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基于SSR和ISSR梁子湖野生菰種質(zhì)資源遺傳多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2020-04-09 13:47
【摘要】:菰(Zizania latifolia)又名茭白為禾本科(Gramineae)菰屬(Zizania L.)多年生植物,在中國(guó)南至海南,北至黑龍江皆有分布。菰具有良好的抗逆性和特性常被運(yùn)用在園林造景和園林綠化上,并作為一種優(yōu)良的水稻育種選用的外源基因庫(kù)。菰根莖粗壯、易分蘗,在園林中易形成成片成片的湖岸景觀,植株能夠吸收水體中的重金屬,對(duì)環(huán)境起到修復(fù)的作用;基因具有的抗紋枯病、白葉枯病和不感稻瘟病等能力,是水稻所欠缺的優(yōu)良性狀。菰米富含豐富的營(yíng)養(yǎng),被人們用作高級(jí)的烹飪食材。當(dāng)菰莖桿受到黑粉菌感染之后,組織膨大常被當(dāng)作食用蔬菜,名稱“茭白”。梁子湖湖泊形成特殊,地形結(jié)構(gòu)獨(dú)特,生物多樣性豐富,從1955年文獻(xiàn)記載至今,長(zhǎng)期有前人對(duì)梁子湖植物群落進(jìn)行調(diào)查研究。但目前還未見(jiàn)有詳細(xì)對(duì)梁子湖野生菰資源遺傳多樣性的研究和調(diào)查。本研究對(duì)梁子湖野生菰資源進(jìn)行全面、細(xì)致的調(diào)查,以期完善梁子湖地區(qū)野生菰資源基礎(chǔ)資料,明確該地區(qū)野生菰種質(zhì)資源和遺傳多樣性的情況,根據(jù)當(dāng)?shù)匾吧苑N質(zhì)資源為保護(hù)和利用提供一定的基礎(chǔ)資料,研究結(jié)果如下:根據(jù)梁子湖地形,利用前期的文獻(xiàn)查閱、走訪等形式并結(jié)合后期實(shí)地調(diào)研采集。繞湖一圈對(duì)梁子湖野生菰資源進(jìn)行調(diào)查,從實(shí)地調(diào)查中采集了42個(gè)梁子湖野生菰居群的樣本資料,并對(duì)該地區(qū)水質(zhì)、環(huán)境、生長(zhǎng)狀況、植株大小等進(jìn)行了詳細(xì)記錄,以便之后的文字分析和描述,并結(jié)合實(shí)際情況,對(duì)今后提出了一些觀點(diǎn)和結(jié)論。利用吳國(guó)林從1113對(duì)水稻SSR標(biāo)記中篩選出19對(duì)標(biāo)記,經(jīng)過(guò)再次篩選出9對(duì)清晰、穩(wěn)定的SSR標(biāo)記對(duì)梁子湖野生菰資源進(jìn)行遺傳多樣性分析。42個(gè)野生菰居群的108個(gè)供試樣本共擴(kuò)增出71條譜帶,其中有70條表現(xiàn)為多態(tài)性帶譜,多態(tài)位點(diǎn)比率為98.59%。用Pop gene軟件分析顯示,居群間的Nei’s基因多樣性指數(shù)He=為0.336,Shannon信息指數(shù)為I*=0.506,居群間的遺傳距離范圍在0.0540~0.8226之間,平均遺傳距離為0.2674。利用MEGA軟件中的UPGMA法把42個(gè)居群分成4組,與主成分分析(PCA)結(jié)果大徑一致。從吳國(guó)林優(yōu)化和建立的ISSR標(biāo)記中選出13對(duì)清晰、穩(wěn)定的標(biāo)記對(duì)梁子湖野生菰資源進(jìn)行遺傳多樣性分析。42個(gè)野生菰居群的108個(gè)供試樣本共擴(kuò)增出72條譜帶,其中有62條表現(xiàn)為多態(tài)性帶譜,多態(tài)位點(diǎn)比率為86.1%。用Pop gene軟件分析顯示,居群間的遺傳距離范圍在0.0626~0.6272之間,平均遺傳距離為0.244,居群間的Nei’s基因多樣性指數(shù)He=為0.2963,Shannon信息指數(shù)為I*=0.4449。利用MEGA軟件中的UPGMA法42個(gè)居群分成4組,與主成分分析(PCA)結(jié)果大徑一致。利用SSR和ISSR數(shù)據(jù)比較后,兩個(gè)標(biāo)記在信息量檢測(cè)中顯示,SSR標(biāo)記的多態(tài)位點(diǎn)比率高出ISSR標(biāo)記多態(tài)位點(diǎn)比率12.49%,SSR標(biāo)記比ISSR標(biāo)記有較高的分析效率。兩個(gè)標(biāo)記在遺傳距離和遺傳相似系數(shù)的比較中,從遺傳距離和相似系數(shù)等參數(shù)分析中表明,SSR和ISSR二種標(biāo)記得出的結(jié)果非常相近。兩個(gè)標(biāo)記在AMOVA分子變異分析中均表明梁子湖野生菰種群變異發(fā)生在居群內(nèi)。兩個(gè)標(biāo)記在聚類分析結(jié)果中,均將42個(gè)野生菰居群分為4大類,42份種質(zhì)資源中有33份重合在相應(yīng)的類別上,重合率為78.57%。
【圖文】:

地理分布圖,梁子湖,居群,流域


14圖 2-1 梁子湖流域 42 個(gè)野生菰居群地理分布圖ographical distribution of 42 Zizania latifolia populations in L表 2-1 梁子湖野生菰供試材料地理信息Tab.2-1 Geographic information of Zizania latifolia material(縣) 區(qū)(鎮(zhèn)) 地點(diǎn) 經(jīng)度 緯度武漢市 五里界鎮(zhèn) 曠林咀 114°35′18.49″ 30°17′50武漢市 五里界鎮(zhèn) 老屋下 114°32′34.21″ 30°18′16

擴(kuò)增圖譜,引物,遺傳多樣性分析


圖 3-1 引物 RM16797 對(duì) 36 份菰種質(zhì)的 SSR-PCR 擴(kuò)增圖譜Fig.3-1 SSR -PCR amplification of 36 Zizania. latifolia individuals using primer RM16797圖 3-2 引物 RM22832 對(duì) 36 份菰種質(zhì)的 SSR-PCR 擴(kuò)增圖譜Fig.3-2 SSR -PCR amplification of 36 Zizania. latifolia individuals using primer RM228323.2.2 遺傳多樣性分析
【學(xué)位授予單位】:江西財(cái)經(jīng)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S645.2

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2620829

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