浙南壇紫菜實驗品系與傳統(tǒng)品系遺傳多樣性的AFLP分析
發(fā)布時間:2024-05-22 02:04
本研究利用擴增片段長度多態(tài)性(AFLP)分子標(biāo)記技術(shù)從基因組DNA水平上分析壇紫菜新品系浙南3號(ZN3)和浙江主要壇紫菜栽培品系(YH)的遺傳差異,從16對選擇性擴增引物中篩選出8對擴增效果好的引物,并用這8對引物對YH和ZN3 2個壇紫菜群體進行分析。結(jié)果顯示,60個壇紫菜個體中共檢測到964個有效位點,其中多態(tài)位點955個;壇紫菜2個群體整體水平上的多態(tài)位點百分率(PPL)為99.1%,2個群體各自的多態(tài)位點百分率分別是69.0%和81.5%,均值為75.3%。2個壇紫菜群體的Nei’s遺傳多樣性指數(shù)(H)為0.153 3和0.202 3,Shannon’s信息指數(shù)(I)為0.247 8和0.324 1,2個壇紫菜群體的總遺傳變異(Ht)和群體內(nèi)遺傳變異(Hs)分別為0.240 2和0.177 8,群體間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.252 6,即群體間遺傳變異占總變異的25.3%,群體內(nèi)遺傳變異占總變異的74.7%,表明不同品系的群體間遺傳分化程度較低。2個壇紫菜群體間基因流動系數(shù)(Nm)為1...
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本文編號:3980238
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圖1壇紫菜部分AFLP選擇性擴增結(jié)果
用16對引物組合對壇紫菜樣品進行擴增,共篩選出以下8對多態(tài)性好的引物組合:E-AAC/M-CAG、E-AAC/M-CTC、E-AAC/M-CTG、E-AAG/M-CAG、E-AAG/M-CTC、E-AAG/M-CTG、E-AGG/M-CAA、E-ACC/M-CTG。用篩選出的8對....
圖2基于遺傳距離的壇紫菜UPGMA(A)和NJ(B)聚類樹
表4群體間遺傳相似度和遺傳距離群體ZN3YHZN30.4111YH0.8890注:對角線上為遺傳相似度;對角線下為遺傳距離。3討論
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