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基于SSR標記的四川棗親緣關系及群體遺傳結構分析

發(fā)布時間:2020-04-09 12:59
【摘要】:棗(Ziziphus jujuba Mill.)是原產于我國的鼠李科(Rhamnaceae)棗屬(Ziziphus)植物。棗適應性強,豐產性好,果實營養(yǎng)價值和藥用價值高,是我國重要的果樹。我國棗種質資源豐富,分布廣泛。北方地區(qū)是制干、鮮食(廣溫型、耐寒型)和兼用棗種質主要分布區(qū),南方地區(qū)是我國高溫型或高溫高濕型鮮食棗資源的主要分布區(qū)。目前棗的研究報道多集中于我國北方棗種質,對南方棗種質的研究鮮有報道。本研究利用SSR分子標記方法對四川省棗種質資源進行親緣關系、遺傳多樣性和群體遺傳結構分析,為我國南方棗種質資源的有效利用奠定基礎。主要研究結果如下:1.15對引物的多態(tài)位點百分率達100%,多態(tài)信息含量(PIC)在0.3557-0.8200之間(平均值為0.6677),均為中度或高度多態(tài)性信息引物,適合用于33個棗栽培品種(系)的親緣關系分析。2.對33個棗栽培品種(系)的遺傳多樣性分析顯示,15對引物共得到111個等位基因(Na),等位基因數在2-14之間,平均值為7.4,期望雜合度(He)和觀測雜合度(Ho)分別在0.463-0.839和0.364-0.848之間,平均值分別為0.711和0.624,香農信息指數(I)在0.655-2.089之間,平均值為1.509,表明33個棗栽培品種(系)遺傳多樣性豐富。3.UPGMA聚類可將33個棗品種(系)中的30個完全區(qū)分開。沾冬2號、冬棗和蜀脆棗親緣關系近,羅江調元棗、龍泉油棗、岐山米棗、長秋米棗四者屬同物異名。武隆豬腰棗與其他棗品種(系)遺傳關系遠。4.21對引物在297份棗種質中的擴增結果除JSSR93(PIC=0.0772)和JSSR198(PIC=0.0421)外,PIC變幅在0.2576-0.8410之間(平均值為0.5284),為中度或高度多態(tài)性引物,適用于棗種質群體遺傳結構分析。5.21對引物對297份棗種質的遺傳多樣性分析顯示,297份棗種質的I變幅為0.111-1.908,平均值為1.142,He變幅為0.043-0.835,平均為0.578,遺傳多樣性水平中等。6.STRUCTURE分析和NJ聚類可將9個棗品種群分為四大類,嶄山米棗1號、嶄山蘋果棗和嶄山大果棗群體為第一大類群;羅江調元棗、龍泉油棗、岐山米棗、長秋米棗群體為第二大類群;汶川小棗群體為第三大類群;蜀脆棗群體為第四大類群7.分子變異分析(AMOVE)和主成分分析(PCA)表明,四川棗群體間存在高度的遺傳分化,基因流小(G'st=0.521,Nm=0.432)。
【圖文】:

棗品種,DNA瓊脂糖凝膠電泳


圖 1 部分棗品種 DNA 瓊脂糖凝膠電泳檢測圖Fig.1 Electrophoretic product of DNA of some jujube cultivars.2 引物篩選及多態(tài)性分析.2.1 引物篩選利用羅江調元棗、嶄山米棗 1 號、蜂蜜罐和冬棗(見附錄)四個棗栽培品種的組 DNA 從 135 對 SSR 引物中篩選出帶型質量高、擴增結果穩(wěn)定且在各個樣品中呈現出多態(tài)性的引物用于 PCR 擴增。分別篩選出了 15 對引物(表 3)用于 33川棗栽培品種(系)的親緣關系研究和 21 對引物(表 4)用于 297 份四川棗種遺傳多樣性和群體遺傳結構分析。

引物,多態(tài)性信息含量,親緣關系分析,遺傳多樣性分析


圖 2 引物 JSSR131(A)、BFU0581(B)對 33 個棗栽培品種(系)的擴增結果Fig. 2 Amplification result of primer JSSR131(A) and BFU0581(B) on 33 cultivars (strains) of jujube21 對引物在 297 份材料中共得到 165 個等位基因,各個位點的等位基因數在 3-13之間,多態(tài)性信息含量(PIC)變幅在 0.2576-0.8410 之間,平均值為 0.5284(表 6),以上數據表明所選引物多態(tài)性高。引物的哈迪-溫伯格平衡及其顯著性檢測結果表明,除 JSSR198 外其他引物在 P<0.001 時都極顯著偏離哈迪-溫伯格平衡,其中偏離程度最小的為 JSSR128,偏離程度最大的為 Zjuju021。3.3 四川棗栽培品種(系)親緣關系分析3.3.1 遺傳多樣性分析本試驗對采自四川省的 33 個棗栽培品種(系)進行了遺傳多樣性評價。平均每
【學位授予單位】:四川農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S665.1

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本文編號:2620786

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