蘋果乳膠蛋白MdMLP423響應(yīng)非生物脅迫的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-05 04:41
蘋果是重要的經(jīng)濟(jì)作物,種植范圍廣泛,經(jīng)常會(huì)遭受干旱、高鹽、低溫等非生物脅迫,嚴(yán)重影響其生長(zhǎng)發(fā)育和產(chǎn)量,因而提高蘋果的抗逆性顯得尤為重要。利用現(xiàn)代生物技術(shù)研究蘋果的抗逆機(jī)制、挖掘抗逆基因,對(duì)蘋果產(chǎn)量和品質(zhì)具有十分重要的意義。在本實(shí)驗(yàn)室前期蘋果轉(zhuǎn)錄組研究中,發(fā)現(xiàn)一個(gè)在逆境脅迫下表達(dá)顯著上調(diào)的基因,編碼一種植物特有的乳膠蛋白(Major Latex Protein,MLP)。為了深入研究該基因?qū)Ψ巧锩{迫的響應(yīng),我們?cè)谠思?xì)胞中誘導(dǎo)表達(dá)了該蛋白,研究了其對(duì)細(xì)胞抗逆功能的影響及發(fā)揮功能的位點(diǎn);利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)在擬南芥中超表達(dá)該基因,研究在植物體中的抗逆作用。主要研究結(jié)果如下:(1)MdMLP423基因的生物信息學(xué)分析。本實(shí)驗(yàn)室前期蘋果轉(zhuǎn)錄組研究中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)鹽脅迫誘導(dǎo)表達(dá)上調(diào)7倍的基因,該基因在GenBank中的注冊(cè)號(hào)為L(zhǎng)OC103448744,編碼的蛋白質(zhì)被命名為MdMLP423,屬于乳膠蛋白。該基因定位于蘋果第11號(hào)染色體,編碼152個(gè)氨基酸殘基。SignaIP和TMHMM軟件分析發(fā)現(xiàn),MdMLP423蛋白無(wú)信號(hào)肽也不存在跨膜區(qū),屬于水溶性胞質(zhì)蛋白。基于擬南芥MLP(AtMLP28)同源建?...
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Betv1蛋白的三維結(jié)構(gòu)(Toyamaetal.,2003)
個(gè)短的 α 螺旋位于大的疏水凹槽的一端,β4 和 β5 之間的無(wú)規(guī)則卷曲位于疏水凹槽的一端。另一個(gè)不同之處在于保守的 Bet v 1 折疊,經(jīng)典的 Bet v 1 折疊中的 β1 和 β2 在LP 中被介于 β2 和 α2 之間的一個(gè)含有 45~65 殘基的長(zhǎng)而靈活的環(huán)所取代,該環(huán)是非構(gòu)化且可變的與富含甘氨酸的環(huán)相鄰。另外 MLP 蛋白中 91 位的組氨酸殘基(β2 和 β3間的環(huán))和 160 位的谷氨酸殘基(長(zhǎng) α 螺旋)之間存在一個(gè)潛在的鹽橋,可以起到穩(wěn)結(jié)構(gòu)的作用,這一結(jié)構(gòu)在疏水腔開(kāi)口處起蓋子的作用。在 Bet v 1 的溶解結(jié)構(gòu)和晶體構(gòu)中都很難界定無(wú)規(guī)則卷曲的存在。相反,在黃色羽扇豆 LLPR-102B 與玉米素復(fù)合的晶體結(jié)構(gòu)中卻在相同的位置存在與 MLP28 一樣的鹽橋,其類似于疏水凹槽的“門”。外一個(gè) MLP(AT1G240000.1)的晶體結(jié)構(gòu)顯示與 MLP28 的折疊相似,但它僅有 5 β 折疊片圍繞羧基端的含有 21 個(gè)氨基酸 α 螺旋,這是由于 AT1G240000.1 在 α1 螺旋后缺失 33 個(gè)氨基酸(Lytle et al., 2009)。MLP(AT1G24000 0.1)缺少無(wú)規(guī)則環(huán)、富甘氨酸的環(huán)和 β2 折疊片,導(dǎo)致其疏水凹槽明顯小于 MLP28。此外,在 α1 和 β3 折疊只有一個(gè)小環(huán),而不是像 MLP28 一樣存在覆蓋凹槽的長(zhǎng)環(huán)。
