2.037。在16個性狀中,有10個質量性狀,6個數(shù)量性狀。在10個質量性狀中,多樣性指數(shù)最大的是瓜形,為1.371,最小的是葉形,為0。在6個數(shù)量性狀中,瓜把長多樣性指數(shù)最大,為2.037。第一雌花節(jié)位多樣性指數(shù)最小,為1.824。結果表明:各個材料之間的變異系數(shù)和多樣性指數(shù)各不相同,但總體上60份絲瓜的變異程度和多樣性較...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1.60份DNA模板??Fig3-1.60DNA?Template??注:l-60為試驗材料,見表2-1??
為].75?U、1.5?U、1.25?U、].0U、0.75?U、0.5?U、0.25?U。由圖?3-2?可知,在??25?pL的反應體系中,Taq酶濃度在0.25?U、0.5?U、0.75?U、1.0?U時,擴增條帶??清晰度差,亮度不高。當濃度達到1.25U時,亮度增加,條帶清晰。本著擴增??數(shù)量適當、清晰度強、經(jīng)濟性的原則,當Taq酶濃度達到].25?U時反應體系達??到最佳水平。??M?1?2?3?4?5?6?7??::霸??75〇bp??s〇〇bp??:SBBBm??圖3-2.不同Taq酶濃度的SRAP-PCR結果??Fig3-2.effect?of?various?Taq?polymerase?concentrations?in?the?SRAP-PCR??注:1-7?為?1.75、1.5、1.25、丨?0、0.75、0.5、0.25(U)?IVI:?DL2000Marker??2.2.2模板DNA濃度對PCR結果的影響??模板DNA濃度對PCR結果有著一定的影響,當模板DNA濃度過高時,比??較容易出現(xiàn)非特異性擴增反應,有的還會導致拖尾,沒有PCR條帶的現(xiàn)象。模??板DNA濃度過低同樣也是不行的,濃度過低則目的產(chǎn)物會過少[6?]。圖3-3中能??夠發(fā)現(xiàn),當濃度在5?ng、12.5?ng時條帶亮度極低,清晰度弱。從圖3-3可以看出,??DNA濃度在75?ng時,模板DNA條帶亮度強,條帶清晰,考慮到試驗準確性和??不浪費實驗藥劑的情況下,濃度為75?ng的DNA最適宜絲瓜25?fxL?SRAP擴增。??22??
?福建農(nóng)林大學碩士專業(yè)學位論文???M?1?2?3?4?5?6??yi??444??圖3-3.不同濃度DMA的SRAP-PCR結果??Fig3-3.effect?of?various?template?DNA?concentrations?in?the?SRAP-PCR??注:1-6?為?5、12.5、25、50、75、100(ng)?M:?DL2000Marker??2.2.3?dN。袑Γ樱遥粒校校茫覕U増的影響??dNTP影響PCR的擴增結果和效率。在PCR反應過程中,PCR產(chǎn)物的量受到??dNTP濃度影響,dNTP濃度過低會使得PCR產(chǎn)物的量減少,高濃度dNTP就容易引??起錯誤滲入,不利于實驗分析161]。由圖3-4可知,dNTP濃度對PCR影響與其他因??素相比相對而言較小,當濃度在0.08mmol/L、0.12mmol/L、0.16mmol/L時,條??帶亮度呈上升趨勢,當濃度達到0.2?mmol/L時,亮度最為明顯且條帶清晰,但隨??著濃度超過〇.2mmol/L時,由于與Taq酶反應的Mg>轉而與dNTP相結合,使得Taq??酶活性有所降低,因而影響PCR反應的結果,甚至會導致條帶亮度減弱直到消失。??因此,從各個方面綜合考慮,選擇濃度為0.2?mmol/L的dNTP作為絲瓜25?|_iL?SRAP??擴增。??M?1?2?3?4?5?6??nip??圖3-4.不同dNTP濃度的SRAP-PCR結果??Fig3-4.?effect?of?\?arious?dNTP?concentrations?in?the?SRAP-PCR??注:1-6?為?0.08、0.12、0.16、0.20、0.24、
【參考文獻】:
期刊論文
[1]絲瓜種質資源的SRAP遺傳多樣性分析[J]. 吳海濱,龔浩,劉鵬,何曉莉,羅少波,鄭曉明,陳俊秋,羅劍寧. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2015(04)
[2]基于SRAP標記的國蘭種質資源遺傳多樣性分析及分子身份證構建[J]. 唐源江,曹雯靜,吳坤林. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2015(09)
