鴨梨及其芽變品種金墜梨花粉管蛋白質(zhì)組差異研究
發(fā)布時間:2020-05-20 00:59
【摘要】:梨是薔薇科植物,具有典型的配子體型自交不親和性,是亞洲及我國的重要主栽樹種之一,具有良好的經(jīng)濟(jì)價值!敖饓嬂妗笔亲越徊挥H和品種“鴨梨”的芽變品種,表現(xiàn)為自交親和性。本研究通過對金墜梨和鴨梨花粉管的蛋白質(zhì)進(jìn)行蛋白組測序,研究花粉在體外萌發(fā)條件下差異蛋白質(zhì)的表達(dá),進(jìn)而找出導(dǎo)致金墜梨自交親和的差異蛋白質(zhì),以便進(jìn)一步研究梨屬自交不親和的機(jī)理。主要研究結(jié)果如下:1、體外培養(yǎng)鴨梨和金墜梨的花粉1h后,在培養(yǎng)基內(nèi)加入鴨梨的S-RNase和金墜梨的S-RNase,發(fā)現(xiàn)均對鴨梨花粉的生長有抑制作用,但是都對金墜梨花粉的生長沒有明顯抑制作用。本實(shí)驗(yàn)以不加入任何S-RNase的處理作為對照,對照鴨梨和金墜梨花粉均生長正常。2、通過iTRAQ技術(shù)對體外培養(yǎng)4 h的鴨梨和金墜梨花粉進(jìn)行蛋白質(zhì)組測序。通過二維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜鑒定出了 306 812個二級質(zhì)譜,39 301個譜圖匹配到已知譜圖,其中38 842個譜圖匹配到唯一譜圖,共獲得肽段20 909個,唯一肽段15 788個,共鑒定出3 878個蛋白質(zhì)。本研究共篩選得到差異蛋白173個,其中上調(diào)差異蛋白93個,下調(diào)蛋白差異80個。3、泛素化途徑是降解非自我S-RNase的主要作用路線,通過對差異蛋白的分析發(fā)現(xiàn),UBP14、UPL1、UBP12等幾個泛素相關(guān)酶均在金墜梨中低表達(dá),這個結(jié)果表明,在金墜梨中,泛素化途徑受阻,影響S-RNase酶的活性,可能導(dǎo)致了自交親和。PME7、PME13、LTP3和MALD3等多個和細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn)功能相關(guān)的基因在金墜梨中豐度較高,表明金墜梨的花粉的細(xì)胞轉(zhuǎn)運(yùn)功能要比鴨梨要強(qiáng)。通過分析在差異蛋白中找到了幾個與花粉和花粉管生長密切相關(guān)的蛋白質(zhì),還發(fā)現(xiàn)了一個非常重要的 F-box 蛋白,F-box kelch-repeat protein At3g06240,此蛋白可能直接參與自交不親和作用,但功能尚需進(jìn)一步驗(yàn)證。
【圖文】:
趙憲坤:鴨梨及其芽變品種金墜梨花粉管蛋白質(zhì)組差異研宄白質(zhì)組學(xué)鑒定能力和豐富的數(shù)據(jù)處理軟件群,為提供完整的打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。本實(shí)驗(yàn)使用Maxquantl.5.1.0邋(Thermo邋Sci儀產(chǎn)生的原始圖譜文件(.mw文件)進(jìn)行數(shù)據(jù)庫檢索。根標(biāo)準(zhǔn)對數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,獲得高度可信的定性和定量結(jié)果。逡逑'
