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日本結(jié)縷草鋁脅迫轉(zhuǎn)錄響應及ZjOMT功能研究

發(fā)布時間:2020-07-10 04:25
【摘要】:隨著全球環(huán)境氣候的變化以及工業(yè)化和城市化程度的提高,南方土壤酸化加劇,對植物的生長造成了很大的危害,對人類生存環(huán)境和生活品質(zhì)產(chǎn)生了很大影響。培育抗鋁的植物品種并應用到生產(chǎn)生活中是一種比較直接的方法,并且具有生態(tài)、環(huán)保、經(jīng)濟的優(yōu)勢。日本結(jié)縷草是一種優(yōu)良的暖季型草坪草,廣泛生長在南北方的廣大地區(qū),它能在含鋁量比較高的酸化土壤中生長良好,是一種耐鋁的植物。為了揭示日本結(jié)縷草耐鋁的分子機制,本研究對日本結(jié)縷草鋁脅迫下響應的轉(zhuǎn)錄組進行了分析,在此基礎上研究了日本結(jié)縷草ZjOMT基因的序列和功能特征,并在大腸桿菌和擬南芥中進行表達。主要結(jié)果如下:(1)日本結(jié)縷草鋁響應轉(zhuǎn)錄組分析通過鋁處理和未處理的日本結(jié)縷草轉(zhuǎn)錄組測序,獲得了 34,743個Unigenes,其中14,555個為差異表達基因,包括4,845個下調(diào)基因和9,710個上調(diào)基因。差異表達基因中93.17%的基因為已知基因,其中314個基因尚未被注釋,已經(jīng)被注釋的的基因中,包含大量的轉(zhuǎn)運蛋白基因、轉(zhuǎn)錄因子、熱激蛋白基因、離子通道蛋白基因、參與氧化還原反應的基因、以及參與果膠合成、檸檬酸合成等抗鋁相關的基因。新基因中與離子結(jié)合相關的XLOC_007305、XLOC_010540、XLOC_03748在鋁脅迫過程中表達量明顯提高。KEGG富集顯示:在鋁脅迫下,日本結(jié)縷草中糖酵解途徑、抗壞血酸和代謝、氧化磷酸化、光合作用和脂肪酸生物合成與鋁脅迫響應較為密切。(2)日本結(jié)縷草ZjOMT基因克隆及表達分析從日本結(jié)縷草中克隆了一個甲基轉(zhuǎn)移酶基因ZjOMT。ZjOMT編碼序列為1080bp,編碼蛋白序列包含359個氨基酸。鋁脅迫下,ZjOMT在葉和根中的表達量上調(diào)可達20.86倍和31.18倍。(3)日本結(jié)縷草ZjOMT基因功能研究將ZjOMT蛋白基因在大腸桿菌中進行表達,大腸桿菌的褪黑素合成能力提高了8倍,并且重組載體的鋁抗性顯著提高。將ZjOMT基因進一步轉(zhuǎn)入擬南芥中進行過量表達,轉(zhuǎn)基因植株的褪黑素含量明顯上升,3個過量表達ZjOMT基因的轉(zhuǎn)基因擬南芥株系褪黑素含量最高達72 ng/g,為野生型的4.0倍。另外兩個株系也分別高達3.2倍和2.7倍。轉(zhuǎn)基因植株的根長在200μM氯化鋁脅迫下比對照分別減少了 20%、35%和37%,而野生型的根伸長減少60%,野生型擬南芥遭受氯化鋁毒害,根長僅為過量表達ZjOMT基因株系的57-78%,轉(zhuǎn)基因株系在200 μM氯化鋁脅迫下MDA含量分別為野生型含量的81.1%、73.5%、64.4%,過量表達ZjOMT基因的擬南芥抗鋁性顯著提高。ZjOMT基因的表達可以提高植物褪黑素含量,進而提高抗鋁毒能力,ZjOMT既可以作為提高作物褪黑素含量的候選基因,也可作為植物抗鋁毒基因工程的基因資源。
【學位授予單位】:北京林業(yè)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S688.4
【圖文】:

生理生化分析,日本結(jié)縷草,鋁脅迫,圖數(shù)