[3]茄子農(nóng)藝性狀和品質性狀的相關性及主成分分析[J]. 馮英娜,劉衛(wèi)東,朱士農(nóng),崔群香,張愛慧. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2015(01)
[4]SCoT分子標記技術在絲瓜上的應用[J]. 蔣雅琴,黎炎,李文嘉,吳永官,王益奎,康德賢. 南方農(nóng)業(yè)學報. 2014(12)
[5]浙江省絲瓜種質資源主成分分析和聚類分析[J]. 王嬌陽,趙永彬,馮春梅. 植物遺傳資源學報. 2014(06)
[6]基于熒光檢測技術的小麥品種SSR鑒定體系的建立[J]. 鄭永勝,張晗,王東建,孫加梅,王雪梅,段麗麗,李華,王瑋,李汝玉. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2014(19)
[7]草莓SRAP反應體系優(yōu)化及引物篩選[J]. 魏麗麗,朱世東,賈慶美,劉海燕. 中國農(nóng)學通報. 2014(25)
[8]有棱絲瓜與普通絲瓜種間雜種后代的ISSR分析[J]. 宋波,陳龍正,徐海,鄭濤,袁希漢. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2014(08)
[9]SRAP技術在植物遺傳育種中的應用[J]. 盧超,張美德,何銀生,劉海華,艾倫強. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2014(16)
[10]葡萄種質資源SRAP-PCR反應體系的建立及優(yōu)化[J]. 苑煒,朱瑜,代培紅,夏培蓓,羅淑萍. 新疆農(nóng)業(yè)科學. 2014(07)
博士論文
[1]普通絲瓜種質資源評價體系及主要農(nóng)藝性狀遺傳規(guī)律研究[D]. 蘇小俊.南京農(nóng)業(yè)大學 2009
碩士論文
[1]茄子單性結實基因連鎖的SRAP分子標記[D]. 張念.西南大學 2014
[2]絲瓜種質資源遺傳多樣性的ISSR分析[D]. 陳朝文.福建農(nóng)林大學 2009
[3]福建22份烤煙種質資源的遺傳多樣性分析[D]. 朱慧麗.福建農(nóng)林大學 2009
[4]瓠瓜EST-SSR、SRAP、ISSR和RAPD反應體系的建立及其純度鑒定應用的研究[D]. 劉成平.華中農(nóng)業(yè)大學 2008
[5]絲瓜種質資源遺傳多樣性研究[D]. 夏軍輝.華中農(nóng)業(yè)大學 2007
[6]中國南瓜種質資源遺傳多樣性研究[D]. 褚盼盼.華中農(nóng)業(yè)大學 2007
[7]黃瓜品質性狀的AFLP和SCAR標記研究[D]. 張鳳青.西南大學 2007
[8]黃瓜單性結實和種質資源遺傳多樣性的ISSR分析[D]. 王佳.揚州大學 2007
本文編號:3065324
【文章來源】:福建農(nóng)林大學福建省
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1.60份DNA模板??Fig3-1.60DNA?Template??注:l-60為試驗材料,見表2-1??
為].75?U、1.5?U、1.25?U、].0U、0.75?U、0.5?U、0.25?U。由圖?3-2?可知,在??25?pL的反應體系中,Taq酶濃度在0.25?U、0.5?U、0.75?U、1.0?U時,擴增條帶??清晰度差,亮度不高。當濃度達到1.25U時,亮度增加,條帶清晰。本著擴增??數(shù)量適當、清晰度強、經(jīng)濟性的原則,當Taq酶濃度達到].25?U時反應體系達??到最佳水平。??M?1?2?3?4?5?6?7??::霸??75〇bp??s〇〇bp??:SBBBm??圖3-2.不同Taq酶濃度的SRAP-PCR結果??Fig3-2.effect?of?various?Taq?polymerase?concentrations?in?the?SRAP-PCR??注:1-7?為?1.75、1.5、1.25、丨?0、0.75、0.5、0.25(U)?IVI:?DL2000Marker??2.2.2模板DNA濃度對PCR結果的影響??模板DNA濃度對PCR結果有著一定的影響,當模板DNA濃度過高時,比??較容易出現(xiàn)非特異性擴增反應,有的還會導致拖尾,沒有PCR條帶的現(xiàn)象。模??板DNA濃度過低同樣也是不行的,濃度過低則目的產(chǎn)物會過少[6?]。圖3-3中能??夠發(fā)現(xiàn),當濃度在5?ng、12.5?ng時條帶亮度極低,清晰度弱。從圖3-3可以看出,??DNA濃度在75?ng時,模板DNA條帶亮度強,條帶清晰,考慮到試驗準確性和??不浪費實驗藥劑的情況下,濃度為75?ng的DNA最適宜絲瓜25?fxL?SRAP擴增。??22??
