高羊茅熱激轉(zhuǎn)錄因子FaHsfC1b的克隆與耐熱性功能鑒定
【學(xué)位單位】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2017
【中圖分類(lèi)】:S688.4
【部分圖文】:
2.2.3?FaHsfClb序歹丨此對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析??采用MEGA?5.1進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明,FaHsfClb與小麥、二穗短柄草、水稻、??玉米、粟(5Wfirr/a//a//ca)中的HsfClb都有較高的同源性(圖2-3)。故將此基因命??名為高羊茅基因。并己在NCBI上進(jìn)行注冊(cè),基因登錄號(hào)為KY475613。根??據(jù)Bioedit軟件氨基酸序列比對(duì)結(jié)果(圖2-4)可知,該基因在靠近N端的部分有一個(gè)??DNA結(jié)合區(qū)域(DNA?binding?domain,?DBD),緊接著是一個(gè)疏水的寡聚化結(jié)構(gòu)域??(oligomerization?domain,?0D),也叫作HR-A/B區(qū)域,靠近C端是核定位信號(hào)結(jié)構(gòu)??域(nuclear?localization?signal,?NLS)。??62????FaHSFCIb??98?[I?TaHSFCIb??41J?I?BdHSFCIb???1?00?1?OsHSFCIb???ZmHSF30????5g1?SiHSFCIb???OsHSFCIa???OsHSFC2a??,〇〇??OsHSFC2b??圖2-3?FaHsfClb與其他C類(lèi)熱激轉(zhuǎn)錄因子的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析??Fig.?2-3?Phylogenetic?tree?of?FaHsfClb?and?other?HSFC?proteins??25??
?Marker??圖2-2高羊茅片段凝膠電泳圖??Fig.?2-2?Isolation?of?FaHsfClb?from?tall?fescue??將上述克隆到的基因連接pJETl.2?blunt?vector并用電擊法轉(zhuǎn)入大腸桿菌,將菌液??送測(cè)序公司確認(rèn)目的片段序列。該片段ORF全長(zhǎng)744?bp,編碼247個(gè)氨基酸,與之??前預(yù)測(cè)所得完全符合。??2.2.3?FaHsfClb序歹丨此對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析??采用MEGA?5.1進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明,FaHsfClb與小麥、二穗短柄草、水稻、??玉米、粟(5Wfirr/a//a//ca)中的HsfClb都有較高的同源性(圖2-3)。故將此基因命??名為高羊茅基因。并己在NCBI上進(jìn)行注冊(cè),基因登錄號(hào)為KY475613。根??據(jù)Bioedit軟件氨基酸序列比對(duì)結(jié)果(圖2-4)可知,該基因在靠近N端的部分有一個(gè)??DNA結(jié)合區(qū)域(DNA?binding?domain,?DBD),緊接著是一個(gè)疏水的寡聚化結(jié)構(gòu)域??(oligomerization?domain,?0D),也叫作HR-A/B區(qū)域,靠近C端是核定位信號(hào)結(jié)構(gòu)??域(nuclear?localization?signal
尖部分制作玻片,于共聚焦顯微鏡下觀察,即可看到GFP信號(hào),再用DAPI染色液滴??入盛有根尖的載玻片,在顯微鏡下觀察細(xì)胞核的位置,與GFP信號(hào)比對(duì)后兩者完全重??合(如圖2-6),再次證明了?FaHsfClb的核定位。??GFP?DAPI?Briqht?field?Merqed??mm::'、:??圖2-6乃&尸轉(zhuǎn)基因擬南芥FaHsfClb蛋白在根毛上的核定位??Fig.?2-6?Localization?of?FaHsfClb?protein?in?root?hair?of?transgenic?plants.??在高倍放大鏡下觀察到的擬南芥根毛GFP信號(hào)、細(xì)胞核與GFP信號(hào)重疊情況。Bar=10Mm。??Three-day-old?seedlings?in?culture?dish?were?observed?under?higher?magnification?of?microscopy.??Bar=10?(im.??2.2.5?在非生物肋、迫下的表達(dá)分析??將水培培養(yǎng)2周左右的高羊茅植株在45°C、4°C、20?%?PEG-6000及150?mM?NaCl??條件分別處理48h,在Oh、lh、2h、4h、12h、24h、48h取樣,提取總RNA后,??反轉(zhuǎn)錄成單鏈cDNA。通過(guò)qRT-PCR檢測(cè)在各種非生物脅迫下的表達(dá)情況,??以作為內(nèi)參基因。qRT-PCR結(jié)果如圖2-7所示,表達(dá)量在缺水處??理、鹽處理、熱處理、冷處理下均在48?h內(nèi)顯著提高,從的表達(dá)模式因不同??處理、不同組織部位而不同。??在熱處理和冷處理下,高羊茅葉片中A/*/C乃比根部更早表現(xiàn)出表達(dá)??量的激增
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本文編號(hào):2863401
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