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基于植物學(xué)性狀和SCoT標(biāo)記的籽用西瓜遺傳多樣性分析及核心種質(zhì)構(gòu)建

發(fā)布時(shí)間:2020-10-27 20:30
   籽用西瓜(Citrullus lanatus var.mmmegulasnemus Lin et Chao)通常簡(jiǎn)稱籽瓜,屬于葫蘆科植物,主要以種子為食用產(chǎn)品,其營(yíng)養(yǎng)豐富,食用價(jià)值較高。籽瓜種質(zhì)資源豐富,但長(zhǎng)期采用不正確的常規(guī)繁種和留種,使得各地出現(xiàn)品種混雜、同名異物和同物異名的現(xiàn)象,進(jìn)而導(dǎo)致籽瓜質(zhì)量下降、產(chǎn)量多變,嚴(yán)重制約其產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。本研究結(jié)合形態(tài)標(biāo)記和SCoT分子標(biāo)記對(duì)48份籽瓜種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性和親緣關(guān)系的分析,并構(gòu)建核心種質(zhì)。主要研究結(jié)果如下:1.通過39個(gè)表型性狀對(duì)48份籽(西)瓜材料進(jìn)行聚類分析,結(jié)果表明各種質(zhì)間的歐氏距離范圍介于3.1449~15.6997之間。當(dāng)歐氏距離為9.83時(shí),可將48份籽瓜種質(zhì)分為六類,普通西瓜和栽培型籽瓜的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳距離很大,很明顯的被獨(dú)立分開。2.對(duì)48份籽瓜種質(zhì)資源的39個(gè)植物學(xué)性狀進(jìn)行主成分分析,結(jié)果表明:第一主成分主要反映種子特征,第二主成分主要反映果實(shí)的特征,第三主成分主要反映植株的葉片特征。3.采用非加權(quán)類平均法(UPGMA)和聚類優(yōu)先取樣法構(gòu)建基于表型性狀的核心種質(zhì),按照350%~10%的抽樣比例構(gòu)建六個(gè)核心子集XT35~XT10。對(duì)六個(gè)核心子集基于MD%、VD%、CR%、VR%這四個(gè)參數(shù)進(jìn)行比較,并結(jié)合主成分分析,確定取樣比例為25%的核心子集XT25能代表原種質(zhì)的遺傳多樣性,可作為核心種質(zhì)。4.從51條引物中篩選出20條SCoT引物,對(duì)48份籽瓜材料進(jìn)行PCR擴(kuò)增,共擴(kuò)增出237條DNA條帶,其中多態(tài)性條帶有220條,多態(tài)性條帶比率高達(dá)92.83%。48個(gè)樣品擴(kuò)增條帶等位基因數(shù)(Na)為L(zhǎng) 9283,每個(gè)位點(diǎn)平均有效等位基因數(shù)(Ne)為1.4865,Nei' s基因多樣性指數(shù)(H)為0.2994,Shannon' s信息指數(shù)(Ⅰ)為0.4596,表明籽瓜遺傳多樣性豐富。5.基于SCoT分子標(biāo)記的聚類分析中,種質(zhì)間的遺傳相似系數(shù)介于0.59~0.95之間,普通西瓜與栽培型籽瓜之間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),普通西瓜沒有被很好地分離出來。當(dāng)遺傳相似系數(shù)Gs=0.662時(shí),可將48份籽瓜種質(zhì)聚為六大類。從主成分分析可以看出,各材料在主坐標(biāo)分析中的分布模式與聚類結(jié)果基本相一致。6.采用最小距離逐步抽樣法(LDSS)構(gòu)建了基于SCoT分子標(biāo)記的核心種質(zhì),在抽樣比例為35%~10%時(shí)構(gòu)建了六個(gè)核心子集FZ35~FZ10。通過對(duì)各核心子集遺傳多樣的比較,選擇25%取樣比例所獲得的核心子集FZ25作為籽瓜核心種質(zhì)。并且通過對(duì)原始種質(zhì)和核心種質(zhì)遺傳多樣性的比較可知,核心種質(zhì)的多態(tài)性位點(diǎn)和多態(tài)性位點(diǎn)百分率保留率達(dá)到了 99.55%,其他遺傳多樣性指數(shù)均較高。因此,進(jìn)一步證明,核心種質(zhì)FZ25最能代表原種質(zhì)遺傳多樣性。7.對(duì)兩種標(biāo)記下構(gòu)建的核心種質(zhì)進(jìn)行比較,結(jié)果發(fā)現(xiàn),在表型性狀方面,XT25相對(duì)于FZ25更具有代表性,而在SCoT分子標(biāo)記方面,FZ25比XT25更具代表性。
【學(xué)位單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2017
【中圖分類】:S651
【部分圖文】:

