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高溫脅迫下黃瓜幼苗下胚軸長遺傳分析和QTL定位

發(fā)布時間:2020-06-13 04:24
【摘要】:黃瓜(Cucuumis sativus L.)是我國重要的蔬菜作物,為我國蔬菜周年均衡生產(chǎn)和供應創(chuàng)造了巨大的經(jīng)濟效益和社會效益。黃瓜原產(chǎn)于溫暖濕潤的亞熱帶地區(qū),具有喜溫不耐熱的特性。在我國南方栽培過程中,高溫脅迫已成為限制黃瓜優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)的主要因素之一。下胚軸長是黃瓜幼苗的重要農(nóng)藝性狀之一。黃瓜苗期下胚軸過度伸長會嚴重影響幼苗質(zhì)量,從而導致黃瓜產(chǎn)量及品質(zhì)的顯著下降。高溫是引起黃瓜幼苗下胚軸過度伸長的主要因素之一。選育高溫下幼苗下胚軸不易伸長的黃瓜新品種是減輕黃瓜幼苗高溫脅迫,保證黃瓜優(yōu)質(zhì)、高效種植的有效途徑。本研究以高溫下幼苗下胚軸伸長量小的'GY2'及下胚軸伸長量大的'大白'作為親本材料,配制Fl、F2分離世代。運用主基因+多基因的聯(lián)合遺傳模型分析法研究了高溫下黃瓜下胚軸長的遺傳特性;應用高通量基因組重測序技術以及BSA生物信息分析法,對控制高溫下黃瓜幼苗下胚軸長的QTL進行了定位;利用qRT-PCR的方法對候選基因在不同高溫脅迫時間下的相對表達量進行分析,篩選出可能與高溫下黃瓜幼苗下胚軸長相關的候選基因。主要的研究結果如下:1.高溫下黃瓜幼苗下胚軸長的遺傳符合E-0模型,即受2對加性-顯性-上位性主基因+加性-顯性-上位性多基因控制。F2分離世代中性狀的遺傳主要受主基因控制,主基因遺傳率為45.97%,多基因的遺傳率為20.53%。環(huán)境方差占總方差的比例為33.48%,表明性狀遺傳受環(huán)境條件的影響較大。2.結合BSA分析結果,在Chr.l上發(fā)現(xiàn)一個高溫下控制黃瓜下胚軸長的QTL,定名為HL1.1(Hypocotyl Length)。通過擴大遺傳群體進行精細定位,將HL1.·1縮小至~414kb,在此區(qū)域內(nèi)共包含25個基因,其中有功能注釋的共19個基因。3.利用qRT-PCR的方法,對精細定位得到的19個候選基因在兩個親本材料'GY2'和 '大白'高溫處理0h,6h,12h,24h的相對表達量進行了測定。結果表明,共10個基因(Csal G495280.1,CsalG496290.1,CsalG495290.1,CsalG497310.1,CsalG499320.1,CsaIG499330.1,CsaIG501840.1,CsalG502350.1,CsalG502360.1和Csa1G5059201)在兩組材料間的處理組(相比于CK)上調(diào)表達,可能對高溫下下胚軸的生長發(fā)育起重要調(diào)控作用;Csa1G505920.1和CsalG497310.和兩個基因在'GY2'高溫處理中的表達顯著高于對照,且在'大白'中處理與對照不顯著,因此,推測這兩個基因可能是調(diào)控高溫下黃瓜下胚軸伸長的關鍵基因。
【圖文】:

流程圖,生物信息,流程圖,關聯(lián)分析


2.3.3邋BSA生物倌息分析方法逡逑信息分析的內(nèi)容包括:數(shù)據(jù)質(zhì)控(去除接頭和低質(zhì)量數(shù)據(jù))、與參考基因組比對、變異逡逑檢測與注釋(SNP、InDel)、關聯(lián)分析、候選SNP及候選基因的注釋。具體流程如圖3-2逡逑所示:逡逑

染色體,關聯(lián)值,位點,關聯(lián)性分析


4.1邋BSA結果分析逡逑分析結果如下圖所示:對經(jīng)過篩選得到的高質(zhì)量SNP和InDel位點(reads支持度彡4),逡逑利用A邋SNP-index邋(圖3-3)和ED算法(圖3-4)對測序結果進行關聯(lián)性分析得到相關閾值,逡逑目標位點及其連鎖區(qū)域應趨于該閾值附近。SNP和InDel關聯(lián)分析取交集(表3-4邋)得到總逡逑長度約為1.4Mb的候選區(qū)間,,共注釋得到165個基因。逡逑
【學位授予單位】:揚州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S642.2

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2 武s

本文編號:2710638


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