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荷花遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及株型相關(guān)性狀QTLs分析

發(fā)布時(shí)間:2020-10-24 09:29
   荷花(Nelumbo nucifera Gaertn.)是一種集觀賞、食用和藥用等功能于一身的多年生水生草本植物,具有重要的經(jīng)濟(jì)和文化價(jià)值。荷花產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的關(guān)鍵在于培育具有多種優(yōu)良觀賞性狀的新品種,目前雜交育種依然是荷花新品種選育的常用方式。效率低、周期長(zhǎng),觀賞性狀遺傳機(jī)理復(fù)雜,直接找到控制這些性狀的關(guān)鍵基因十分困難。為挖掘控制荷花株型相關(guān)性狀的遺傳因子,本研究以小株型品種‘艷陽(yáng)高照’為父本,大株型品種‘建選-35’為母本,構(gòu)建了135株目標(biāo)性狀分離良好的F1代作圖群體,利用SSR、InDel分子標(biāo)記技術(shù),構(gòu)建了荷花遺傳連鎖圖譜。將株型性狀分解為立葉高、花柄高、葉長(zhǎng)、葉寬、花徑5組緊密相關(guān)的表型性狀,通過(guò)對(duì)5組表型性狀進(jìn)行測(cè)量和統(tǒng)計(jì)分析,用復(fù)合區(qū)間作圖法檢測(cè)相關(guān)QTLs位點(diǎn),主要結(jié)果如下:(1)利用210對(duì)多態(tài)性引物(SSR引物150對(duì)、InDel引物60對(duì)),135株荷花F1代為作圖群體,構(gòu)建了包含145個(gè)標(biāo)記,11個(gè)連鎖群的荷花遺傳連鎖圖譜,該圖譜覆蓋基因組長(zhǎng)度625.0cM,標(biāo)記間平均圖距4.31cM。其中LG1遺傳距離為99.1cM,標(biāo)記數(shù)量最多,為91個(gè);LG11遺傳距離為33.9cM,標(biāo)記數(shù)量最少,僅有2個(gè)。(2)共檢測(cè)到14個(gè)QTLs位點(diǎn),可解釋表型變異系數(shù)為6.6%~12.0%。其中控制立葉高性狀的QTLs位點(diǎn)最多為6個(gè),控制花徑的QTLs位點(diǎn)為4個(gè),控制葉長(zhǎng)的QTLs位點(diǎn)為2個(gè),控制花柄高、葉寬的QTLs位點(diǎn)各有1個(gè)?傊,本研究構(gòu)建的荷花遺傳連鎖圖譜,14個(gè)荷花株型相關(guān)性狀QTLs位點(diǎn),將為荷花其他觀賞性狀的研究奠定理論和實(shí)踐的雙重基礎(chǔ),對(duì)指導(dǎo)荷花株型相關(guān)性狀的分子標(biāo)記輔助育種具有重要意義。
【學(xué)位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S682.32
【部分圖文】:

園藝,親本,西湖,情況


父本-小株型-艷陽(yáng)高照 母本—大株型—建選 35圖 2-1 親本在華中農(nóng)業(yè)大學(xué)花卉基地情況Fig.2-1 Parents' growth at huazhong agricultural university

中農(nóng),親本,情況,園藝


父本-小株型-艷陽(yáng)高照 母本—大株型—建選 35圖 2-1 親本在華中農(nóng)業(yè)大學(xué)花卉基地情況Fig.2-1 Parents' growth at huazhong agricultural university圖 2-2 親本在西湖園藝公司基地情況

遺傳圖譜,中農(nóng),群體,情況


圖 2-3 F1 群體在華中農(nóng)業(yè)大學(xué)花卉基地情況Fig.2-3 F1 population growth at huazhong agricultural university2.2.2 分子標(biāo)記的選擇與開(kāi)發(fā)2.2.2.1 620 對(duì) SSR 引物的選擇與開(kāi)發(fā)本研究用于構(gòu)建荷花遺傳圖譜的 SSR 引物有 4 個(gè)來(lái)源:(1)其中 250 對(duì)由美國(guó) Illinois 大學(xué)香檳分校 Ray Ming 教授根據(jù)‘中國(guó)古代蓮’的全基因組測(cè)序信息開(kāi)發(fā),命名為“SSR+序號(hào)”(Ming R et al 2013);(2)50 對(duì)來(lái)源于已發(fā)表的荷花SSR 引物開(kāi)發(fā)的文獻(xiàn)中的(Pan et al 2007;Pan et al 2010;Tian et al 2008;Kubo et al2009a; Kubo et al 2009b),被加以前綴“Nelumbo”、“NS”、"NSh"和“PR”的為基因組 SSR 引物,而前綴為“NNEST”和“NSe”的為 EST-SSR 引物;(3)第三部分由武漢大學(xué)基于熱帶蓮全基因組測(cè)序信息開(kāi)發(fā),其研究人員隨機(jī)選擇 120 對(duì)SSR 標(biāo)記,命名為“NnSSR+序號(hào)”,30 對(duì) EST-SSR 用于熱帶蓮與中國(guó)蓮的遺傳多
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本文編號(hào):2854292

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