驗(yàn)室前期的蘋果轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)在鹽脅迫下表達(dá)上調(diào)的能響應(yīng)非生物脅迫。將該基因序列在 NCBI(National Center of Biot中進(jìn)行 BlastP 序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)其與 NCBI 中的 LOC103448744 完dMLP423,定位在蘋果的第 11 條染色體上。MdMLP423 含有 459 b 3-1),編碼植物特有的乳膠蛋白(Major Latex Protein,MLP),預(yù)與其他物種的 MLP 成員進(jìn)行序列比對(duì),發(fā)現(xiàn) MLP 蛋白都存在一h loop 區(qū)域。Gly-rich loop 中含有保守的甘氨酸,序列為 Glyxxxx423 中此序列稍有不同 Gly46Gly47Gly48xxxxGly53(圖 3-2)。S件分析發(fā)現(xiàn),MdMLP423 屬于無(wú)信號(hào)肽、無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)域的胞質(zhì)蛋(AtMLP28)同源建?芍,MdMLP423 的結(jié)構(gòu)與其他 MLP 成員 3 個(gè) α 螺旋組成,其中 7 片 β 折疊圍繞羧基端一段長(zhǎng) α 螺旋(α3 折疊,另外結(jié)構(gòu)中還有一個(gè)由無(wú)規(guī)則卷曲構(gòu)成疏水凹槽,能與配生物學(xué)功能(圖 3-3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]機(jī)械損傷誘導(dǎo)植物苯丙氨酸解氨酶活性研究進(jìn)展[J]. 吳瓊,方吳云,王文杰. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2016(01)
[2]植物活性氧的產(chǎn)生及其作用和危害[J]. 張夢(mèng)如,楊玉梅,成蘊(yùn)秀,周滔,段曉艷,龔明,鄒竹榮. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(09)
[3]植物激素乙烯作用機(jī)制的最新進(jìn)展[J]. 李文陽(yáng),馬夢(mèng)迪,郭紅衛(wèi). 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2013(10)
[4]中國(guó)蘋果主產(chǎn)區(qū)生產(chǎn)布局變遷及影響因素分析[J]. 劉天軍,范英. 農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)問(wèn)題. 2012(10)
[5]中國(guó)蘋果產(chǎn)品出口現(xiàn)狀、制約因素及其對(duì)策分析[J]. 李瑾,仇煥廣,蔡亞慶,李樹(shù)超. 世界農(nóng)業(yè). 2012(05)
[6]我國(guó)蘋果產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀與趨勢(shì)[J]. 翟衡,史大川,束懷瑞. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2007(03)
本文編號(hào):2958041
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Betv1蛋白的三維結(jié)構(gòu)(Toyamaetal.,2003)
個(gè)短的 α 螺旋位于大的疏水凹槽的一端,β4 和 β5 之間的無(wú)規(guī)則卷曲位于疏水凹槽的一端。另一個(gè)不同之處在于保守的 Bet v 1 折疊,經(jīng)典的 Bet v 1 折疊中的 β1 和 β2 在LP 中被介于 β2 和 α2 之間的一個(gè)含有 45~65 殘基的長(zhǎng)而靈活的環(huán)所取代,該環(huán)是非構(gòu)化且可變的與富含甘氨酸的環(huán)相鄰。另外 MLP 蛋白中 91 位的組氨酸殘基(β2 和 β3間的環(huán))和 160 位的谷氨酸殘基(長(zhǎng) α 螺旋)之間存在一個(gè)潛在的鹽橋,可以起到穩(wěn)結(jié)構(gòu)的作用,這一結(jié)構(gòu)在疏水腔開(kāi)口處起蓋子的作用。在 Bet v 1 的溶解結(jié)構(gòu)和晶體構(gòu)中都很難界定無(wú)規(guī)則卷曲的存在。