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奶白菜紫葉柄基因的精細(xì)定位

發(fā)布時(shí)間:2020-06-21 11:52
【摘要】:奶白菜(Brassica campestris ssp.chinensis L.)是我國(guó)華南地區(qū)主栽的小白菜品種,葉色深綠、葉柄嫩白、綿甜可口,深受消費(fèi)者的歡迎,近年來(lái)其他地區(qū)廣泛引種。引到北方種植的奶白菜品種,苗期群體內(nèi)經(jīng)常出現(xiàn)一些紫葉柄植株,影響到品種的整齊性。研究表明,奶白菜的紫葉柄性狀是葉柄中花青素積累的結(jié)果。本研究利用穩(wěn)定遺傳的綠葉柄奶白菜自交系(K6)與紫葉柄奶白菜自交系(K19)雜交,構(gòu)建F_1、F_2和BC_1群體,在對(duì)紫葉柄性狀的遺傳特性進(jìn)行分析鑒定的基礎(chǔ)上,利用大規(guī)模F_2分離群體,采用BSR-Seq和SSR方法,對(duì)紫葉柄基因進(jìn)行了精細(xì)定位,主要研究結(jié)果如下。1.紫葉柄性狀的遺傳特性基于雜交親本K6和K19,及其F_1、F_2和BC_1群體苗期葉柄顏色鑒定結(jié)果,證明供試的奶白菜紫葉柄性狀受顯性核基因Ps控制,K6的基因型為psps,K19基因型PsPs。2.基于BSR-Seq技術(shù)的奶白菜紫葉柄基因初步定位選取F_2分離群體中紫葉柄和綠葉柄表型的植株各50株,提取總RNA構(gòu)建極端表型池,進(jìn)行BSR分析。通過(guò)測(cè)序獲得紫葉柄與綠葉柄植株在轉(zhuǎn)錄層次上的序列變異,確定紫葉柄性狀相關(guān)SNP位點(diǎn),將紫葉柄性狀控制基因初步定位到A07染色體上19.9cM-26.1cM區(qū)間。3.基于SSR連鎖標(biāo)記分析的奶白菜紫葉柄基因精細(xì)定位基于BSR測(cè)序結(jié)果,在定位區(qū)域開(kāi)發(fā)設(shè)計(jì)SSR標(biāo)記引物,經(jīng)過(guò)多次篩選與鑒定,將紫葉柄基因定位到A07染色體SSRL2和SSRL8兩個(gè)標(biāo)記之間,物理距離51.9kb。參考白菜基因組信息,在定位區(qū)段內(nèi)共有9個(gè)基因。結(jié)合BSR-Seq分析檢測(cè)到BraA07003126為定位區(qū)間內(nèi)的差異表達(dá)基因,因此,預(yù)測(cè)其為Ps的候選基因。4.候選基因克隆及表達(dá)分析對(duì)候選基因進(jìn)行全長(zhǎng)克隆測(cè)序,發(fā)現(xiàn)紫葉柄奶白菜自交系K19在BraA07003126第一個(gè)外顯子上有一個(gè)T-C的SNP突變,導(dǎo)致遺傳密碼發(fā)生錯(cuò)意突變,使蛋白質(zhì)氨基酸序列由苯丙氨酸變成了絲氨酸。對(duì)BraA07003126進(jìn)行表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)其在野生型材料(K6)中的表達(dá)水平顯著高于突變體材料(K19),在K6不同發(fā)育階段的葉柄中的表達(dá)水平無(wú)明顯差異,在K19不同發(fā)育階段的葉柄中表達(dá)水平不同,抽薹期最高,苗期最低。
【學(xué)位授予單位】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類(lèi)號(hào)】:S634.3
【圖文】:

花青素,植物,糖基,生物合成代謝


圖 1-1 植物花青素結(jié)構(gòu)Fig.1-1 Structure of anthocyanins注:R1 和 R2 是-H、-OH 或-OCH3;R3 是-H 或糖基;R4 是-OH 或糖基;tation:R1 and R2 are -H, -OH, or -OCH3; R3 is a -H or glycosyl; and R4 is -OH or g合成途徑對(duì)植物花青素以及類(lèi)黃酮物質(zhì)生物合成代謝途

花青素,生物合成途徑,糖基,生物合成代謝


圖 1-1 植物花青素結(jié)構(gòu)Fig.1-1 Structure of anthocyanins注:R1 和 R2 是-H、-OH 或-OCH3;R3 是-H 或糖基;R4 是-OH 或糖基;Annotation:R1 and R2 are -H, -OH, or -OCH3; R3 is a -H or glycosyl; and R4 is -OH or glycosyl.1.1.2 花青素的生物合成途徑1.1.2.1 合成途徑目前為止,人們對(duì)植物花青素以及類(lèi)黃酮物質(zhì)生物合成代謝途徑的研究已經(jīng)日漸成

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本文編號(hào):2724026

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