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里氏擬石磺與平疣桑椹石磺群體遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)分析

發(fā)布時間:2024-04-23 22:53
  石磺科(Onchidiidae)屬軟體動物門(Mollusca),腹足綱(Gastropoda),有肺亞綱(Pulmonata),縮眼目(Systellommatophora),為棲息于灘涂及紅樹林地區(qū)的一群潮間帶和潮上帶貝類,廣泛分布于除極地外的世界各地,包含100多個物種。本論文采用線粒體16S rDNA和細胞色素c氧化酶亞基I(Cytochromeoxidase subunit I,CO I)基因分析了里氏擬石磺和平疣桑椹石磺的群體遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu),并對其群體分化,遺傳結(jié)構(gòu)的產(chǎn)生原因進行了推斷。 本論文的實驗結(jié)果如下: 1、采集中國沿海及泰國普吉島里氏擬石磺共187個個體,其中廣東湛江(ZJ)=30、廣西東興(DX)=28、北海(BH)=30、浙江蒼南(CN)=31、福建寧德(ND)=10和海南東寨港(HN)=18、海南文昌(WC)=23、泰國普吉島(TH)=17。對其16S rDNA比對剪接獲得一個372bp的同源序列,包括變異位點56個,其中單變異位點40個,簡約信息位點16個。群體平均的T、C、A、G堿基含量分別為30.7%、16.2%、30.0%和23.1%,A+T含...

【文章頁數(shù)】:76 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1部分里氏擬石磺群體16SrDNA序列擴增電泳圖

圖2-1部分里氏擬石磺群體16SrDNA序列擴增電泳圖

13圖2-1部分里氏擬石磺群體16SrDNA序列擴增電泳圖Fig.2-1Amplifiedproductsofmitochondrial16SrDNAofParaoncidiumreev


圖2-2兩組里氏擬石磺群體的IBD分析

圖2-2兩組里氏擬石磺群體的IBD分析

2-2兩組里氏擬石磺群體的IBD分析。(左)中國沿海群體(除去TH);(右)所DplotsfortwogroupingsofParaoncidiumreevesiipopulations.(Left)Chinesepopula(Right)The....


圖2-3里氏擬石磺16SrDNA序列的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖

圖2-3里氏擬石磺16SrDNA序列的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖

17圖2-3里氏擬石磺16SrDNA序列的單倍型網(wǎng)絡(luò)圖etworkofallmtDNA16SrDNAsequenceshaplotypesofParaoncidiumreevesiip


圖3-1里氏擬石磺的COI基因部分片段序列擴增產(chǎn)物電泳圖

圖3-1里氏擬石磺的COI基因部分片段序列擴增產(chǎn)物電泳圖

利用軟件Arlequin3.5中的分子方差分析內(nèi)的遺傳分化及Fst值。SAMOVA1.0[59]軟件對群體遺分析方法同第二章1.3。OI基因部分序列擴增結(jié)果COI1490和HCOI2198擴增基因組DNA,PCR產(chǎn)物顯示,在約700bp位置處....



本文編號:3962871

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