湖南省小西葫蘆黃花葉病毒進(jìn)化分析
發(fā)布時(shí)間:2021-02-25 15:38
植物病毒病害是湖南省瓜類作物生產(chǎn)的主要制約因素之一。2013-2015年期間在湖南省瓜類作物主要生產(chǎn)地區(qū)采集了9種瓜類作物共662份表現(xiàn)出病毒癥狀的葉片樣品,并利用RT-PCR技術(shù)進(jìn)行小西葫蘆黃花葉病毒(Zucchini yellow mosaic virus, ZYMV)檢測(cè)及鑒定。在對(duì)湖南瓜類作物病毒病調(diào)查中發(fā)現(xiàn)ZYMV發(fā)病率占據(jù)所有樣品的54.5%,確定其為主要危害湖南瓜類作物的病毒。病毒多樣性導(dǎo)致新株系的出現(xiàn),常被認(rèn)為是病毒流行的一個(gè)重要因素。在本研究中當(dāng)分離獲得的ZYMV完整的外殼蛋白(CP)的核苷酸序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,湖南序列位于分組,A-Ⅱ,A-Ⅲ和C-Ⅱ。分離得到的ZYMV完整的輔助蛋白(HC-Pro)的核苷酸的序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育化分析。湖南株系位于分組A-Ⅰ和C。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育和計(jì)算分析,檢測(cè)到在CP亞組AⅢ和CⅡ分離物之間存在重組事件。這是國內(nèi)首次發(fā)現(xiàn)小西葫蘆黃花葉病毒重組。中性測(cè)試中在CP編碼蛋白區(qū)檢測(cè)出1個(gè)正選擇的位點(diǎn),同時(shí)檢測(cè)出CP與HC-Pro的20個(gè)負(fù)選擇位點(diǎn),故負(fù)選擇是對(duì)ZYMV的CP和HC-Pro的基因操作的主要?jiǎng)恿Α?傊?所有數(shù)據(jù)表明,ZYMV基因組的...
【文章來源】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 瓜類作物病毒研究進(jìn)展
1.1 瓜類作物以及為害瓜類作物的病毒
1.1.1 瓜類作物
1.1.2 國內(nèi)外已報(bào)道的侵染瓜類作物的病毒
1.2 小西葫蘆黃花葉病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)
1.2.1 馬鈴薯Y病毒科(Potyviridae)基因結(jié)構(gòu)
1.2.2 ZYMV的傳播方式
1.2.3 ZYMV的株系
1.2.4 ZYMV檢測(cè)方法
1.2.5 ZYMV防治方法
1.2.6 研究目的及意義
第二章 湖南瓜類作物ZYMV檢測(cè)
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 瓜類作物疑似病毒病葉片
2.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.4 溶劑與培養(yǎng)基配方見附錄
2.2.5 實(shí)驗(yàn)方法
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 ZYMV生物學(xué)檢測(cè)結(jié)果
2.3.2 湖南省瓜類作物對(duì)瓜類病毒ZYMV采用RT-PCR快速檢測(cè)電泳圖驗(yàn)證
2.4 小結(jié)與討論
第三章 湖南省小西葫蘆黃花葉病毒進(jìn)化分析
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 植物材料
3.2.2 實(shí)驗(yàn)所需試劑
3.2.3 其他培養(yǎng)基以及化學(xué)試劑見附錄
3.2.4 實(shí)驗(yàn)主要儀器設(shè)備
3.2.5 小西葫蘆黃花葉病毒的CP基因全長(zhǎng)序列與HC-Pro基因全長(zhǎng)序列的獲得
3.2.6 小西葫蘆黃花葉病毒CP基因與HC-Pro基因進(jìn)化分析
3.3 結(jié)果與分析
3.4 小結(jié)與討論
第四章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
發(fā)表論文附錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]葫蘆科經(jīng)濟(jì)植物的分類及種質(zhì)資源[J]. 林德佩. 中國瓜菜. 2010(05)
[2]侵染西瓜的5種病毒ZYMV、WMV、TMV、SqMV和CMV的多重RT-PCR檢測(cè)體系的建立與檢測(cè)應(yīng)用[J]. 王威麟,張昊,于祥泉,吳云鋒,張文波,張春平. 植物病理學(xué)報(bào). 2010(01)
[3]小西葫蘆黃花葉病毒在廣西瓜類作物上的發(fā)生情況初報(bào)[J]. 秦碧霞,蔡健和,劉志明,黃福新,朱桂寧. 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2004(04)
[4]小西葫蘆黃花葉病毒外殼蛋白基因的克隆及序列分析[J]. 古勤生,范在豐,Piero Roggero,陳紅運(yùn),俞正旺,李懷方. 植物病理學(xué)報(bào). 2003(06)
[5]桃蚜可高效率地傳播小西葫蘆黃化花葉病毒新疆株[J]. 趙榮樂,鄭光宇. 北京師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2003(03)
