芍藥花莖木質(zhì)素特征觀察與轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2020-04-26 09:44
【摘要】:芍藥(Paeonia lactiflora Pall.)是我國的傳統(tǒng)名花,也是當前國際市場上新興的高檔切花。目前我國的芍藥切花產(chǎn)業(yè)尚處于起步階段,用于切花生產(chǎn)的品種多從傳統(tǒng)品種中篩選獲得,它們多數(shù)花莖纖細、強度不足,容易造成花頭彎曲、不挺直,嚴重影響切花品質(zhì)。因此,開展芍藥花莖強度形成機理研究對于提高芍藥切花品質(zhì)意義重大。現(xiàn)已明確木質(zhì)素是影響芍藥花莖強度形成的重要化學物質(zhì),但對于它尚缺乏系統(tǒng)深入的研究。本研究以芍藥不同花莖強度品種為材料,觀察了花莖解剖結(jié)構(gòu),分析了花莖木質(zhì)素特征的發(fā)育動態(tài)變化,并基于轉(zhuǎn)錄組測序來篩選芍藥花莖木質(zhì)素合成相關(guān)基因。主要結(jié)果如下:(1)通過對8個不同花莖強度芍藥品種的形態(tài)指標與解剖結(jié)構(gòu)觀測,發(fā)現(xiàn)莖粗與花莖強度呈極顯著正相關(guān),它們之間的花莖微觀結(jié)構(gòu)基本一致。花莖強度高的芍藥品種的維管束數(shù)量、維管束總面積、導管穿孔數(shù)、木質(zhì)部占橫切面的比值、次生細胞壁加厚的細胞層數(shù)和次生細胞壁厚度整體都高于花莖強度低的芍藥品種,并且花莖強度與維管束數(shù)量、維管束總面積、導管穿孔數(shù)、木質(zhì)部占橫切面的比值和次生細胞壁厚均存在極顯著正相關(guān)。此外,通過間苯三酚染色發(fā)現(xiàn)芍藥花莖中木質(zhì)素主要沉積在花莖次生木質(zhì)部細胞壁中,花莖強度高的芍藥品種著色面積更大、顏色更深,這與所測定的木質(zhì)素含量結(jié)果相一致。(2)通過對花莖強度高的芍藥'紅峰'和花莖強度低的芍藥'夕霞映雪'進行比較分析,發(fā)現(xiàn)它們的莖粗、花徑、花重和花莖強度等形態(tài)指標均隨植株發(fā)育不斷增大,并且'紅峰'莖粗與花莖強度一直高于'夕霞映雪'。在解剖結(jié)構(gòu)觀察和組織化學染色中發(fā)現(xiàn),'紅峰'和'夕霞映雪'花莖次生細胞壁隨植株發(fā)育不斷加厚,次生細胞壁加厚的細胞層數(shù)不斷增加,同時花莖細胞壁木質(zhì)化程度、木質(zhì)素分布范圍與數(shù)量也隨植株發(fā)育逐漸增加,并且它們在'紅峰'中均高于'夕霞映雪'。此外,2個品種的花莖木質(zhì)素含量與木質(zhì)素合成相關(guān)酶PAL、C4H、CAD和POD活性在植株發(fā)育過程中均呈上升趨勢,并且'紅峰'高于'夕霞映雪'。(3)通過FTIR和2D-HSQC對 '紅峰'和'夕霞映雪'花莖木質(zhì)素結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),它們的花莖木質(zhì)素均由G-木質(zhì)素、S-木質(zhì)素和H-木質(zhì)素3種類型組成。進一步通過HPLC定量分析發(fā)現(xiàn),2個品種的花莖木質(zhì)素主要由G-木質(zhì)素和S-木質(zhì)素構(gòu)成,并且它們在'紅峰'中含量基本都高于'夕霞映雪';而就S/G比值而言,2個品種的值隨植株發(fā)育不斷增大,并且'紅峰' S/G 比值一直高于'夕霞映雪'。(4)將'紅峰'和'夕霞映雪'盛花期花莖的混樣進行第三代全長轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得191336個Polished consensus序列,去冗余后得到113974個轉(zhuǎn)錄本,共有105382(92.46%)個Unigenes被注釋,其中在NR數(shù)據(jù)庫中注釋到103413個,在Pfam數(shù)據(jù)庫中注釋到64611個,在KOG數(shù)據(jù)庫中注釋到68273個,在Swiss-prot數(shù)據(jù)庫中注釋到90856個,在KEGG數(shù)據(jù)庫中注釋到102807個,在GO數(shù)據(jù)庫中注釋到64611個,在NT數(shù)據(jù)庫中注釋到87807個。在此基礎(chǔ)之上,將'紅峰'和'夕霞映雪' 3個發(fā)育時期花莖進行第二代轉(zhuǎn)錄組測序,每個樣品平均產(chǎn)出68.2 M有效reads,比對上芍藥參考基因集的平均比對率為80.25%。