長牡蠣又稱太平洋牡蠣，屬軟體動物門、瓣鰓綱、珍珠貝目、牡蠣科、巨蠣屬，廣泛分布于中國，韓國和日本的沿海，是一種廣溫、廣鹽性的內(nèi)灣貝類。它是世界上最重要的海水養(yǎng)殖貝類之一，也是我國目前重要的海水養(yǎng)殖主導種類。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms, SNP)是當前最具潛力的分子遺傳標記，遍布整個基因組，具有密度高，共顯性，能穩(wěn)定遺傳且易自動化檢測的優(yōu)點,是研究遺傳學和基因組學的理想分子標記。目前，利用EST數(shù)據(jù)庫來進行突變位點的篩查是開發(fā)SNP標記的重要途徑。高分辨率熔解曲線(Highresolution melting, HRM)是一種高效的突變篩查與基因分型技術，具有簡單、精確及低成本等特點。本研究利用HRM技術開發(fā)長牡蠣EST-SNP標記，并對SNP在家系分析和物種鑒定中的應用進行了探討，為今后牡蠣的高密度遺傳圖譜構建，種群結構分析，生物多樣性保護和分子標記輔助育種等遺傳學研究提供了基礎資料。 1.長牡蠣SNP標記的開發(fā) 通過檢索EST序列庫，經(jīng)過進一步的人工比對篩選，得到5781個EST簇和48796個候選SNP位點。隨機挑選150個...

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-1PCR反應程序Figure2-1TheprotocolofPCR

引物用于下一步的HRM分析。反應采用10μl體系，具體見表2-1，PCR反應程序如下圖2-1。表2-1PCR反應體系Table2-1ThestockforPCR成分體積（μl）10×PCRbuffer1MgCl20.6dNTP0.8Taq....

圖2-2HRM反應程序Figure2-2TheprotocolofHRM

19圖2-2HRM反應程序Figure2-2TheprotocolofHRM擴增結束后，程序自動運行高分辨率熔解曲線程序，設定軟件收集60℃—95℃之間的數(shù)據(jù)，每升高1℃采集熒光25次，升溫速率設定為0.1℃/S，以滿足對單堿基差異的區(qū)分。采集數(shù)據(jù)在L....

圖2藍色2-3.SNP位點色曲線代表純點jy06（T/A純合體，表示）經(jīng)對數(shù)轉換示該擴增序列

圖2藍色Fig2jy02-3.SNP位點色曲線代表純2-3Normaliz06showingtwnoSNP;red點jy06（T/A純合體，表示zedandshiftewodifferentpcurvesrepre）經(jīng)對數(shù)轉換示該擴增序列增序edh....

圖2藍色2-4SNP位點色和綠色曲線

圖2藍色Fig2jy02-3.SNP位點色曲線代表純2-3Normaliz06showingtwnoSNP;red點jy06（T/A純合體，表示zedandshiftewodifferentpcurvesrepre）經(jīng)對數(shù)轉換示該擴增序列增序edh....

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