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基于SSR標(biāo)記的四川棗親緣關(guān)系及群體遺傳結(jié)構(gòu)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-04-09 12:59
【摘要】:棗(Ziziphus jujuba Mill.)是原產(chǎn)于我國(guó)的鼠李科(Rhamnaceae)棗屬(Ziziphus)植物。棗適應(yīng)性強(qiáng),豐產(chǎn)性好,果實(shí)營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和藥用價(jià)值高,是我國(guó)重要的果樹(shù)。我國(guó)棗種質(zhì)資源豐富,分布廣泛。北方地區(qū)是制干、鮮食(廣溫型、耐寒型)和兼用棗種質(zhì)主要分布區(qū),南方地區(qū)是我國(guó)高溫型或高溫高濕型鮮食棗資源的主要分布區(qū)。目前棗的研究報(bào)道多集中于我國(guó)北方棗種質(zhì),對(duì)南方棗種質(zhì)的研究鮮有報(bào)道。本研究利用SSR分子標(biāo)記方法對(duì)四川省棗種質(zhì)資源進(jìn)行親緣關(guān)系、遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析,為我國(guó)南方棗種質(zhì)資源的有效利用奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.15對(duì)引物的多態(tài)位點(diǎn)百分率達(dá)100%,多態(tài)信息含量(PIC)在0.3557-0.8200之間(平均值為0.6677),均為中度或高度多態(tài)性信息引物,適合用于33個(gè)棗栽培品種(系)的親緣關(guān)系分析。2.對(duì)33個(gè)棗栽培品種(系)的遺傳多樣性分析顯示,15對(duì)引物共得到111個(gè)等位基因(Na),等位基因數(shù)在2-14之間,平均值為7.4,期望雜合度(He)和觀測(cè)雜合度(Ho)分別在0.463-0.839和0.364-0.848之間,平均值分別為0.711和0.624,香農(nóng)信息指數(shù)(I)在0.655-2.089之間,平均值為1.509,表明33個(gè)棗栽培品種(系)遺傳多樣性豐富。3.UPGMA聚類可將33個(gè)棗品種(系)中的30個(gè)完全區(qū)分開(kāi)。沾冬2號(hào)、冬棗和蜀脆棗親緣關(guān)系近,羅江調(diào)元棗、龍泉油棗、岐山米棗、長(zhǎng)秋米棗四者屬同物異名。武隆豬腰棗與其他棗品種(系)遺傳關(guān)系遠(yuǎn)。4.21對(duì)引物在297份棗種質(zhì)中的擴(kuò)增結(jié)果除JSSR93(PIC=0.0772)和JSSR198(PIC=0.0421)外,PIC變幅在0.2576-0.8410之間(平均值為0.5284),為中度或高度多態(tài)性引物,適用于棗種質(zhì)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。5.21對(duì)引物對(duì)297份棗種質(zhì)的遺傳多樣性分析顯示,297份棗種質(zhì)的I變幅為0.111-1.908,平均值為1.142,He變幅為0.043-0.835,平均為0.578,遺傳多樣性水平中等。6.STRUCTURE分析和NJ聚類可將9個(gè)棗品種群分為四大類,嶄山米棗1號(hào)、嶄山蘋果棗和嶄山大果棗群體為第一大類群;羅江調(diào)元棗、龍泉油棗、岐山米棗、長(zhǎng)秋米棗群體為第二大類群;汶川小棗群體為第三大類群;蜀脆棗群體為第四大類群7.分子變異分析(AMOVE)和主成分分析(PCA)表明,四川棗群體間存在高度的遺傳分化,基因流小(G'st=0.521,Nm=0.432)。
【圖文】:

棗品種,DNA瓊脂糖凝膠電泳


圖 1 部分棗品種 DNA 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)圖Fig.1 Electrophoretic product of DNA of some jujube cultivars.2 引物篩選及多態(tài)性分析.2.1 引物篩選利用羅江調(diào)元棗、嶄山米棗 1 號(hào)、蜂蜜罐和冬棗(見(jiàn)附錄)四個(gè)棗栽培品種的組 DNA 從 135 對(duì) SSR 引物中篩選出帶型質(zhì)量高、擴(kuò)增結(jié)果穩(wěn)定且在各個(gè)樣品中呈現(xiàn)出多態(tài)性的引物用于 PCR 擴(kuò)增。分別篩選出了 15 對(duì)引物(表 3)用于 33川棗栽培品種(系)的親緣關(guān)系研究和 21 對(duì)引物(表 4)用于 297 份四川棗種遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。

引物,多態(tài)性信息含量,親緣關(guān)系分析,遺傳多樣性分析


圖 2 引物 JSSR131(A)、BFU0581(B)對(duì) 33 個(gè)棗栽培品種(系)的擴(kuò)增結(jié)果Fig. 2 Amplification result of primer JSSR131(A) and BFU0581(B) on 33 cultivars (strains) of jujube21 對(duì)引物在 297 份材料中共得到 165 個(gè)等位基因,各個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)在 3-13之間,多態(tài)性信息含量(PIC)變幅在 0.2576-0.8410 之間,平均值為 0.5284(表 6),以上數(shù)據(jù)表明所選引物多態(tài)性高。引物的哈迪-溫伯格平衡及其顯著性檢測(cè)結(jié)果表明,除 JSSR198 外其他引物在 P<0.001 時(shí)都極顯著偏離哈迪-溫伯格平衡,其中偏離程度最小的為 JSSR128,偏離程度最大的為 Zjuju021。3.3 四川棗栽培品種(系)親緣關(guān)系分析3.3.1 遺傳多樣性分析本試驗(yàn)對(duì)采自四川省的 33 個(gè)棗栽培品種(系)進(jìn)行了遺傳多樣性評(píng)價(jià)。平均每
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S665.1

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本文編號(hào):2620786

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