尼羅羅非魚p38MAPK基因克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時間:2024-05-13 19:41
為了探究p38MAPK與尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)免疫功能的相關(guān)性,本實(shí)驗(yàn)運(yùn)用cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(rapid amplification of cDNA ends,RACE)獲得尼羅羅非魚埃及品系ntp38MAPK的cDNA全長序列,結(jié)果顯示,該序列全長1 789 bp,開放閱讀框(Open Reading Frame,ORF)長1 086 bp,5′非編碼區(qū)(Untranslated Region,UTR)長342 bp,3′UTR為361 bp。ORF編碼361個氨基酸,預(yù)測分子量為41.598 kD,理論等電點(diǎn)為5.10。序列含有p38家族典型保守的Thr-Gly-Tyr(TGY)雙磷酸化位點(diǎn)以及緊密相連的底物結(jié)合位點(diǎn)Ala-Thr-Arg-Trp(ATRW)。同源性以及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,尼羅羅非魚的p38MAPK與大黃魚(Larimichthys crocea)和鱸(Dicentrarchus labrax)的相似性最高。采用qRT-PCR的方法研究了ntp38MAPK在各組織以及無乳鏈球菌感染過程中的表達(dá)差異情況,結(jié)果顯示,ntp38...
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 總RNA的提取及cDNA第一鏈的合成
1.2.2 尼羅羅非魚p38MAPK基因的cDNA克隆
1.2.3 序列分析
1.2.4 ntp38MAPK基因的組織表達(dá)分析
1.2.5 ntp38MAPK基因鏈球菌感染后的表達(dá)分析
1.2.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 ntp38MAPK基因cDNA的克隆及序列分析
2.2 同源性分析
2.3 ntp38MAPK基因的組織表達(dá)分析
2.4 無乳鏈球菌感染后ntp38MAPK表達(dá)分析
3 討論
本文編號:3972615
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1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 總RNA的提取及cDNA第一鏈的合成
1.2.2 尼羅羅非魚p38MAPK基因的cDNA克隆
1.2.3 序列分析
1.2.4 ntp38MAPK基因的組織表達(dá)分析
1.2.5 ntp38MAPK基因鏈球菌感染后的表達(dá)分析
1.2.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 ntp38MAPK基因cDNA的克隆及序列分析
2.2 同源性分析
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