逑mg/kg,MDA含量、CAT和POD酶活力顯著高于對照,達到極顯著水平(P<0.01),逡逑葉綠素含量雖有下降但未達極顯著水平(圖2-1)。逡逑豸邋31邐15-1邐B逡逑§邐>邐AB逡逑f邋2'4'邋T邋T邋T邋A邋A邐12'邋A邋A邐^邋I逡逑—邋i邋#邐T邋r邋A邐0邋T邋T邋A邋I逡逑I邐1.8-上邐i邐N邐I邐I邐E邐9.邋i邋N邋*逡逑1邐i逡逑2邐1.2.邐|邐6-逡逑I邐8逡逑!邐0.6-邐g邐3_逡逑5邐2逡逑0邐邐y邐邋■邐:邋.:■邐k邐.....:-邐^邐.:邐,邐:邐.邐■邐Q邐^逡逑0邐20邐40邐60邐80邐100邐0邐20邐40邐60邐80邐100逡逑Concentration邋of邋Al>邋treatment邋(mg/kg邋soil)邐Concentration邋of邋Ab-*-邋treatment邋(mg/kg邋soil)逡逑S'邐600-j邐5邐16500邐!逡逑i邐u.邐B逡逑O)邐g邐0i邐丫逡逑塞邐560邋-邐I邐13200邐-邋?邋N逡逑AB邐i邐1邐A邐a邐A逡逑I邐52°*邐A邐A邐A邐^邐I邐|邐"°°-邐t邐I邐I邐I逡逑<i邐T邐:暴邐m邐_邐呡邐<3逡逑5邋480邋-上邋*邐5邐6600邋-逡逑^邐S逡逑f邋440邋-邐f邋3300-逡逑導邐1逡逑h-邋400邐邐邐邐邐.邐.邐,邐.邋Q邋0-1邐,邐,邐,邐,邐,邐

散點圖,散點圖,鋁脅迫,日本結(jié)縷草


我們利用FDR與log2FC來篩選差異基因,篩選條件為FDR<0.05且l0g2FC>l,逡逑經(jīng)過鋁脅迫處理后,發(fā)現(xiàn)差異基因丨4,555個,上調(diào)的有9,710個,下調(diào)基因4,845個,逡逑(圖2-2)。通過鋁脅迫處理和對照之間的分析和比較,部分基因表達發(fā)生了變化,逡逑正因為這些基因的差異表達賦予了日本結(jié)縷草鋁脅迫的抗性。逡逑Scatter邋plot逡逑pearson邋correlation:邋0.716逡逑?邐up-regulated邋genes邋(9710)逡逑_邋down-regulated邋genes邋(4845)邐#邋■暴逡逑0邋?邋not邋differential邋expressed邋(20188)邐^逡逑r逡逑?邐%邋?邋?逡逑CO逡逑9)逡逑產(chǎn)邐L"!邐1邐1邐1邐逡逑10-03邐1e-01邐1?+01邐1e+03逡逑Value邋of邋CK逡逑圖2-2差異基因散點圖逡逑Fig.邋2-2邋Scatter邋plot邋of邋differentially邋expressed邋genes逡逑表2-3列舉了邋994個新基因中的16個表達量較高的差異表達基因,鋁脅迫處理逡逑31逡逑

差異表達基因,基因,鋁脅迫


我們選取了邋4個下調(diào)已注釋基因、4個上調(diào)已注釋基因和4個未注析基因共12逡逑個基因?qū)︿X脅迫后不同時間段進行了邋q-PCR熒光定量分析,其結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)逡逑果相一致(圖2-5)。其中兩基因F調(diào)表達后有所逡逑回升似/ve邋fraracn沖基因下調(diào)較明顯,而逡逑基因下調(diào)趨勢較緩。上調(diào)己注釋基因中,過氧化物酶(Peroxisome)、應激誘導蛋白逡逑(stress邋inducible邋protein)、鋅指蛋白(zinc邋finger邋protein)基因基本逐步上調(diào),而逡逑基因先升后降最終略高于未處理。新基因中跟水解酶相關的逡逑XLOC_000365、與陽離子結(jié)合相關的XLOC_006073都逐漸下調(diào),與金屬離子結(jié)合的逡逑XLOC_010540基因穩(wěn)步上調(diào),而與金屬簇結(jié)合相關的XLOC_037486基因先上調(diào)后逡逑緩慢回落。在鋁脅迫植物的整個過程中,許許多多基因參與其中,其表達模式也多種逡逑多樣,有的在作用通路中形成負反饋調(diào)節(jié),與其他基因共同形成動態(tài)平衡,無論基因逡逑的表達模式如何

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本文編號:2748449

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