高溫脅迫下黃瓜幼苗下胚軸長遺傳分析和QTL定位
【圖文】:
2.3.3邋BSA生物倌息分析方法逡逑信息分析的內(nèi)容包括:數(shù)據(jù)質(zhì)控(去除接頭和低質(zhì)量數(shù)據(jù))、與參考基因組比對、變異逡逑檢測與注釋(SNP、InDel)、關聯(lián)分析、候選SNP及候選基因的注釋。具體流程如圖3-2逡逑所示:逡逑
4.1邋BSA結果分析逡逑分析結果如下圖所示:對經(jīng)過篩選得到的高質(zhì)量SNP和InDel位點(reads支持度彡4),逡逑利用A邋SNP-index邋(圖3-3)和ED算法(圖3-4)對測序結果進行關聯(lián)性分析得到相關閾值,逡逑目標位點及其連鎖區(qū)域應趨于該閾值附近。SNP和InDel關聯(lián)分析取交集(表3-4邋)得到總逡逑長度約為1.4Mb的候選區(qū)間,,共注釋得到165個基因。逡逑
【學位授予單位】:揚州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S642.2
【相似文獻】
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本文編號:2710638
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