Figure邋3-6邋The邋correlation邋diagram邋of邋protein邋quantitative邋data邋(R2:邋Pearson邋correlation逡逑coefficient)逡逑圖3-6顯示了樣本金墜梨和鴨梨蛋白質(zhì)定量數(shù)據(jù)的相關(guān)性。橫坐標(biāo)表示鴨梨逡逑樣本蛋白質(zhì)的豐度,縱坐標(biāo)表示金墜梨樣本蛋白質(zhì)的豐度。在圖中可以看出,,兩逡逑個樣本大多數(shù)的蛋白質(zhì)都是相同的。在圖中,向左偏離的蛋白質(zhì)表明該蛋白質(zhì)在逡逑金墜梨中的含量高于鴨梨,向右偏離的蛋白質(zhì)表明該蛋白質(zhì)在金墜梨中的含量低逡逑于鴨梨。因此,我們篩選了其中差異倍數(shù)大于1.2(上下調(diào))且t-teStpvalue<=0.05逡逑的蛋白質(zhì)作為差異表達(dá)蛋白。我們共得到差異蛋白173個,其中上調(diào)差異蛋白逡逑93個,下調(diào)蛋白差異80個。差異倍數(shù)大于0.83、。接冢保驳牟蛔鳛椴町惐磉_(dá)蛋逡逑白討論,以盡量降低假陽性的可能性。逡逑3.5.2差異蛋白的GO富集分析逡逑對金墜梨和鴨梨兩個樣本所得到的差異蛋白進(jìn)行GO功能顯著性富集分析
【學(xué)位授予單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S661.2
本文編號:2671758
【圖文】:
趙憲坤:鴨梨及其芽變品種金墜梨花粉管蛋白質(zhì)組差異研宄白質(zhì)組學(xué)鑒定能力和豐富的數(shù)據(jù)處理軟件群,為提供完整的打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。本實(shí)驗(yàn)使用Maxquantl.5.1.0邋(Thermo邋Sci儀產(chǎn)生的原始圖譜文件(.mw文件)進(jìn)行數(shù)據(jù)庫檢索。根標(biāo)準(zhǔn)對數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選,獲得高度可信的定性和定量結(jié)果。逡逑'
Figure邋3-6邋The邋correlation邋diagram邋of邋protein邋quantitative邋data邋(R2:邋Pearson邋correlation逡逑coefficient)逡逑圖3-6顯示了樣本金墜梨和鴨梨蛋白質(zhì)定量數(shù)據(jù)的相關(guān)性。橫坐標(biāo)表示鴨梨逡逑樣本蛋白質(zhì)的豐度,縱坐標(biāo)表示金墜梨樣本蛋白質(zhì)的豐度。在圖中可以看出,,兩逡逑個樣本大多數(shù)的蛋白質(zhì)都是相同的。在圖中,向左偏離的蛋白質(zhì)表明該蛋白質(zhì)在逡逑金墜梨中的含量高于鴨梨,向右偏離的蛋白質(zhì)表明該蛋白質(zhì)在金墜梨中的含量低逡逑于鴨梨。因此,我們篩選了其中差異倍數(shù)大于1.2(上下調(diào))且t-teStpvalue<=0.05逡逑的蛋白質(zhì)作為差異表達(dá)蛋白。我們共得到差異蛋白173個,其中上調(diào)差異蛋白逡逑93個,下調(diào)蛋白差異80個。差異倍數(shù)大于0.83、。接冢保驳牟蛔鳛椴町惐磉_(dá)蛋逡逑白討論,以盡量降低假陽性的可能性。逡逑3.5.2差異蛋白的GO富集分析逡逑對金墜梨和鴨梨兩個樣本所得到的差異蛋白進(jìn)行GO功能顯著性富集分析
【學(xué)位授予單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S661.2
【參考文獻(xiàn)】
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1 吳華清;張紹鈴;吳巨友;王迎濤;吳俊;;‘金墜梨’自交親和性突變機(jī)制的初步研究[J];園藝學(xué)報;2007年02期
2 張妤艷;張紹鈴;吳俊;張瑞萍;李秀根;;八月酥等14個梨品種自交不親和基因(S基因)型的鑒定[J];果樹學(xué)報;2007年02期
3 劉平均,張振力,吳俊輕;金墜梨在晉州的栽培表現(xiàn)[J];河北果樹;1998年02期
本文編號:2671758
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