基于SSR、SRAP標(biāo)記的榛屬種質(zhì)資源遺傳多樣性及親緣關(guān)系分析
【圖文】:
1%瓊脂糖凝膠電泳檢測時,條帶明亮程度反映總DNA的濃度,條帶越亮DNA濃度越高。根據(jù)電泳槽干凈與否,條帶有無拖尾,是否有RNA條帶,條帶清晰程度來判斷DNA的質(zhì)量,若點樣孔無殘留,條帶明亮,且完整清晰,,無拖尾,無雜帶,表示此DNA可備選用。用紫外分光光度計檢測DNA濃度及純度時,依據(jù)OD260/OD280的比值評判DNA質(zhì)量;當(dāng)OD260/OD280<1.6時,說明DNA溶液中有多糖、蛋白質(zhì)等雜質(zhì),OD260/OD280>1.9時,說明樣品中存在RNA等雜質(zhì)。OD260 /OD280 范圍在1.7~1.8之間的DNA溶液可備用(楊曉旭,2017)。3.2 SSR 引物及最佳退火溫度篩選結(jié)果3.2.1 SSR 引物篩選篩選引物的原則首先是引物擴增條帶清晰且能分清主條帶,其次是條帶具有多態(tài)性。從圖 1 中可以看出 1 號、2 號、3 號、5 號、7 號、8 號、9 號、10 號、11 號引物主條帶清晰且多態(tài)性好,個別有雜帶拖帶現(xiàn)象,但可以通過調(diào)節(jié)退火溫度得到改善。4 號、6號引物雖然多態(tài)性單一但條帶清晰,無雜帶可暫時選用,若在種群擴增多態(tài)性差時再棄之。12 號引物條帶不清晰棄之不用。
3 結(jié)果與分析選定前三個濃度(0.1U、0.15U、0.2U)為 Taq DNA 聚合酶基礎(chǔ)濃度;引物濃度在前兩個濃度時條帶較模糊,從第三個濃度開始條帶清晰,所以選擇 0.6μmol/L、0.8μmol/L、1.0μmol/L 作為基礎(chǔ)濃度;Mg2+濃度篩選中前四個濃度的條帶除第 2 濃度條帶模糊,其它 3 個濃度的條帶清晰,所以選定前三個濃度(0.5mmol/L、1.0mmol/L、1.5mmol/L)為基礎(chǔ)濃度。
【學(xué)位授予單位】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S664.4
【相似文獻】
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本文編號:2608895
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