通過分別比較'紅峰'和'夕霞映雪' 3個發(fā)育時期花莖的轉(zhuǎn)錄組,在3個時期分別獲得34703、36336和34512個DEGs。(5)采用qRT-PCR技術(shù)對隨機選擇的9個DEGs表達模式進行驗證,發(fā)現(xiàn)它們在'紅峰'和'夕霞映雪3個不同發(fā)育時期花莖中的表達模式與轉(zhuǎn)錄組測序獲得的結(jié)果基本一致。在注釋到的代謝通路中,篩選到1條與木質(zhì)素合成相關(guān)的苯丙烷生物合成途徑,并且找到11 個參與木質(zhì)素合成的 DEGs,包括PAL、C3'H、HCT、F5H、CCoAMOMT、COMT、4C CCCR、C4D和POD。對11個參與木質(zhì)素合成的DEGs表達水平進行可視化展示后發(fā)現(xiàn),它們在芍藥發(fā)育花莖中的表達模式各不相同,并且同一基因不同家族成員也存在多種表達模式。本研究共篩選到表達模式與花莖木質(zhì)素含量趨勢相一致的基因家族成員有:3 個PAL、2 個 C4H、5 個4CL、2 個 1 個 C3'H、1個CCo4(OMT、3個COMT、1個CCR、5個CAD和3個POD,它們的表達水平在2個芍藥品種發(fā)育花莖中均呈上升趨勢,并且'紅峰'中表達水平均高于'夕霞映雪'。
【圖文】:
同類型的單體通過聚合形成3種不同類型的木質(zhì)素,即:由香豆醇基聚合而成的對-羥基苯逡逑基木質(zhì)素(H-木質(zhì)素)、由松柏醇基聚合而成的愈創(chuàng)木基木質(zhì)素(G-木質(zhì)素)和由芥子醇逡逑基聚合而成的紫丁香基木質(zhì)素(S-木質(zhì)素)(圖1-1)陰1。逡逑CH3OH邐CH3OH邐CH3OH逡逑rS邐0邐rS逡逑OH邐OH邐OH逡逑肉桂醇邐松柏醇邐芥子醇逡逑I邐I邐I逡逑rS邐rS逡逑OH邐OH邐OH逡逑苯羥基(H)邐愈創(chuàng)木基(G)邐紫丁香基(S)逡逑圖1-1植物木質(zhì)素的類型【35】逡逑Figure邋1-1邋The邋lignin邋types邋in邋plants逡逑在植物中,木質(zhì)素含量一般在15%?36%之間而不同類型植物中含有的3種木質(zhì)逡逑素單體含量并不相同。一般而言,,裸子植物中主要為G-木質(zhì)素,含有微量S-木質(zhì)素和少量逡逑H-木質(zhì)素;雙子葉植物中主要為G-木質(zhì)素和S-木質(zhì)素,含有極微量H-木質(zhì)素;單子葉植逡逑物(草本植物)中含有G-木質(zhì)素、S-木質(zhì)素和少量H-木質(zhì)素。對裸子植物挪威云杉研宄逡逑發(fā)現(xiàn),木質(zhì)素硫代酸解產(chǎn)物中只檢測到G-木質(zhì)素t37]。通過對雙子葉植物丹參進行研[,发辶x舷鄭牽局仕睪停櫻局仕睪扛嘰錚玻埃罰埃插澹媯椋恚錚歟綰停保福福叮村澹擼椋恚錚歟紓齲局仕睪考,辶x
本文編號:2641360
【圖文】:
同類型的單體通過聚合形成3種不同類型的木質(zhì)素,即:由香豆醇基聚合而成的對-羥基苯逡逑基木質(zhì)素(H-木質(zhì)素)、由松柏醇基聚合而成的愈創(chuàng)木基木質(zhì)素(G-木質(zhì)素)和由芥子醇逡逑基聚合而成的紫丁香基木質(zhì)素(S-木質(zhì)素)(圖1-1)陰1。逡逑CH3OH邐CH3OH邐CH3OH逡逑rS邐0邐rS逡逑OH邐OH邐OH逡逑肉桂醇邐松柏醇邐芥子醇逡逑I邐I邐I逡逑rS邐rS逡逑OH邐OH邐OH逡逑苯羥基(H)邐愈創(chuàng)木基(G)邐紫丁香基(S)逡逑圖1-1植物木質(zhì)素的類型【35】逡逑Figure邋1-1邋The邋lignin邋types邋in邋plants逡逑在植物中,木質(zhì)素含量一般在15%?36%之間而不同類型植物中含有的3種木質(zhì)逡逑素單體含量并不相同。一般而言,,裸子植物中主要為G-木質(zhì)素,含有微量S-木質(zhì)素和少量逡逑H-木質(zhì)素;雙子葉植物中主要為G-木質(zhì)素和S-木質(zhì)素,含有極微量H-木質(zhì)素;單子葉植逡逑物(草本植物)中含有G-木質(zhì)素、S-木質(zhì)素和少量H-木質(zhì)素。對裸子植物挪威云杉研宄逡逑發(fā)現(xiàn),木質(zhì)素硫代酸解產(chǎn)物中只檢測到G-木質(zhì)素t37]。通過對雙子葉植物丹參進行研[,发辶x舷鄭牽局仕睪停櫻局仕睪扛嘰錚玻埃罰埃插澹媯椋恚錚歟綰停保福福叮村澹擼椋恚錚歟紓齲局仕睪考,辶x
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