天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

龍須菜四分孢子體發(fā)育過程的WGCNA分析

發(fā)布時間:2024-06-27 23:14
  龍須菜是一種重要的產(chǎn)瓊膠海藻,對其繁殖發(fā)育的研究將有助于了解龍須菜的生長,有助于育種。本研究對龍須菜不同育性品系(981和魯龍1號)在不同發(fā)育階段的表達(dá)譜數(shù)據(jù),采用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)方法構(gòu)建基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),共獲得32個模塊。其中,模塊最大基因數(shù)量為2 577個,最小基因數(shù)為66個。經(jīng)過篩選發(fā)現(xiàn)與品系相關(guān)的模塊(以0.7為閾值)共5個,涉及基因共2 301個,對模塊基因進(jìn)行GO功能富集分析,結(jié)果表明主要富集以下功能上:信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)胞分化、翻譯、細(xì)胞穩(wěn)態(tài)、生物合成過程等。981品系與魯龍1號品系的富集結(jié)果對比表明981品系在孢子放散過程中生物活性不高,生物合成水平較低,內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài)較差。經(jīng)過KEGG富集,篩選到21個與981品系II期四分孢子形成相關(guān)的備選基因,主要富集到DNA復(fù)制和染色體形態(tài)變化等與細(xì)胞周期相關(guān)的功能上,表明981品系在孢子形成時期的細(xì)胞分裂可能出現(xiàn)異常。本文結(jié)果為進(jìn)一步深入揭示龍須菜四分孢子體發(fā)育分子調(diào)控機(jī)制提供思路和導(dǎo)向。

【文章頁數(shù)】:15 頁

【部分圖文】:

圖1龍須菜轉(zhuǎn)錄本KEGG代謝通路注釋(A)與GO注釋(B)二級分類統(tǒng)計

圖1龍須菜轉(zhuǎn)錄本KEGG代謝通路注釋(A)與GO注釋(B)二級分類統(tǒng)計

對18個樣品的差異表達(dá)基因的表達(dá)矩陣進(jìn)行提取后聚類。初步聚類分析后,為確保分析結(jié)果的嚴(yán)謹(jǐn)和可靠性,確定采納具有較高相關(guān)性的樣品,去除皮爾遜相關(guān)系數(shù)小于0.95的樣品,每個取樣階段保留2個生物學(xué)平行。對樣品之間相關(guān)性進(jìn)行統(tǒng)計見圖2,除981.IV組樣品,相關(guān)性為0.89。其他樣品相....


圖1龍須菜轉(zhuǎn)錄本KEGG代謝通路注釋(A)與GO注釋(B)二級分類統(tǒng)計

圖1龍須菜轉(zhuǎn)錄本KEGG代謝通路注釋(A)與GO注釋(B)二級分類統(tǒng)計

圖1龍須菜轉(zhuǎn)錄本KEGG代謝通路注釋(A)與GO注釋(B)二級分類統(tǒng)計將構(gòu)建好的樣品FPKM表達(dá)矩陣導(dǎo)入WGCNA軟件包,進(jìn)行g(shù)sg數(shù)據(jù)過濾,共去除857個數(shù)據(jù)不良的基因,剩余12569個基因進(jìn)行后續(xù)分析。


圖26組龍須菜樣品相關(guān)性分析

圖26組龍須菜樣品相關(guān)性分析

將構(gòu)建好的樣品FPKM表達(dá)矩陣導(dǎo)入WGCNA軟件包,進(jìn)行g(shù)sg數(shù)據(jù)過濾,共去除857個數(shù)據(jù)不良的基因,剩余12569個基因進(jìn)行后續(xù)分析。2.2基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建


圖3WGCNA基因?qū)哟尉垲悩浜湍K構(gòu)建(A)及模塊與特征相關(guān)性分析(B)

圖3WGCNA基因?qū)哟尉垲悩浜湍K構(gòu)建(A)及模塊與特征相關(guān)性分析(B)

將3個模塊內(nèi)的基因進(jìn)行KEGG代謝通路富集(見圖8)。3個模塊中均有富集到CellularProcesses相關(guān)的代謝通路,如Magenta模塊富集到溶酶體(Lysosome)(ko04142,P=0.006899873)和干細(xì)胞全能型調(diào)節(jié)信號通路(Signalingpa....



本文編號:3996082

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3996082.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶5cf42***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要刪除請E-mail郵箱bigeng88@qq.com
亚洲伦理中文字幕在线观看| 欧美91精品国产自产| 久久中文字人妻熟女小妇| 国产熟女一区二区三区四区| 老鸭窝精彩从这里蔓延| 少妇人妻无一区二区三区| 亚洲精选91福利在线观看| 色综合久久超碰色婷婷| 老司机精品视频在线免费看| a久久天堂国产毛片精品| 亚洲天堂男人在线观看| 手机在线不卡国产视频| 亚洲精品国产福利在线| 日韩精品一区二区三区四区| 午夜精品久久久免费视频 | 香蕉尹人视频在线精品| 欧美不卡高清一区二区三区| 最近日韩在线免费黄片| 日本深夜福利在线播放| 国内精品偷拍视频久久| 老鸭窝精彩从这里蔓延| 欧美极品欧美精品欧美| 国产亚洲精品一二三区| 欧美精品一区二区水蜜桃| 少妇成人精品一区二区| 一区二区不卡免费观看免费| 日韩精品你懂的在线观看| 精品熟女少妇av免费久久野外| 亚洲精品蜜桃在线观看| 国产精品不卡一区二区三区四区| 欧美自拍偷自拍亚洲精品| 亚洲av熟女国产一区二区三区站 | 精品久久av一二三区| 亚洲国产精品久久琪琪| 国产又大又硬又粗又黄| 1024你懂的在线视频| 日韩黄色大片免费在线| 亚洲中文字幕高清乱码毛片| 欧美尤物在线视频91| 国产又色又粗又黄又爽| 玩弄人妻少妇一区二区桃花|