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芍藥種子萌發(fā)關(guān)鍵基因PlCYP707As的克隆及植物表達載體構(gòu)建

發(fā)布時間:2020-09-29 22:28
   芍藥為芍藥科芍藥屬多年生的宿根草本花卉,是我國古老的名花。其觀賞價值可以與花王牡丹相媲美,有花相之稱,在園林造景中普遍應(yīng)用。長時間的系統(tǒng)進化形成了芍藥種子獨特的上下胚軸雙重休眠的特征,給芍藥新品種的選育工作帶來很大困難,對芍藥的產(chǎn)業(yè)化發(fā)展十分不利。本研究是以芍藥父本'粉玉樓',母本'粉玉奴'的雜交種子為試驗材料,選取萌發(fā)過程中四個關(guān)鍵時期的種子為樣品進行轉(zhuǎn)錄組測序,篩選出調(diào)控芍藥種子萌發(fā)的關(guān)鍵基因PlCYP707A1和PlCYP707A2,分析基因表達模式,克隆基因cDNA全長并進行生物信息學(xué)分析及植物表達載體構(gòu)建,為后續(xù)轉(zhuǎn)化擬南芥的轉(zhuǎn)基因功能驗證奠定基礎(chǔ)。主要的試驗結(jié)果如下:1.分析轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),鎖定了脫落酸分解代謝途徑中的調(diào)控基因PlCYP707A1和PlCYP707A2為目標(biāo)基因。以轉(zhuǎn)錄組測序所得CDS序列為基礎(chǔ),設(shè)計定量引物,通過半定量RT-PCR和實時定量PCR技術(shù)分析PlCFP707A1和PlCYP707A2基因的表達量,結(jié)果顯示PlCYP707A1基因在吸脹后和下胚軸萌發(fā)時表達量有明顯升高,PlCYP70742基因在芍藥種子萌發(fā)過程中含量逐漸增加�?傮w來說,在芍藥種子萌發(fā)過程中PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的表達量升高,對打破休眠起到了促進作用。2.以轉(zhuǎn)錄組測序所得CDS序列為基礎(chǔ),設(shè)計同源克隆引物,PCR擴增后獲得cDNA全長1407bp,編碼468個氨基酸的PlCYP707A1基因和cDNA全長1392bp,編碼463個氨基酸的PlCYP707A2基因。同時以PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的cDNA序列為信息探針,搜索GenBank的基因組或表達序列數(shù)據(jù)庫,獲得不同物種間的同源基因氨基酸序列,構(gòu)建進化樹。利用各種在線軟件對PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的蛋白質(zhì)的一級、二級、三級結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞初步定位等進行了預(yù)測分析。3.利用pBI121植物載體和DNA重組技術(shù)構(gòu)建了 PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的表達載體pBI-PlCYP707A1和pBI-PlCYP707A2,接著將其轉(zhuǎn)化到GV3101型農(nóng)桿菌制備的感受態(tài)中,為后續(xù)基因轉(zhuǎn)化擬南芥做功能驗證奠定基礎(chǔ)。
【學(xué)位單位】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2017
【中圖分類】:S682.12;Q943.2
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
    1.1 芍藥概述
    1.2 種子休眠機理的研究進展
        1.2.1 影響種子休眠的因素
        1.2.2 植物激素GA對種子休眠解除的調(diào)控作用
        1.2.3 植物激素ABA對種子休眠解除的調(diào)控作用
        1.2.4 其他植物激素對種子休眠解除的調(diào)控作用
    1.3 ABA在休眠萌發(fā)過程中的相關(guān)調(diào)控基因
    1.4 ABA 8'-羥化酶(CYP707As基因)的研究進展
        1.4.1 ABA8'-羥化酶的作用機理
        1.4.2 CYP707As基因(ABA 8'-羥化酶)的表達模式
    1.5 植物表達載體構(gòu)建的研究進展
    1.6 本研究的目的意義與技術(shù)路線
        1.6.1 本研究的目的意義
        1.6.2 本研究的技術(shù)路線和內(nèi)容
第二章 PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的表達模式分析
    2.1 試驗材料
    2.2 試驗試劑與儀器
        2.2.1 試驗試劑
        2.2.2 溶液的配制
        2.2.3 試驗儀器
    2.3 試驗方法
        2.3.1 種子的沙藏催芽
        2.3.2 芍藥種子RNA的提取
        2.3.3 RNA質(zhì)量的檢測
        2.3.4 反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
        2.3.5 半定量RT-PCR分析
        2.3.6 qRT-PCR分析
    2.4 結(jié)果與分析
        2.4.1 芍藥種子總RNA的提取質(zhì)量
        2.4.2 芍藥種子合成的cDNA電泳檢測
        2.4.3 半定量RT-PCR循環(huán)次數(shù)的確定
        2.4.4 PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的半定量RT-PCR分析
        2.4.5 PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的qRT-PCR分析
    2.5 小結(jié)
第三章 PlCYP707A1和PlCP707A2基因的克隆與生物信息學(xué)分析
    3.1 試驗材料
    3.2 試驗試劑與儀器
        3.2.1 試驗試劑
        3.2.2 菌體及載體
        3.2.3 溶液的配制
        3.2.4 試驗儀器
    3.3 試驗方法
        3.3.1 PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的cDNA擴增
        3.3.2 TA克隆
        3.3.3 生物信息學(xué)分析工具
    3.4 結(jié)果與分析
        3.4.1 PlCYP707A1基因cDNA全長的擴增產(chǎn)物
        3.4.2 PlCYP707A1基因的生物信息學(xué)分析
        3.4.3 PlCYP707A2基因cDNA全長的擴增產(chǎn)物
        3.4.4 PlCYP707A2基因的生物信息學(xué)分析
    3.5 小結(jié)
第四章 PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)化
    4.1 試驗材料
    4.2 試驗試劑與儀器
        4.2.1 試驗試劑
        4.2.2 菌體及載體
        4.2.3 溶液的配制
        4.2.4 試驗儀器
    4.3 試驗方法
        4.3.1 重組質(zhì)粒PGM-T-CYP707As的提取
        4.3.2 重組質(zhì)粒PGM-T-CYP707As的雙酶切
        4.3.3 載體質(zhì)粒pBI121的雙酶切
        4.3.4 目的基因與載體質(zhì)粒相連
        4.3.5 植物表達載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌
    4.4 結(jié)果與分析
        4.4.1 pBI121-CYP707A1重組載體的菌落PCR鑒定
        4.4.2 pBI121-CYP707A1重組載體的雙酶切驗證
        4.4.3 pBI121-CYP707A2重組載體的菌落PCR鑒定
        4.4.4 pBI121-CYP707A2重組載體的雙酶切驗證
        4.4.5 pBI121-CYP707A1/CYP707A2重組農(nóng)桿菌菌落PCR鑒定
    4.5 小結(jié)
第五章 結(jié)論與討論
    5.1 結(jié)論
        5.1.1 明確PlCYP707A1和PlCYP707A2基因在芍藥種子萌發(fā)過程中的表達模式
        5.1.2 克隆得到芍藥PlCYP707A1和PlCYP707A2基因
        5.1.3 構(gòu)建PlCYP707A1和PlCYP707A2基因的植物表達載體并轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌
    5.2 討論
參考文獻
致謝

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本文編號:2830349

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