西瓜果實及株型相關(guān)性狀的遺傳及分子機理研究
【學(xué)位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S651
【圖文】:
西瓜果實及株型相關(guān)性狀的遺傳及分子機理研宄(BSA-seq);對所有植株的葉片進行取樣,保存于-20°C,親本不同發(fā)育時期的子房以及果實不同部位進行取樣,并立°C保存,用于RNA的提取。逡逑中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所西甜瓜種質(zhì)資源中期庫中的西瓜資源進行全基因組重測序,每個品種種植10株,。模危粒凸具M行全基因組重測序,在植株整個生長發(fā)育皮顏色、果形指數(shù)、植株長短、開花早晚以及果肉成分等多與相關(guān)性狀進行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)。所有材料均在大棚西瓜栽培技術(shù)進行管理。330份西瓜品種及資源如附錄IA邐B逡逑
邐華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2018屆博士研究生學(xué)位論文邐逡逑信息開發(fā)出298個CAPS標記(附錄II),將這298個CAPS標記先在兩親本逡逑中進行多態(tài)性檢測,然后將具有多態(tài)性的標記在768個F2群體(2016年冬季逡逑348株,2017年春季420株)中進行PCR、酶切、凝膠電泳檢測,檢測群體中逡逑的多態(tài)性,通過篩選重組單株對候選基因精細定位。最終將候選基因定位到逡逑CAPS0158和CAPS0165兩個標記之間,在這兩個標記的位置各有3個重組單逡逑株,CAPS0158對應(yīng)的區(qū)域為3號染色體26,817,672邋bp,CAPS0165對應(yīng)的區(qū)域逡逑為26,864,814邋bp,因此候選基因C/F幻被定位到3號染色體26.817邋Mb到26.863逡逑Mb約46邋Kb的區(qū)域內(nèi),如圖2-4所示。逡逑K邋-邐-邋-邐-邐—邐?逡逑
在F2群體中隨機選取100個單株,用此標記對它們進行多態(tài)性檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)逡逑此標記和果實長圓完全連鎖,進一步證明了邋ClaOl邋1257為控制西瓜果實長圓的逡逑候選基因C/FM,如圖2-5所示。逡逑3.7候選基因的蛋白預(yù)測逡逑A逡逑丨QD邋domain逡逑97103邋II邋1—1邋H邐1邋1逡逑Charleston邋Gray邐|邐^邐Deletion邋|邐|逡逑Spherical邋Watermelon邐^邐邐邋|邐|逡逑Elongate邋Watermelon邋|邐|邐^邐M ̄丨邐「逡逑IQD31邐/逡逑B邐吖聲逡逑eB2邐\邋r逡逑@邋r6逡逑^_^燈2。21130邐\逡逑V邋AT2G33640逡逑圖2-6候選基因的結(jié)構(gòu)差異及互作蛋白預(yù)測逡逑A為ClaOl邋1257在兩個參考基因組以及兩親本中的結(jié)構(gòu)差異信息,B為與ClaOl邋1257編碼逡逑序列同源的IQD26蛋白互作調(diào)控網(wǎng)絡(luò)信息。逡逑Fig.邋2-6邋Analysis邋of邋nucleotide邋polymorphisms邋and邋protein邋function邋prediction逡逑A
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本文編號:2764766
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