[6]甘蔗花葉病毒3’末端基因的克隆及外殼蛋白序列分析比較[J]. 李利君,周仲駒,謝聯(lián)輝. 中國病毒學(xué). 2001(01)
[7]不同CMV分離物侵染寄主的超微結(jié)構(gòu)變化[J]. 洪健,陳集雙,李德葆. 中國病毒學(xué). 2000(01)
[8]馬鈴薯Y病毒屬病毒的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李向東,李懷方,范在豐. 微生物學(xué)通報(bào). 1999(04)
[9]植物病毒的電鏡診斷[J]. 洪健,陳集雙,周雪平,李德葆. 電子顯微學(xué)報(bào). 1999(03)
[10]主要瓜類作物的抗病毒病育種(上)[J]. 王鳴,文生倉,閻友暉. 長(zhǎng)江蔬菜. 1997(01)
本文編號(hào):3051184
【文章來源】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 瓜類作物病毒研究進(jìn)展
1.1 瓜類作物以及為害瓜類作物的病毒
1.1.1 瓜類作物
1.1.2 國內(nèi)外已報(bào)道的侵染瓜類作物的病毒
1.2 小西葫蘆黃花葉病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)
1.2.1 馬鈴薯Y病毒科(Potyviridae)基因結(jié)構(gòu)
1.2.2 ZYMV的傳播方式
1.2.3 ZYMV的株系
1.2.4 ZYMV檢測(cè)方法
1.2.5 ZYMV防治方法
1.2.6 研究目的及意義
第二章 湖南瓜類作物ZYMV檢測(cè)
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 瓜類作物疑似病毒病葉片
2.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.4 溶劑與培養(yǎng)基配方見附錄
2.2.5 實(shí)驗(yàn)方法
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 ZYMV生物學(xué)檢測(cè)結(jié)果
2.3.2 湖南省瓜類作物對(duì)瓜類病毒ZYMV采用RT-PCR快速檢測(cè)電泳圖驗(yàn)證
2.4 小結(jié)與討論
第三章 湖南省小西葫蘆黃花葉病毒進(jìn)化分析
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 植物材料
3.2.2 實(shí)驗(yàn)所需試劑
3.2.3 其他培養(yǎng)基以及化學(xué)試劑見附錄
3.2.4 實(shí)驗(yàn)主要儀器設(shè)備
3.2.5 小西葫蘆黃花葉病毒的CP基因全長(zhǎng)序列與HC-Pro基因全長(zhǎng)序列的獲得
3.2.6 小西葫蘆黃花葉病毒CP基因與HC-Pro基因進(jìn)化分析
3.3 結(jié)果與分析
3.4 小結(jié)與討論
第四章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介
發(fā)表論文附錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]葫蘆科經(jīng)濟(jì)植物的分類及種質(zhì)資源[J]. 林德佩. 中國瓜菜. 2010(05)
[2]侵染西瓜的5種病毒ZYMV、WMV、TMV、SqMV和CMV的多重RT-PCR檢測(cè)體系的建立與檢測(cè)應(yīng)用[J]. 王威麟,張昊,于祥泉,吳云鋒,張文波,張春平. 植物病理學(xué)報(bào). 2010(01)
[3]小西葫蘆黃花葉病毒在廣西瓜類作物上的發(fā)生情況初報(bào)[J]. 秦碧霞,蔡健和,劉志明,黃福新,朱桂寧. 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2004(04)
[4]小西葫蘆黃花葉病毒外殼蛋白基因的克隆及序列分析[J]. 古勤生,范在豐,Piero Roggero,陳紅運(yùn),俞正旺,李懷方. 植物病理學(xué)報(bào). 2003(06)
[5]桃蚜可高效率地傳播小西葫蘆黃化花葉病毒新疆株[J]. 趙榮樂,鄭光宇. 北京師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2003(03)
[6]甘蔗花葉病毒3’末端基因的克隆及外殼蛋白序列分析比較[J]. 李利君,周仲駒,謝聯(lián)輝. 中國病毒學(xué). 2001(01)
[7]不同CMV分離物侵染寄主的超微結(jié)構(gòu)變化[J]. 洪健,陳集雙,李德葆. 中國病毒學(xué). 2000(01)
[8]馬鈴薯Y病毒屬病毒的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 李向東,李懷方,范在豐. 微生物學(xué)通報(bào). 1999(04)
[9]植物病毒的電鏡診斷[J]. 洪健,陳集雙,周雪平,李德葆. 電子顯微學(xué)報(bào). 1999(03)
[10]主要瓜類作物的抗病毒病育種(上)[J]. 王鳴,文生倉,閻友暉. 長(zhǎng)江蔬菜. 1997(01)
本文編號(hào):3051184
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