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不同西葫蘆品種及其親本遺傳多樣性分析

發(fā)布時間:2020-10-31 17:27
   西葫蘆屬于葫蘆科南瓜屬西葫蘆種,營養(yǎng)豐富,具有重要的藥用價值和經(jīng)濟價值,適應性強,栽培面積大,深受人們喜愛。對西葫蘆種質(zhì)資源遺傳多樣性的研究,有利于種質(zhì)資源的搜集、整理、鑒定、開發(fā)利用和保存。形態(tài)標記從表觀性狀反映種質(zhì)間的差異,分子標記從DNA水平反映種質(zhì)間的差異。ISSR分子標記技術具有操作簡單、高分辨率、高重復性、多態(tài)性豐富和安全性高的優(yōu)點,已被廣泛用于品種鑒定和多樣性分析等方面的研究。本研究用形態(tài)學標記和ISSR標記對44份西葫蘆的遺傳多樣性進行了研究,主要結果如下:1.分別對30份親本和14份品種的13個形態(tài)指標進行了分析。結果表明,西葫蘆13個形態(tài)指標具有豐富的遺傳多樣性。30份親本變異系數(shù)最大的株幅(56.36%),最小的是老瓜橫徑(17.14%);Shannon多樣信息指數(shù)以葉面積最大(1.96),生長習性的最小(0.61)。14份品種變異系數(shù)最大的是生長習性(34.59%),最小的是瓜形指數(shù)(15.06%);Shannon多樣信息指數(shù)最大的是葉柄長度(1.65),最小的是老瓜橫徑(0.41)。2.形態(tài)學性狀聚類結果表明,在相似系數(shù)為0.20處,將30份親本材料分為3類。第一類包括30和33這兩個長長棒形父本材料;第二類包括10份長棒形父本材料;第三類將瓜形為高圓、短筒、圓筒和長筒的18份母本材料聚為一類。在相似系數(shù)為0.23處,將14份品種材料分為3類。34號扁圓形品種單獨聚為一類,第二類包括6份矮生材料,第三類包括7份半矮生材料。由此可見瓜形和蔓性是西葫蘆種質(zhì)資源的重要形態(tài)指標。3.從50條引物中篩選出18條引物用于ISSR標記分析,擴增出203條帶,其中多態(tài)性條帶153條,多態(tài)比率為74.9%,平均每條引物11.3條帶,8.4個為多態(tài)性條帶。Na、Ne、H、I 的平均值分別為 2、1.6117、0.3493、0.5182。4.ISSR標記的聚類結果顯示,不同品種的母本和父本都分別聚類到不同的類群中,在相似系數(shù)為0.55處,將30份親本材料分為2個類群。第一類為2個長長棒形的父本材料,第二類的28份材料在相似系數(shù)0.67處分為3個母本亞類和1個父本亞類,第一亞類包括4份圓筒形母本材料,第二亞類包括4份長筒形母本材料,第三亞類包括11份長棒形父本材料,第四亞類包括9份高圓到短筒形的母本材料。在相似系數(shù)為0.62處,將14份品種分為4類。第一類包括6份矮生的露地栽培材料,第二類包括3份半矮生春秋保護地栽培材料,第三類包括4份半矮生越冬茬材料,扁圓形的34號品種單獨聚為一類。5.形態(tài)學與ISSR標記聚類結果基本一致。從親本材料聚類結果看,2個長長棒父本材料與其他親本材料親緣關系較遠都首先聚為一類,其余親本分別聚到母本群和父本群中,不同的是ISSR標記聚類把母本進一步分為3個亞類;從品種聚類結果看,都是扁圓形34號品種單獨聚為一類,矮生品種聚為一類,半矮生品種聚為一類,不同的是ISSR標記聚類進一步把半矮生品種分為兩類。品種的形態(tài)標記和ISSR標記的相關系數(shù)為0.4228,高于親本材料的相關系數(shù)0.2012,二者的一致性較低。6.ISSR標記聚類結果表明,親本間相似系數(shù)較高為0.55-1,其中14和5、12和15以及9、3和18、23和26都分別為同一個親本材料,可見我國目前西葫蘆育種所用的材料遺傳背景較窄,在今后育種中應廣泛收集資源。
【學位單位】:山西農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2017
【中圖分類】:S642.6
【部分圖文】:

西葫蘆,檢測結果,基因組,材料


DNA的質(zhì)量是ISSR標記最基本的要求,本試驗用CTAB法提。模危粒??核酸蛋白儀對提取的西葫蘆DNA進行了檢測,結果顯示所提的DNAOD26Q/OD28〇??在1.90左右,純度較高,部分結果如下表3-2所示。從圖3-1電泳結果來看,所??提的DNA主帶清晰,排列整齊,能夠滿足ISSR分析的要求。??表3-2部分DNA檢測結果??Table?3-2?DNA?test?results?of?partial?C.pepo??編號?濃度(ng/uL)?OD260/OD280?編號?濃度(ng/uL)?OD260/OD280??Number?Concentration?Number?Concentration??1?1438.2?1.85?11?1129.8?1.91??2?1575.8?1.87?12?2431.8?1.86??3?1657.2?1.90?13?2115.3?1.95??4?1520.0?1.84?14?1923.7?1.90??5?1198.3?1.87?15?2224.0?1.97??6?1892.5?1.92?16?1381,5?1.93??7?672.1?1.90?17?712.0?1.97??8?1646.4?1.94?18?1728.3?1.94??9?1824.2?1.89?19?1576.8?1.85???10?1256.7?L97?20?2045.6?

引物,退火溫度,反應體系


圖3-1?10個西葫蘆材料基因組DNA檢測結果??Fig.3-1?detection?results?of?C.pepo?genomic?DNA??3.2.1.2ISSR反應體系??ISSR-PCR反應體系為20?|iiL,具體如下表:????試齊丨J?reagent?使用量usage???DNA?(50ng/(j.L)?1?(J.L??引物(lOpmol/L)?3?[iL??Master?Mix?10?)J.L???ddH2Q?6j〇L???3.2.1.3引物篩選及退火溫度的確定??根據(jù)哥倫比亞大學公布的引物序列以及盧亞楠、司旻星、鐘開勤等人[77,83,951??研究中所用的ISSR引物共設計了?50條引物,不同引物擴增出的條帶亮度、帶型、??數(shù)量、多態(tài)性帶數(shù)存在差異,從這50條引物中篩選出了?18條擴增條帶清晰、多??態(tài)性好的引物。??表3-3篩選出的18條ISSR引物??Table?3-3?The?selected?18?primers??引物
【參考文獻】

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本文編號:2864264

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