草莓果實(shí)花青素苷轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2020-08-03 09:01
【摘要】:草莓(Fragaria × ananassa Duch.)屬于薔薇科草莓屬多年生草本植物,為世界范圍內(nèi)廣泛栽培、多用于鮮食的水果。其果實(shí)因富含營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)(如維生素C,維生素A,花青素等),風(fēng)味獨(dú)特、香甜,以及顏色鮮艷受到廣大消費(fèi)者的喜愛(ài);ㄇ嗨夭粌H是一種重要的抗氧化物質(zhì),對(duì)人體有重要的保健功能,而且是草莓果實(shí)顏色形成的主要原因,是評(píng)判果實(shí)外觀品質(zhì)的核心指標(biāo),直接影響著果實(shí)的商品價(jià)值。因此,增加果實(shí)中花青素的含量,成為了草莓育種者和栽培者追求的目標(biāo)。自然界中不同顏色草莓果實(shí)尤其是淺色(如黃、白色)材料的存在,為探索草莓果實(shí)花青素積累機(jī)制提供了良好機(jī)會(huì),并在研究中得到了應(yīng)用,但都局限于野生二倍體森林草莓或五葉草莓中,且大都集中于對(duì)已知的花青素合成和調(diào)控相關(guān)基因或轉(zhuǎn)錄因子的研究,而對(duì)栽培的八倍體草莓花青素合成與調(diào)控的研究甚少、尤其是在草莓自身的花青素合成與調(diào)控的新基因挖掘方面的研究還鮮見(jiàn)報(bào)道。本研究選用遺傳背景一致的紅肉('紅顏')和白肉('小白')八倍體栽培草莓,利用組學(xué)、生物信息學(xué)以及基因功能驗(yàn)證對(duì)草莓中花青素的調(diào)控關(guān)鍵和網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了研究。主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下:1.采用高效液相色譜(High-performance liquid chromatography,HPLC)方法測(cè)定八倍體紅肉草莓'紅顏'和白肉草莓'小白'5個(gè)發(fā)育成熟階段果實(shí)表皮和果肉中兩種主要花青素苷(天竺葵3葡萄糖苷:Pelargonidin 3-glucoside,Pg3G和矢車(chē)菊素3葡萄糖苷:Cyanidin 3-glucoside,Cy3G)含量變化。結(jié)果顯示,'紅顏'果實(shí)果肉中僅有Pg3G積累,且其含量隨著果實(shí)發(fā)育成熟過(guò)程逐漸增加;'小白'果實(shí)果肉中無(wú)花青素苷積累。'紅顏'和'小白'果實(shí)表皮中Pg3G和Cy3G均有積累,其中Pg3G含量約為Cy3G的2-3倍,且'紅顏'果實(shí)表皮中花青素苷含量高于'小白'果實(shí)表皮中的含量。2.利用同源克隆方法從'小白'草莓果實(shí)中克隆出花青素苷合成酶(Anthocyanin synthase,ANS)基因 并采用實(shí)時(shí)定量(Real-time quantitative PCR,qPCR)方法對(duì)其在'紅顏'和'小白'果實(shí)中的表達(dá)量進(jìn)行測(cè)定,然后通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法,在'小白'果實(shí)中瞬時(shí)過(guò)表達(dá)FaANS對(duì)其進(jìn)行功能分析表明,FaANS在'小白'果實(shí)果肉中表達(dá)水平遠(yuǎn)低于其在'紅顏'果實(shí)果肉中的表達(dá)量,并且過(guò)表達(dá)FaANS后的'小白'果實(shí)較對(duì)照無(wú)明顯的表型變化,表明過(guò)表達(dá)FaANS不能恢復(fù)'小白'果實(shí)中花青素苷的積累。3.利用RNA測(cè)序(RNA sequencing,RNAseq)技術(shù)對(duì)'小白’和'紅顏'白果和全紅期果實(shí)果肉進(jìn)行高通量深度轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并對(duì)其花青素苷合成相關(guān)基因和調(diào)控因子的表達(dá)模式進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),與'紅顏'相比,幾乎所有花青素苷合成途徑中關(guān)鍵酶基因(CHS、CHI、F3H、DFR、ANS和UFGT)的表達(dá)水平在'小白'中均受到抑制,而F3'H由于其在'小白'和'紅顏'中的表達(dá)量極低,在兩個(gè)品種草莓中的表達(dá)水平無(wú)明顯差異。轉(zhuǎn)錄因子MYB1R在'小白’中上調(diào),WD40在'小白'中顯著下調(diào)。4.利用HPLC方法對(duì)'紅顏'和'小白'果實(shí)發(fā)育過(guò)程中的抗壞血酸(Ascorbicacid,AsA)進(jìn)行測(cè)定發(fā)現(xiàn),高花青素苷含量的'紅顏'含有高AsA水平。并基于RNAseq數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)方法對(duì)其代謝通路基因表達(dá)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),這種差異主要是通過(guò)對(duì)D-葡萄糖醛酸途徑的調(diào)控造成。在'小白'中,該途徑中關(guān)鍵酶基因PME、PG以及GalUR的表達(dá)水平均較其在'紅顏'中的表達(dá)量顯著下降。此外,與'紅顏'中的表達(dá)水平相比,'小白'中蔗糖合成關(guān)鍵基因表達(dá)也受到抑制,但生長(zhǎng)素、赤霉素以及乙烯信號(hào)途徑中的關(guān)鍵基因(如AUX/IAA、GA20ox、ERF等)的表達(dá)均有所增強(qiáng)。