基于SSR、SRAP標(biāo)記的榛屬種質(zhì)資源遺傳多樣性及親緣關(guān)系分析
【圖文】:
1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)時(shí),條帶明亮程度反映總DNA的濃度,條帶越亮DNA濃度越高。根據(jù)電泳槽干凈與否,條帶有無(wú)拖尾,是否有RNA條帶,條帶清晰程度來(lái)判斷DNA的質(zhì)量,若點(diǎn)樣孔無(wú)殘留,條帶明亮,且完整清晰,,無(wú)拖尾,無(wú)雜帶,表示此DNA可備選用。用紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA濃度及純度時(shí),依據(jù)OD260/OD280的比值評(píng)判DNA質(zhì)量;當(dāng)OD260/OD280<1.6時(shí),說(shuō)明DNA溶液中有多糖、蛋白質(zhì)等雜質(zhì),OD260/OD280>1.9時(shí),說(shuō)明樣品中存在RNA等雜質(zhì)。OD260 /OD280 范圍在1.7~1.8之間的DNA溶液可備用(楊曉旭,2017)。3.2 SSR 引物及最佳退火溫度篩選結(jié)果3.2.1 SSR 引物篩選篩選引物的原則首先是引物擴(kuò)增條帶清晰且能分清主條帶,其次是條帶具有多態(tài)性。從圖 1 中可以看出 1 號(hào)、2 號(hào)、3 號(hào)、5 號(hào)、7 號(hào)、8 號(hào)、9 號(hào)、10 號(hào)、11 號(hào)引物主條帶清晰且多態(tài)性好,個(gè)別有雜帶拖帶現(xiàn)象,但可以通過(guò)調(diào)節(jié)退火溫度得到改善。4 號(hào)、6號(hào)引物雖然多態(tài)性單一但條帶清晰,無(wú)雜帶可暫時(shí)選用,若在種群擴(kuò)增多態(tài)性差時(shí)再棄之。12 號(hào)引物條帶不清晰棄之不用。
3 結(jié)果與分析選定前三個(gè)濃度(0.1U、0.15U、0.2U)為 Taq DNA 聚合酶基礎(chǔ)濃度;引物濃度在前兩個(gè)濃度時(shí)條帶較模糊,從第三個(gè)濃度開始條帶清晰,所以選擇 0.6μmol/L、0.8μmol/L、1.0μmol/L 作為基礎(chǔ)濃度;Mg2+濃度篩選中前四個(gè)濃度的條帶除第 2 濃度條帶模糊,其它 3 個(gè)濃度的條帶清晰,所以選定前三個(gè)濃度(0.5mmol/L、1.0mmol/L、1.5mmol/L)為基礎(chǔ)濃度。
【學(xué)位授予單位】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S664.4
【相似文獻(xiàn)】
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3 李京t
本文編號(hào):2608895
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