番茄是世界上重要的蔬菜作物。本研究采用表型性狀和SNP標記對收集到的322份番茄種質(zhì)資源進行遺傳多樣性分析。用變異系數(shù)、Shannon-Wiener多樣性指數(shù)對收集到的322份番茄種質(zhì)資源的29個表型性狀進行遺傳多樣性分析;用SPSS 20.0進行聚類分析,通過主成分、相關(guān)性以及回歸分析對番茄種質(zhì)資源進行綜合評價和評價指標篩選。利用KASP技術(shù)對在表型結(jié)果聚類基礎(chǔ)上篩選出的46份代表性材料進行SNP基因分型檢測,篩選出多態(tài)性高的SNP標記,從篩選出的多態(tài)性引物中挑選均勻覆蓋番茄全染色體的120對引物對185份有代表性的供試材料進一步進行種質(zhì)資源遺傳多樣性分析。主要研究結(jié)果如下:1.供試材料的表型性狀具有豐富的遺傳多樣性,葉片類型以普通葉型為主,花梗離層以有離層為主。13個質(zhì)量性狀共檢測到40個變異類型,質(zhì)量性狀中Shannon-Wiener多樣性指數(shù)最高的是生長勢(1.52);數(shù)量性狀最高的是葉片長(2.08)和葉片寬(2.07),16個數(shù)量性狀的變異系數(shù)CV值介于11.71%～70.93%,變異系數(shù)最大的是裂果率(70.93%);遺傳多樣性指數(shù)(H')分布范圍為1.49～2.08。相關(guān)性分析和主成分分析結(jié)果表明:各性狀間存在復雜的相互關(guān)系,前9個主成分的累計貢獻率為64.58%,包含了全部指標的大部分信息。2.表型性狀的綜合評價分析表明,編號為68的番茄D值(0.585)最高,其綜合性能最好;29個表型性狀與綜合值D之間:除了果肉厚,花柱長度,葉片形狀和葉色外,均表現(xiàn)為顯著相關(guān)。采用逐步回歸分析方法篩選出20個性狀可以作為番茄綜合評價的重要指標。在遺傳距離為17.5處可將供試的322份番茄資源劃分為6個組群,第5組群包含133份材料,主要特點為圓形,生長習性為有限生長;第6組群包含175份,主要特點為單果質(zhì)量小,生長習性為無限生長。3.基于表型性狀分類結(jié)果篩選出46個有代表性的番茄材料,利用KASP檢測方法對374個SNP標記進行篩選,結(jié)果表明:75對無多態(tài)性,不能區(qū)分樣本的基因型;116對具有非特異性擴增,不能很好的區(qū)分樣本的基因型:183對SNP引物基因分型結(jié)果好,多態(tài)性高,能夠用于后續(xù)遺傳多樣性分析。4.從篩選出的多態(tài)性引物中挑選均勻覆蓋番茄全染色體的120對引物對185份有代表性的供試材料進行SNP基因分型,共檢測到348個等位基因,每個位點均檢測到2.892個等位變異。等位基因頻率為0.429～0.962之間,平均為0.674;雜合度為0～0.557之間,平均為0.032;多態(tài)性信息含量(PIC)為0.071～0.571,平均值為0.325,主要分布在0.35～0.40之間,表明本研究中SNP標記表現(xiàn)為中度偏高多態(tài)性。185份番茄材料間的遺傳距離變異范圍為0.002～1.141之間,平均值為0.528,其中R137與R139之間的遺傳距離最低(0.002),R96與R106之間的遺傳距離最大(1.141)。按照UPGMA法構(gòu)建聚類圖,185份番茄材料在遺傳距離為0.25時可被劃分為4大類群。群體遺傳結(jié)構(gòu)分析將番茄種質(zhì)資源劃分為3個類群。以上結(jié)果表明供試材料遺傳多樣性豐富,為未來番茄育種雜交親本的選擇和新品種選育提供了理論支持。
【學位單位】：寧夏大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2018
【中圖分類】：S641.2
【部分圖文】：

量檢測??度的檢測??儀測得的番茄葉片ＤＮＡ的濃度和純度，ＤＮＡ樣品的０／Ａ２３０比值均大于２．０，研究表明提取的ＤＮＡ雜質(zhì)表３－４?１０份番茄ＤＮＡ樣品的濃度和純度??ａｂｌｅ３－４?Ｔｈｅ?ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎｓ?ａｎｄ?ｐｕｒｉｔｉｅｓ?ｏｆ?１０?ＤＮＡ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｏｆ?ｔｏｍａＡ２６０／Ａ２８０?Ａ２６０／Ａ２３０￣｜?序號?濃度（ｎｇ／ｐＬ）??????Ｎｏ．?Ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ?１．９２２?一１０４８?６?１７８．６０１．９３７?２．２３４?７?２６０．００１．９２３?２．１８０?８?１８６．２１１．９６６?２．２５９?９?２４１．２１Ｌ９２９?２Ｊ０１??１０?１７７．７４泳檢測??測（閣３－１）提取到的１０份番茄葉片基因組ＤＮＡ（稀只有１條清晰并且完整的帶，質(zhì)量高，能滿足ＳＮＰ增反應。??

代表雜合型的點位于水平軸和垂直軸的交叉區(qū)域》ＮＴＣ分布于橫坐標和縱坐標交界區(qū)域，圖中每??個圓點都對應一個供試番茄材料，每個引物均會將供試番茄材料分成三組或兩組，每組帶有不同??顏色，藍色代表該基因具有ＦＡＭ標簽序列，紅色代表該基因具有ＨＥＸ標簽序列（圖３－２）。在本??研究中所應用的３７４個ＳＮＰ位點引物中，７５對無多態(tài)性，不能區(qū)分樣本的基因型，１１６對具有非??特異性擴增

同時結(jié)合其表型可以看出，Ｒ１０６為紅果無限生長型番茄，而Ｒ９６為粉果有限生長，兩者??外部差異明顯。??根據(jù)計算出來的１７０６３個遺傳距離，以０．１為組距進行次數(shù)分布分析（圖３－４）。可以看出，??１８５份番茄材料的遺傳距離在０．５０２－０．６０２之間最多，數(shù)量為５３２５個，占總數(shù)的３１％，遺傳距離??＞?０．４０２的遺傳距離有１４５３６個，＜?０．４０２的遺傳距離有２５２７個，分別占總數(shù)的８５．１９％和１４．８１％，??由此說明，供試材料的遺傳距離大，供試材料的差異較大，遺傳基礎(chǔ)好。??－３６－??
【參考文獻】

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本文編號：2883746