相反,在黃色羽扇豆 LLPR-102B 與玉米素復(fù)合的晶體結(jié)構(gòu)中卻在相同的位置存在與 MLP28 一樣的鹽橋,其類似于疏水凹槽的“門”。外一個(gè) MLP(AT1G240000.1)的晶體結(jié)構(gòu)顯示與 MLP28 的折疊相似,但它僅有 5 β 折疊片圍繞羧基端的含有 21 個(gè)氨基酸 α 螺旋,這是由于 AT1G240000.1 在 α1 螺旋后缺失 33 個(gè)氨基酸(Lytle et al., 2009)。MLP(AT1G24000 0.1)缺少無(wú)規(guī)則環(huán)、富甘氨酸的環(huán)和 β2 折疊片,導(dǎo)致其疏水凹槽明顯小于 MLP28。此外,在 α1 和 β3 折疊只有一個(gè)小環(huán),而不是像 MLP28 一樣存在覆蓋凹槽的長(zhǎng)環(huán)。
驗(yàn)室前期的蘋果轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)在鹽脅迫下表達(dá)上調(diào)的能響應(yīng)非生物脅迫。將該基因序列在 NCBI(National Center of Biot中進(jìn)行 BlastP 序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)其與 NCBI 中的 LOC103448744 完dMLP423,定位在蘋果的第 11 條染色體上。MdMLP423 含有 459 b 3-1),編碼植物特有的乳膠蛋白(Major Latex Protein,MLP),預(yù)與其他物種的 MLP 成員進(jìn)行序列比對(duì),發(fā)現(xiàn) MLP 蛋白都存在一h loop 區(qū)域。Gly-rich loop 中含有保守的甘氨酸,序列為 Glyxxxx423 中此序列稍有不同 Gly46Gly47Gly48xxxxGly53(圖 3-2)。S件分析發(fā)現(xiàn),MdMLP423 屬于無(wú)信號(hào)肽、無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)域的胞質(zhì)蛋(AtMLP28)同源建?芍,MdMLP423 的結(jié)構(gòu)與其他 MLP 成員 3 個(gè) α 螺旋組成,其中 7 片 β 折疊圍繞羧基端一段長(zhǎng) α 螺旋(α3 折疊,另外結(jié)構(gòu)中還有一個(gè)由無(wú)規(guī)則卷曲構(gòu)成疏水凹槽,能與配生物學(xué)功能(圖 3-3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]機(jī)械損傷誘導(dǎo)植物苯丙氨酸解氨酶活性研究進(jìn)展[J]. 吳瓊,方吳云,王文杰. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2016(01)
[2]植物活性氧的產(chǎn)生及其作用和危害[J]. 張夢(mèng)如,楊玉梅,成蘊(yùn)秀,周滔,段曉艷,龔明,鄒竹榮. 西北植物學(xué)報(bào). 2014(09)
[3]植物激素乙烯作用機(jī)制的最新進(jìn)展[J]. 李文陽(yáng),馬夢(mèng)迪,郭紅衛(wèi). 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2013(10)
[4]中國(guó)蘋果主產(chǎn)區(qū)生產(chǎn)布局變遷及影響因素分析[J]. 劉天軍,范英. 農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)問(wèn)題. 2012(10)
[5]中國(guó)蘋果產(chǎn)品出口現(xiàn)狀、制約因素及其對(duì)策分析[J]. 李瑾,仇煥廣,蔡亞慶,李樹(shù)超. 世界農(nóng)業(yè). 2012(05)
[6]我國(guó)蘋果產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀與趨勢(shì)[J]. 翟衡,史大川,束懷瑞. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2007(03)
本文編號(hào):2958041
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