?福建農(nóng)林大學碩士專業(yè)學位論文???M?1?2?3?4?5?6??yi??444??圖3-3.不同濃度DMA的SRAP-PCR結果??Fig3-3.effect?of?various?template?DNA?concentrations?in?the?SRAP-PCR??注:1-6?為?5、12.5、25、50、75、100(ng)?M:?DL2000Marker??2.2.3?dN。袑Γ樱遥粒校校茫覕U増的影響??dNTP影響PCR的擴增結果和效率。在PCR反應過程中,PCR產(chǎn)物的量受到??dNTP濃度影響,dNTP濃度過低會使得PCR產(chǎn)物的量減少,高濃度dNTP就容易引??起錯誤滲入,不利于實驗分析161]。由圖3-4可知,dNTP濃度對PCR影響與其他因??素相比相對而言較小,當濃度在0.08mmol/L、0.12mmol/L、0.16mmol/L時,條??帶亮度呈上升趨勢,當濃度達到0.2?mmol/L時,亮度最為明顯且條帶清晰,但隨??著濃度超過〇.2mmol/L時,由于與Taq酶反應的Mg>轉而與dNTP相結合,使得Taq??酶活性有所降低,因而影響PCR反應的結果,甚至會導致條帶亮度減弱直到消失。??因此,從各個方面綜合考慮,選擇濃度為0.2?mmol/L的dNTP作為絲瓜25?|_iL?SRAP??擴增。??M?1?2?3?4?5?6??nip??圖3-4.不同dNTP濃度的SRAP-PCR結果??Fig3-4.?effect?of?\?arious?dNTP?concentrations?in?the?SRAP-PCR??注:1-6?為?0.08、0.12、0.16、0.20、0.24、
【參考文獻】:
期刊論文
[1]絲瓜種質資源的SRAP遺傳多樣性分析[J]. 吳海濱,龔浩,劉鵬,何曉莉,羅少波,鄭曉明,陳俊秋,羅劍寧. 西南農(nóng)業(yè)學報. 2015(04)
[2]基于SRAP標記的國蘭種質資源遺傳多樣性分析及分子身份證構建[J]. 唐源江,曹雯靜,吳坤林. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2015(09)
[3]茄子農(nóng)藝性狀和品質性狀的相關性及主成分分析[J]. 馮英娜,劉衛(wèi)東,朱士農(nóng),崔群香,張愛慧. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2015(01)
[4]SCoT分子標記技術在絲瓜上的應用[J]. 蔣雅琴,黎炎,李文嘉,吳永官,王益奎,康德賢. 南方農(nóng)業(yè)學報. 2014(12)
[5]浙江省絲瓜種質資源主成分分析和聚類分析[J]. 王嬌陽,趙永彬,馮春梅. 植物遺傳資源學報. 2014(06)
[6]基于熒光檢測技術的小麥品種SSR鑒定體系的建立[J]. 鄭永勝,張晗,王東建,孫加梅,王雪梅,段麗麗,李華,王瑋,李汝玉. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2014(19)
[7]草莓SRAP反應體系優(yōu)化及引物篩選[J]. 魏麗麗,朱世東,賈慶美,劉海燕. 中國農(nóng)學通報. 2014(25)
[8]有棱絲瓜與普通絲瓜種間雜種后代的ISSR分析[J]. 宋波,陳龍正,徐海,鄭濤,袁希漢. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2014(08)
[9]SRAP技術在植物遺傳育種中的應用[J]. 盧超,張美德,何銀生,劉海華,艾倫強. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2014(16)
[10]葡萄種質資源SRAP-PCR反應體系的建立及優(yōu)化[J]. 苑煒,朱瑜,代培紅,夏培蓓,羅淑萍. 新疆農(nóng)業(yè)科學. 2014(07)
博士論文
[1]普通絲瓜種質資源評價體系及主要農(nóng)藝性狀遺傳規(guī)律研究[D]. 蘇小俊.南京農(nóng)業(yè)大學 2009
碩士論文
[1]茄子單性結實基因連鎖的SRAP分子標記[D]. 張念.西南大學 2014
[2]絲瓜種質資源遺傳多樣性的ISSR分析[D]. 陳朝文.福建農(nóng)林大學 2009
[3]福建22份烤煙種質資源的遺傳多樣性分析[D]. 朱慧麗.福建農(nóng)林大學 2009
[4]瓠瓜EST-SSR、SRAP、ISSR和RAPD反應體系的建立及其純度鑒定應用的研究[D]. 劉成平.華中農(nóng)業(yè)大學 2008
[5]絲瓜種質資源遺傳多樣性研究[D]. 夏軍輝.華中農(nóng)業(yè)大學 2007
[6]中國南瓜種質資源遺傳多樣性研究[D]. 褚盼盼.華中農(nóng)業(yè)大學 2007
[7]黃瓜品質性狀的AFLP和SCAR標記研究[D]. 張鳳青.西南大學 2007
[8]黃瓜單性結實和種質資源遺傳多樣性的ISSR分析[D]. 王佳.揚州大學 2007
本文編號:3065324
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/yylw/3065324.html
最近更新
教材專著