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基于EST-SSR的紫斑牡丹品種遺傳多樣性研究

發(fā)布時間:2020-10-20 09:19
   紫斑牡丹(Paeonia Rockii(S.G.Haw et L.A.Lauener)T.Hong et J.J.Li)是毛茛科芍藥屬牡丹組植物,其為中國牡丹家族的重要組成部分,而其野生原種是中國牡丹栽培品種的重要起源種,以其作為重要的種質資源形成特有的西北(紫斑)牡丹品種群,形成中國特色第二大牡丹品種群。紫斑牡丹已成為甘肅省重要的花卉資源及新興油料作物資源,有著巨大的產(chǎn)業(yè)前景。近年來,由于紫斑牡丹種源復雜,不同地區(qū)各自命名,常有同名異物、同物異名現(xiàn)象,在種苗生產(chǎn)、營銷和推廣上存在混亂、互代、以假充真等問題,影響地方產(chǎn)業(yè)信譽,因此建立科學可靠、快速簡單的鑒定體系顯得極為重要。本研究采用了形態(tài)學標記和EST-SSR標記相結合通過聚類分析對57份紫斑牡丹品種供試材料的遺傳多樣性進行了研究。得出以下結論:1.15對EST-SSR標記引物在57份材料中共擴增出65個多態(tài)性位點,每對引物平均擴增出4.333個等位基因,變化范圍在2~7條之間;多態(tài)信息含量(PIC)在0.132~0.836之間,平均為0.618;這表明受試的57份紫斑牡丹品種具有豐富的遺傳多樣性,所選用的15對EST-SSR引物標記具有較高的多態(tài)性。2.研究中供試紫斑牡丹品種的遺傳相似系數(shù)值在0.5212~0.800之間變化,說明紫斑牡丹品種之間遺傳背景比較復雜,品種之間存在相似性又表現(xiàn)出一定的差異性。57份紫斑牡丹在遺傳相似系數(shù)為0.5212處聚為一大類,并且當遺傳相似系數(shù)取最大值0.8000時,‘紅冠鑲翠(HGXC)’與‘金波蕩漾(JBDY)’兩者首先聚在一起,說明這兩個品種之間親緣關系較近,且品種間的差異程度較小。3.利用UPGMA法構建樹狀聚類圖,以花型分析紫斑牡丹品種間親緣關系。比較形態(tài)學研究將牡丹花型劃分為單花類和臺閣花類2大類,在遺傳相似系數(shù)為0.6255處劃分為8類,從8種花型的牡丹品種在8個聚類組中的分布來看,聚類組的劃分與傳統(tǒng)形態(tài)學花型的劃分并未有相關性,而且單花類品種更多的傾向于同類花型的聚類,說明單花類各花型品種間的親緣關系相對較近;此為,當演化途徑相同時,各花型品種間的親緣關系也表現(xiàn)的相對較近。4.通過花色分析紫斑牡丹品種間親緣關系。樹狀聚類圖在遺傳相似系數(shù)為0.5870處時,可將57份品種分為4類,第Ⅰ類為包含7種花色的51個紫斑牡丹品種,且花色相同的品種并沒有首先聚在一起;第Ⅱ類為4個品種包含2種不同的花色;進一步說明了遺傳聚類組的劃分與花色的劃分沒有相關性;第Ⅲ類為‘黃云’1個品種,單獨聚為一類,其在開花后花色有淡化,由黃色變?yōu)榘咨。第Ⅳ類為四川牡?單獨聚為一類,主要原因在于其是川牡丹與紫斑牡丹的雜交后代,具有復雜的遺傳背景,說明紫斑牡丹的栽培品種與種間雜交選育的品種之間親緣關系較遠。
【學位單位】:甘肅農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:S685.11
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
    1 前言
    2 牡丹組種質資源研究概況
        2.1 牡丹組野生種質資源
        2.2 牡丹組栽培品種種質資源
    3 牡丹組植物親緣關系研究
        3.1 牡丹野生種之間親緣關系的研究進展
        3.2 牡丹栽培品種之間親緣關系的研究進展及現(xiàn)狀
    4 牡丹種質資源遺傳多樣性的研究進展
        4.1 牡丹種質資源遺傳多樣性的研究
        4.2 牡丹種質資源遺傳多樣性的分子標記技術
        4.3 牡丹種質資源遺傳多樣性研究存在的問題
    5 EST-SSR分子標記及應用
    6 研究目的及意義
        6.1 研究目的
        6.2 研究意義
    7 研究過程的技術路線
第二章 實驗材料與方法
    1 實驗材料
    2 實驗儀器及試劑
        2.1 主要實驗儀器
        2.2 主要試劑
    3 實驗方法
        3.1 基因組DNA提取
        3.2 DNA濃度與質量檢測
    4 引物篩選
    5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
第三章 結果與分析
    1 DNA的提取與檢測
        1.1 紫斑牡丹DNA提取
        1.2 紫斑牡丹DNA檢測
    2 PCR擴增程序優(yōu)化
        2.1 退火溫度
        2.2 循環(huán)次數(shù)
    3 引物篩選
    4 擴增產(chǎn)物的多態(tài)性分析
    5 EST-SSR標記分析
        5.1 EST-SSR標記的遺傳距離分析
        5.2 EST-SSR標記的聚類分析
第四章 討論
    1 紫斑牡丹DNA的提取
    2 反應程序優(yōu)化的討論
    3 遺傳多樣性的討論
    4 聚類分析的討論
第五章 結論
參考文獻
附錄
致謝
作者簡介及發(fā)表論文
導師簡介

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本文編號:2848501

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