表型性狀,種質(zhì),果實(shí),種子


對(duì)48份籽(西)瓜材料的39個(gè)表型性狀的基本統(tǒng)計(jì)分析和變異分析結(jié)果如表??2,結(jié)果表現(xiàn)出不同種質(zhì)資源間各性狀有很大的差異,不同植物性狀間的變異程度也??不盡相同(圖1)。??mm??mmMi??WMM?K.??圖1部分種質(zhì)在果實(shí)、葉片、種子三方面的表型性狀圖??Fig.l?Phenotypic?traits?of?three?parts?in?fruit,?leaf?and?seed??籽瓜種質(zhì)資源的植物性狀包括三個(gè)方面:植株性狀、果實(shí)性狀和種子性狀。結(jié)??果分析可得,11個(gè)植株性狀的平均變異系數(shù)為22.80%,其中株型的變異系數(shù)最大,??為49.37%,其次是第一雌花節(jié)位,變異系數(shù)最小的是缺刻類型,說明缺刻類型的變??異程度較小,比較穩(wěn)定,其他性狀變異程度較大,變異表現(xiàn)的較豐富。15個(gè)果實(shí)性??狀的平均變異系數(shù)為28.97%,果肉顏色的變異系數(shù)最大,為84.66%,果形指數(shù)的??變異系數(shù)最小,其次是果實(shí)發(fā)育期。13個(gè)種子性狀表現(xiàn)出較大的變異程度,平均變??異系數(shù)為35.84%,變異系數(shù)最大的是種皮覆紋特征,為81.85%,其次為種皮覆紋,??變異系數(shù)最小的是種形指數(shù)

結(jié)果樹,聚類分析


和種形指數(shù),其多樣性指數(shù)均最大。??3.1.2籽(西)瓜表型性狀的R型聚類分析??對(duì)實(shí)驗(yàn)統(tǒng)計(jì)的39個(gè)植物學(xué)性狀進(jìn)行聚類分析.結(jié)果如圖2。由可知,當(dāng)歐氏距??離為9.81時(shí),39個(gè)性狀可分為三大類,并且每一類中各性狀間的距離都較遠(yuǎn),沒有??太大的聯(lián)系。??xl???!?????-?—?—i ̄1_??^1?-?-?.?.....-=>-)?.1??x24??*??I三三三三?三—卜1?n??a--—-—?--?1?_?-???Hi??x11??1????x9??1??x2?.?1?■??x4??!??=—二:二—二.…二:-,-z=?:―—??x19?}???x2fa?'??—?-?.?-?,????n??x14??'?l?1??x?5?1????x29?.????沿6?:?1?卜]??x3???x31?—????1??^I-=-?■—?—?--?■}?^J ̄I?n??等=二二…二.]?1?!?—??ai?=-—■:::—?.?—?—:_————_=--=i-—-:—J-…」_??1.00?2.00?S.00?4.00?S00?600?7?00?BOO?9.00?10.00??圖2?R型聚類分析結(jié)果樹系圖??F

材料表,聚類圖,性狀,種質(zhì)資源


3.1.3籽(西)瓜表型性狀的系統(tǒng)聚類分析??利用DPS統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)48份籽(西)瓜種質(zhì)資源的39個(gè)植物學(xué)性狀采用類平均??法(UPGMA)進(jìn)行聚類分析,如圖3。并且以歐式聚類為遺傳距離分析各種質(zhì)間的??親緣關(guān)系,48份各材料間的歐氏距離見附表3。由表可知各種質(zhì)間的歐氏距離范圍??介于3.1449-15.6997之間,說明本實(shí)驗(yàn)采用的48份籽(西)瓜種質(zhì)資源的遺傳多??樣性較豐富。從表中可以看出,明光黑小片(a4)和鄭州籽瓜(a33)的遺傳距離最??小,為3.1449,說明它們之間的親緣關(guān)系比較近;陜西紅子(a22)和信都紅瓜子(a42)??的遺傳距離最大,為15.6997,表明它們之間的遺傳差異最大。??邊?…… ̄??£=^?■?■?-?-:??3?????鵠二?r-^??—?—卜1—,?r?廣??¥??????1??a37?????1??a2G-??? ̄ ̄1?P??怨?=:=■■?■■.-==——■; ̄ ̄I?卜廠??a29?1?.—?J??盟■■——?^?r?i??饈三.....-fh??嚅二;二T」??^?h-J??忠—.一1?-J?f??&3?二:?.'?,__?1—_
【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2859020

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