【摘要】：黃瓜(Cucuumis sativus L.)是我國(guó)重要的蔬菜作物,為我國(guó)蔬菜周年均衡生產(chǎn)和供應(yīng)創(chuàng)造了巨大的經(jīng)濟(jì)效益和社會(huì)效益。黃瓜原產(chǎn)于溫暖濕潤(rùn)的亞熱帶地區(qū),具有喜溫不耐熱的特性。在我國(guó)南方栽培過(guò)程中,高溫脅迫已成為限制黃瓜優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)的主要因素之一。下胚軸長(zhǎng)是黃瓜幼苗的重要農(nóng)藝性狀之一。黃瓜苗期下胚軸過(guò)度伸長(zhǎng)會(huì)嚴(yán)重影響幼苗質(zhì)量,從而導(dǎo)致黃瓜產(chǎn)量及品質(zhì)的顯著下降。高溫是引起黃瓜幼苗下胚軸過(guò)度伸長(zhǎng)的主要因素之一。選育高溫下幼苗下胚軸不易伸長(zhǎng)的黃瓜新品種是減輕黃瓜幼苗高溫脅迫,保證黃瓜優(yōu)質(zhì)、高效種植的有效途徑。本研究以高溫下幼苗下胚軸伸長(zhǎng)量小的'GY2'及下胚軸伸長(zhǎng)量大的'大白'作為親本材料,配制Fl、F2分離世代。運(yùn)用主基因+多基因的聯(lián)合遺傳模型分析法研究了高溫下黃瓜下胚軸長(zhǎng)的遺傳特性;應(yīng)用高通量基因組重測(cè)序技術(shù)以及BSA生物信息分析法,對(duì)控制高溫下黃瓜幼苗下胚軸長(zhǎng)的QTL進(jìn)行了定位;利用qRT-PCR的方法對(duì)候選基因在不同高溫脅迫時(shí)間下的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行分析,篩選出可能與高溫下黃瓜幼苗下胚軸長(zhǎng)相關(guān)的候選基因。主要的研究結(jié)果如下:1.高溫下黃瓜幼苗下胚軸長(zhǎng)的遺傳符合E-0模型,即受2對(duì)加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因控制。F2分離世代中性狀的遺傳主要受主基因控制,主基因遺傳率為45.97%,多基因的遺傳率為20.53%。環(huán)境方差占總方差的比例為33.48%,表明性狀遺傳受環(huán)境條件的影響較大。2.結(jié)合BSA分析結(jié)果,在Chr.l上發(fā)現(xiàn)一個(gè)高溫下控制黃瓜下胚軸長(zhǎng)的QTL,定名為HL1.1(Hypocotyl Length)。通過(guò)擴(kuò)大遺傳群體進(jìn)行精細(xì)定位,將HL1.·1縮小至~414kb,在此區(qū)域內(nèi)共包含25個(gè)基因,其中有功能注釋的共19個(gè)基因。3.利用qRT-PCR的方法,對(duì)精細(xì)定位得到的19個(gè)候選基因在兩個(gè)親本材料'GY2'和 '大白'高溫處理0h,6h,12h,24h的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行了測(cè)定。結(jié)果表明,共10個(gè)基因(Csal G495280.1，CsalG496290.1,CsalG495290.1,CsalG497310.1,CsalG499320.1,CsaIG499330.1,CsaIG501840.1,CsalG502350.1,CsalG502360.1和Csa1G5059201)在兩組材料間的處理組(相比于CK)上調(diào)表達(dá),可能對(duì)高溫下下胚軸的生長(zhǎng)發(fā)育起重要調(diào)控作用;Csa1G505920.1和CsalG497310.和兩個(gè)基因在'GY2'高溫處理中的表達(dá)顯著高于對(duì)照,且在'大白'中處理與對(duì)照不顯著,因此,推測(cè)這兩個(gè)基因可能是調(diào)控高溫下黃瓜下胚軸伸長(zhǎng)的關(guān)鍵基因。
【圖文】：

２．３．３邋ＢＳＡ生物倌息分析方法逡逑信息分析的內(nèi)容包括：數(shù)據(jù)質(zhì)控（去除接頭和低質(zhì)量數(shù)據(jù)）、與參考基因組比對(duì)、變異逡逑檢測(cè)與注釋（ＳＮＰ、ＩｎＤｅｌ）、關(guān)聯(lián)分析、候選ＳＮＰ及候選基因的注釋。具體流程如圖３－２逡逑所示：逡逑

４．１邋ＢＳＡ結(jié)果分析逡逑分析結(jié)果如下圖所示：對(duì)經(jīng)過(guò)篩選得到的高質(zhì)量ＳＮＰ和ＩｎＤｅｌ位點(diǎn)（ｒｅａｄｓ支持度彡４），逡逑利用Ａ邋ＳＮＰ－ｉｎｄｅｘ邋（圖３－３）和ＥＤ算法（圖３－４）對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析得到相關(guān)閾值，逡逑目標(biāo)位點(diǎn)及其連鎖區(qū)域應(yīng)趨于該閾值附近。ＳＮＰ和ＩｎＤｅｌ關(guān)聯(lián)分析取交集（表３－４邋）得到總逡逑長(zhǎng)度約為１．４Ｍｂ的候選區(qū)間，，共注釋得到１６５個(gè)基因。逡逑
【學(xué)位授予單位】：揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號(hào)】：S642.2

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