5.基于RNAseq數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)方法對(duì)草莓中花青素苷相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long non-coding RNAs,lncRNAs)進(jìn)行篩選鑒定發(fā)現(xiàn),草莓中有50,601個(gè)轉(zhuǎn)錄本為可能的lncRNAs。與'紅顏'相比,'小白'中分別有19個(gè)和12個(gè)lncRNAs在白果期顯著下調(diào)或上調(diào);49個(gè)和20個(gè)lncRNAs在紅果期顯著下調(diào)或上調(diào),6個(gè)lncRNAs在紅果和白果時(shí)期均下調(diào)以及4個(gè)lncRNAs在紅果和白果時(shí)期均上調(diào)。對(duì)草莓中已知的小RNA(microRNA,miRNA)進(jìn)行前體及靶基因預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),130個(gè)lncRNAs可能作為80個(gè)miRNAs的前體,其中僅有1個(gè)lncRNA在'小白’和'紅顏'中的表達(dá)水平存在差異;392個(gè)miRNAs靶向60個(gè)差異表達(dá)的lncRNAs,說(shuō)明lncRNAs主要是通過(guò)作為miRNAs的靶基因參與花青素苷的調(diào)控。通過(guò)lncRNAs及miRNAs前體與靶基因互作構(gòu)建了 lncRNAs參與草莓花青素苷的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。6.通過(guò)同源克隆方法從草莓果實(shí)中克隆出FaMYB1O基因,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法在'小白'和'紅顏'果實(shí)中進(jìn)行過(guò)量表達(dá)FaMYB10發(fā)現(xiàn),過(guò)表達(dá)FaMYB10后的'小白’果實(shí)表型發(fā)生明顯變化,由白色果肉變?yōu)榧t色果肉;在過(guò)表達(dá)FaMYB10后的'紅顏’果實(shí)中,果實(shí)表皮和果肉的顏色均較對(duì)照變深。利用HPLC方法測(cè)定表明,FaMYB10過(guò)表達(dá)后的'小白'和'紅顏'果肉中均恢復(fù)了 Cy3G的積累,而在果實(shí)表皮中Cy3G含量較對(duì)照明顯增加。利用qPCR方法對(duì)過(guò)表達(dá)FaMYB10的'小白'果實(shí)果肉中花青素苷相關(guān)基因及調(diào)控因子表達(dá)水平進(jìn)行檢測(cè)表明,在過(guò)表達(dá)果實(shí)中花青素苷合成關(guān)鍵基因CHS、CHI、DFR、F3’H、ANS和UFGT表達(dá)量均顯著上升,其中F3’H基因在正常生長(zhǎng)條件下的'紅顏’和'小白’中幾乎不表達(dá),但在過(guò)表達(dá)果實(shí)中其表達(dá)量顯著增加,說(shuō)明FaMYB10可能對(duì)其表達(dá)進(jìn)行調(diào)控,從而使過(guò)表達(dá)果實(shí)中花青素苷Cy3G恢復(fù)積累。
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類(lèi)號(hào)】:S668.4
【圖文】:
花青素苷屬于植物次生代謝過(guò)程中產(chǎn)生的一種類(lèi)黃酮化合物,其基本結(jié)構(gòu)為C6-C3-逡逑C6,是多羥基或多;擒,2-苯基苯并吡喃的衍生物。目前,已有近700種花青素苷逡逑在植物中被發(fā)現(xiàn)[14],根據(jù)其取代基的不同位置主要分為6大類(lèi)(圖1-1):天竺葵素逡逑(Pelargonidin,Pg)、矢車(chē)菊素(Cyanidin,Cy)、飛燕草素(Delphinidin,邋Dp)、茍藥素逡逑(Peonidin,邋Pn)、矮牽牛素(Petunidin,Pt)以及錦葵素(Malvidin,Mv)邋[15,16]。至今,逡逑許多研宄利用液質(zhì)聯(lián)用(HPLC-MS)和高效液相色譜(HPLC-DA)技術(shù)從草莓中已分逡逑離鑒定出多種花青素苷,比如天竺葵素或矢車(chē)菊素3-蕓香苷(?613租011丨(1丨11/#荊蓿保背兀保保常
本文編號(hào):2779404
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類(lèi)號(hào)】:S668.4
【圖文】:
花青素苷屬于植物次生代謝過(guò)程中產(chǎn)生的一種類(lèi)黃酮化合物,其基本結(jié)構(gòu)為C6-C3-逡逑C6,是多羥基或多;擒,2-苯基苯并吡喃的衍生物。目前,已有近700種花青素苷逡逑在植物中被發(fā)現(xiàn)[14],根據(jù)其取代基的不同位置主要分為6大類(lèi)(圖1-1):天竺葵素逡逑(Pelargonidin,Pg)、矢車(chē)菊素(Cyanidin,Cy)、飛燕草素(Delphinidin,邋Dp)、茍藥素逡逑(Peonidin,邋Pn)、矮牽牛素(Petunidin,Pt)以及錦葵素(Malvidin,Mv)邋[15,16]。至今,逡逑許多研宄利用液質(zhì)聯(lián)用(HPLC-MS)和高效液相色譜(HPLC-DA)技術(shù)從草莓中已分逡逑離鑒定出多種花青素苷,比如天竺葵素或矢車(chē)菊素3-蕓香苷(?613租011丨(1丨11/#荊蓿保背兀保保常
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